| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 369 (0.830) | 24 (0.060) | 11/94 | NT | 7.9% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 250 (0.670) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGT > CP009273/4506675‑4506808 | tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:30237872/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:22341666/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:21550502/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:5534329/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:17181816/1‑68 (MQ=255) cAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGt < 1:2723236/68‑1 (MQ=255) tgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTa < 1:34308258‑M2/4‑1 (MQ=255) gggAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACg < 1:10900428/68‑1 (MQ=255) gggAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACg > 1:12636560/1‑68 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGTGCTGCGCTGCG‑ATCCCGCCGTTGCGGTAACgg < 1:29804107/67‑1 (MQ=9) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:30010902/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:29212181/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:19833490/67‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgccacggcgggctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:26854730‑M2/8‑1 (MQ=255) gTCCCGCTCAGGCGCAGCCGGGCAACGGCGGGAG‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAg < 1:11038947/68‑1 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:35658672‑M1/49‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc < 1:33267270/67‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:133748/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:21940203/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:14060829/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:2025666/1‑68 (MQ=255) ccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGGTGCGGTAACGGGTTAGCGt < 1:27568907‑M1/50‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:14787319/68‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:22070904/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:30454689/67‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:16886889/1‑66 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:25605843/1‑66 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:6328644/1‑66 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGGAGCGCAGCACGCGGTTGCGGTAAGGGGTTAGCGTGGCt > 1:36068003/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:24732703/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:9584879/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:4775870/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:18079087/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:32948085/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:10612377/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:3919590/1‑68 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtc < 1:31557958/66‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:11921022/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:14480305/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:32359104/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:19259791/1‑66 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:6604737/1‑67 (MQ=255) ccGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcacc < 1:36504115/68‑1 (MQ=255) ccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcacc < 1:32497010‑M1/65‑1 (MQ=255) ccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCAccc < 1:18859605‑M1/66‑1 (MQ=255) ggCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCa < 1:23632601/68‑1 (MQ=255) GCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCa < 1:17747200‑M1/67‑1 (MQ=255) AACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGc > 1:16422046‑M1/1‑67 (MQ=255) AACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCg < 1:26582831‑M1/68‑1 (MQ=255) AACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCg < 1:12963889‑M1/68‑1 (MQ=255) accggcgggctgcgctgcgagcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGc < 1:23174017‑M2/35‑1 (MQ=255) ACGGCGGGAT‑CGCCGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCACACCCAGCgg < 1:17631716‑M1/68‑1 (MQ=255) cggcgtgctgcgcggcgaccccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt < 1:28991774‑M2/38‑1 (MQ=255) CGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTa < 1:15203795‑M1/68‑1 (MQ=255) gAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTTCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATc < 1:34076098/67‑1 (MQ=255) aT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATc > 1:31648270/1‑66 (MQ=255) aT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCg < 1:6774246/67‑1 (MQ=255) agcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa < 1:32692661/67‑1 (MQ=255) ggcgaccccgccgtggcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:33715661‑M2/51‑1 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa > 1:34955017/1‑66 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa > 1:8071636/1‑66 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa > 1:34611791/1‑66 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:4469720/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:24309963/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:21081260/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:13567590/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:19707770/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:21359455/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:36787525/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:29471132/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCt < 1:5996060/67‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCt < 1:11714600/67‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTc > 1:18366293/1‑68 (MQ=255) agcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCa < 1:22816420/67‑1 (MQ=255) agcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAg > 1:25850654/1‑68 (MQ=255) agcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAg > 1:425303/1‑68 (MQ=255) gcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAgg > 1:12214003/1‑68 (MQ=255) aCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAg < 1:1025403/65‑1 (MQ=255) aCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAg < 1:23012988/65‑1 (MQ=255) gccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGt < 1:6956130‑M2/60‑1 (MQ=255) ccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGt > 1:20919494‑M2/8‑67 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTcc < 1:31015504‑M2/62‑1 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTcc < 1:8720385‑M2/62‑1 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTcc < 1:27858887‑M2/62‑1 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTcc < 1:7856994‑M2/62‑1 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTcc < 1:20068147‑M2/62‑1 (MQ=255) cgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTc < 1:35399582‑M2/61‑1 (MQ=255) gttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCt > 1:31251970‑M2/6‑68 (MQ=255) ttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:35802616‑M2/51‑1 (MQ=255) tgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCtt < 1:28849917‑M2/64‑1 (MQ=255) tgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTc < 1:26309947‑M2/65‑1 (MQ=255) tgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTc < 1:7411926‑M2/65‑1 (MQ=255) gcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCg < 1:16059786‑M2/66‑1 (MQ=255) gcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCg < 1:9027813‑M2/66‑1 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGt > 1:1887964/1‑67 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGt > 1:15794696/1‑67 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGt > 1:26763202/1‑67 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGt > 1:11233873/1‑67 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGt > 1:10066226/1‑67 (MQ=255) ggTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTAGt > 1:5804933/1‑67 (MQ=255) | TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGT > CP009273/4506675‑4506808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |