| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 297 (0.670) | 16 (0.040) | 6/94 | NT | 5.5% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 296 (0.790) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
CTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTC > CP009273/2657560‑2657691 | cTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtcac > 1:11498021/1‑67 (MQ=255) tGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtc > 1:28736305‑M2/1‑66 (MQ=255) tGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtc > 1:23087959‑M2/1‑66 (MQ=255) aaCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcaccc < 1:10644196‑M2/67‑7 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCACTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg < 1:17401697‑M2/67‑8 (MQ=255) aTGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc < 1:14344093‑M2/66‑9 (MQ=255) gCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTc < 1:22536579/68‑1 (MQ=255) gggacGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:15134241‑M2/3‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:27305942‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:3249127‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:331022‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagt > 1:9127614‑M2/1‑54 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCg < 1:1494144/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:8156389/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:10880086/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:6527859/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:8006881/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:3583287/67‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCttt < 1:14677944/68‑1 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaac > 1:33863879‑M2/1‑45 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:15412347/68‑1 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:12195560/68‑1 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:22419911/68‑1 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:30293352‑M2/1‑44 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:10096907/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:30839397/1‑68 (MQ=255) cGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTa > 1:7230422/1‑68 (MQ=255) gACTCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:9482302/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGTGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:3959046/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:5139701/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:24608292/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:19429176/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:33679444/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:35649130/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:4469983/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:8694422/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:6849851/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:830778/1‑68 (MQ=255) cGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAtt < 1:36300049/67‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:18198677/68‑1 (MQ=255) tGACGCGTTAATGACGCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtc > 1:3220441‑M2/1‑33 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTAAGGCGCTATTAAGAAAt > 1:25165944/1‑68 (MQ=255) gAAGCGTAAATGACTCAGCCGGGTGATATCCCtcccccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgc > 1:5775081‑M2/1‑32 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:24188572/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:28147656/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:36959617/67‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:9925519/67‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:11151224/67‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:1637965/67‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt > 1:2017523/1‑68 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:12753561/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:3813601/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:31174854/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:34712999/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:21060773/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:31898327/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:26642673/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTc < 1:6108227/68‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:33389481/67‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc > 1:20424173/1‑67 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:26059538/67‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:29416527/67‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:11810934/67‑1 (MQ=255) aTGACTCTGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCa < 1:7626298/68‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:26461854/1‑66 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:25617329/1‑66 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:13872826/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:32687273/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:34048340/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:11394949/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:28487494/68‑1 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:33635510/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:1592595/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:19307707/1‑67 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:7447081/1‑66 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTg < 1:22016219/67‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:29938410/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:8553827/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:1866156/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:34833478/68‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCtt < 1:5959161/68‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTaat > 1:24890311/1‑66 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:29520431/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:22908206/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:27965331/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:31534844/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:13516838/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACCGCTTTAct > 1:16654110/1‑68 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttctt > 1:2895791/1‑68 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttct < 1:17284908/67‑1 (MQ=255) tatCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACtttctttc > 1:34375468/1‑68 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:14036683/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:12336137/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:21474423/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:18880556/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:17638007/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGt < 1:35322655/68‑1 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTATCg > 1:20647011/1‑67 (MQ=255) actcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTACGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc > 1:18544177/1‑67 (MQ=255) ctcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc > 1:23685290/1‑66 (MQ=255) | CTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTC > CP009273/2657560‑2657691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |