| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 746964 | NA (NA) | 402 (1.050) | 155/288 | 0.4 | 90.5% | intergenic (‑88/‑706) | PP_0638/PP_5448 | transposase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 1015874 | 42 (0.110) | intergenic (‑101/‑667) | SBRG_Ecoli_galE/prfC | SBRG_Ecoli_galE/peptide chain release factor 3 | |||||
Only 100 of 871 total aligned reads displayed.
AGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCCGGAGAGGGTGCTAAGGCCGCCTCCGGCAAGGTCAG > NC_002947/1015725‑1016023 | tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa < 2:8482305‑M1/10‑1 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 1:590656‑M1/141‑150 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa < 1:4194975‑M1/10‑1 (MQ=255) tgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTa > 1:8385002‑M1/141‑150 (MQ=255) gTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgt > 2:7926926‑M2/1‑148 (MQ=255) tATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgta < 1:7252402‑M2/150‑4 (MQ=255) gACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagg < 1:7666214‑M2/150‑7 (MQ=255) ccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCg < 2:5721161‑M1/14‑1 (MQ=255) 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cctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGtttttt < 2:765887‑M1/20‑1 (MQ=255) ctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTa > 2:5048129‑M1/130‑150 (MQ=255) aTGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatc > 1:2299560‑M2/1‑136 (MQ=255) tGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatca > 1:8484597‑M2/1‑135 (MQ=255) gagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATgc > 2:7125224‑M1/127‑150 (MQ=255) gcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATgcgc > 2:3233338‑M1/125‑150 (MQ=255) aCCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccc < 1:5551843‑M2/150‑20 (MQ=255) cacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGa > 2:7211706‑M1/115‑150 (MQ=255) cgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGAtt > 2:4397945‑M1/113‑150 (MQ=255) cGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaac > 2:1549494‑M2/1‑120 (MQ=255) ctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATtata > 1:2541957‑M1/110‑150 (MQ=255) tcctcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTaa > 2:7761752‑M1/109‑140 (MQ=255) catcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATaaa > 2:4727970‑M1/108‑150 (MQ=255) tcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAAc > 1:4353212‑M1/106‑150 (MQ=255) gtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACaga > 2:1093399‑M1/103‑150 (MQ=255) aCTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctga > 1:4110244‑M2/1‑109 (MQ=255) agcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAgg > 2:2812815‑M1/101‑150 (MQ=255) tcATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcc < 1:3509136‑M2/150‑46 (MQ=255) tAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACACAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccga > 1:800403‑M2/1‑102 (MQ=255) ctacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacCAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTat > 2:5523603‑M1/95‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |