New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 746964 | NA (NA) | 402 (1.050) | 155/288 | 0.4 | 90.5% | intergenic (‑88/‑706) | PP_0638/PP_5448 | transposase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1015874 | 42 (0.110) | intergenic (‑101/‑667) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 |
Only 100 of 402 total aligned reads displayed.
TTCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/746816‑746964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTTTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATAC < NC_002947/1015874‑1015727 TTCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACA < 1:1008314/150‑1 TCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAA > 1:4983333/1‑150 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TTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATT < 1:2287873/102‑1 TGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGT < 1:3416372/150‑1 GAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGG > 1:5174646/1‑150 GAATGTGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGG > 2:5843901/1‑150 TGGGGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCG < 1:8566030/150‑1 GGATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTT < 1:8181615/150‑1 ATGATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTAC < 1:7662880/150‑1 ATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATT < 1:1213202/150‑1 ATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATT < 2:2688044/150‑1 ATGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATT < 1:4469644/150‑1 TGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTG < 2:482411/150‑1 TGGATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTG > 1:6694185/1‑150 GATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAA < 2:8117446/109‑1 GATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCAGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGA < 2:8816949/150‑1 ATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAA < 1:7696993/150‑1 ATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAA < 1:5550036/150‑1 ATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAA < 1:3577489/150‑1 ATCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAA < 1:2615774/150‑1 TCCCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAG > 2:718529/1‑150 CCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATG < 2:761434/98‑1 CCTTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATG > 1:761443/1‑98 TTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCAT > 2:5696993/1‑150 TTACAATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCAT > 1:5626892/1‑150 TTACAATTCTAGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTGTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCAT > 2:3841485/1‑150 TTCGAAAGTCCACGGGCTTGGGGTAGAGGTAGACTTTTTCGACTTTGCTGTCGGGGCGCATCATGGCGGGCTGGCTCCAGAAAGAAATCGGGAGCACAGCATCGGGAATCAGGTGGACGGTTGGAATGTGGGGATGATGGATCCCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/746816‑746964 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCTTGTGTAAACGATTCCACTAATTTATTCCATGTCACACTTTTCGCATCTTTGTTATGCTATGGTTATTTCATACCATAAGCCTAATGGAGCGAATTATGAGAGTTCTGGTTACCGGTGGTAGCGGTTACATTGGAAGTCATAC < NC_002947/1015874‑1015727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |