| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 297 (0.670) | 16 (0.040) | 6/94 | NT | 5.5% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 296 (0.790) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 545 total aligned reads displayed.
AGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657553‑2657686 | aagcatgCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA < 1:13301085‑M1/65‑1 (MQ=255)aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:27637040‑M1/1‑68 (MQ=255)aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA < 1:28490243‑M1/68‑1 (MQ=255)aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:33935757‑M1/1‑68 (MQ=255) gCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat > 1:31479571/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:36435885/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:12383487/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:6298199/1‑68 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:35966570/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:33310513/66‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:25657399/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:4341924/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:18538470/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:34413536/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:12593593/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:7567941/68‑1 (MQ=255) tGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtc > 1:16493605‑M2/1‑66 (MQ=255) ggCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtca > 1:14001314‑M2/1‑65 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac > 1:36888011‑M2/1‑63 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:35083931‑M2/67‑5 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg > 1:6598582‑M2/1‑60 (MQ=255) cATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcc > 1:37115528‑M2/1‑59 (MQ=255) aTGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc < 1:19328069‑M2/66‑9 (MQ=255) tGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGccc > 1:31096282/1‑67 (MQ=255) tGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCt < 1:7506682/68‑1 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:24472938‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:15178262‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:35564888‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCg < 1:1450543/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:15051867/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:28790761/67‑1 (MQ=255) aGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCa > 1:33812412/1‑68 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:15412347/68‑1 (MQ=255) cagCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgc > 1:31825947‑M2/2‑44 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:30293352‑M2/1‑44 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:35751690‑M2/1‑44 (MQ=255) aGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc > 1:26316459/1‑66 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:18885945/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:22940382/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:10096907/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgcgtcattaacgcgtca > 1:3220441‑M1/1‑34 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:5139701/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:33087601/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:33679421/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:29283172/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:2317204/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:9481528/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:21635954/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:3871326/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:4469983/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:19616680/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:830778/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:7980186/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:16215642/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:6849851/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:13794200/68‑1 (MQ=255) tctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGa < 1:14878526/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGCTATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt < 1:34641644/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:1803632/1‑68 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:8744237/1‑68 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:27238144/1‑68 (MQ=255) gAAGCGTAAATGACTCAGCCGGGTGATATCCCtcccccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgc > 1:5775081‑M2/1‑32 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:24724408/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:22467982/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:9925519/67‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCCGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:1734155/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCCGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCGATTCCGAAATACtt > 1:11108926/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctta > 1:18219081‑M1/1‑21 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:21060773/66‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:25111815/67‑1 (MQ=255) aTGACTGAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCa < 1:323514/68‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:3480635/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:11513650/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:23720764/1‑66 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:11394949/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:20265155/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCGTTCAGGCGCTAATCCGAAATACTTCCTc > 1:30651234/1‑65 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcac > 1:9127614‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:11966042/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:1592595/1‑67 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:2055054/1‑66 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:2209117/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:29938410/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:1866156/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:8065576/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:8553827/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCt > 1:10463452/1‑68 (MQ=255) cAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCtt > 1:33605739/1‑68 (MQ=255) ggCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatg > 1:25605882‑M1/1‑9 (MQ=255) ggCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatg > 1:32576315‑M1/1‑9 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcat < 1:14344093‑M1/66‑59 (MQ=255) gCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCttt > 1:28291140/1‑66 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:28698776/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:29520431/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:6100022/67‑1 (MQ=255) gtgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcg > 1:7346198‑M1/1‑4 (MQ=255) tgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcc > 1:10846235‑M1/1‑3 (MQ=255) tGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttc < 1:22621208/67‑1 (MQ=255) gagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcca > 1:17108652‑M1/1‑2 (MQ=255) gagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcca > 1:26517766‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657553‑2657686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |