New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4647267 = | 18 (1.080) | 4 (0.240) | 4/280 | 1.6 | 19.7% | coding (420/483 nt) | PP_5658 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4647285 = | 15 (0.920) | coding (438/483 nt) | PP_5658 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTGGCAGCGACGTCGCCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTA > NC_002947/4647125‑4647396 | cTGGCAGCGACGTCGCCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCa > 1:273332/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCGACGTCGCCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCa > 1:273374/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCGACGTCGCCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTGGCTGCCGGCCa > 1:273330/1‑150 (MQ=255) cccAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTg > 2:216666/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGTACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTg < 1:286701/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGa < 2:282276/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCgca < 1:250168/116‑3 (MQ=255) cAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCgca > 2:250168/1‑114 (MQ=255) gcgcTGGACCTGACCATCCTCCAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGGCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGCTGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcagggca < 1:314182/150‑1 (MQ=255) cgcTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTggcagggcag < 2:243312/150‑1 (MQ=255) ccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGt < 1:250555‑M1/27‑1 (MQ=255) ccctgccaccgggccgtcagtcggtctgggcttgcagcatccactggccatccacttcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGt > 2:250555‑M1/63‑89 (MQ=255) aTCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCt < 1:202973/150‑1 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg > 1:352697/1‑150 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg < 1:384595/150‑1 (MQ=255) ttCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTtggtg < 1:340259/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGt < 1:146896/150‑1 (MQ=255) cgccCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTcca < 2:89483/150‑1 (MQ=255) cTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccaccca > 1:99566/1‑150 (MQ=255) acGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTa < 2:352697/150‑1 (MQ=255) tcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccacccac > 2:257440‑M1/7‑131 (MQ=255) tcacggGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTccacccac < 1:257440‑M1/125‑1 (MQ=255) | CTGGCAGCGACGTCGCCCAGGTGTTGAAAAAAGCCTGGCTGTCGTACACCAAGGCTGATCTCAACCTGGTCGGTGCGCTGGACCTGACCATCCTCAAGACCTTCACCGAGGCCGCCCTGCACACGCGCCTGCTGGCCTTGCTGCCGGCCAGCGGCCTGGCCCGTGAAGTGGATGGCCAGTGGATGCTGCAAGCCCAGACCGACTGACGGCCCGGTGGCAGGGCAGGATTCCACCGGTCTGCTAACTTGGTGGAATCCGTCCACCCACAGGTA > NC_002947/4647125‑4647396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |