New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1780108 | 136 (0.390) | 41 (0.120) | 33/282 | 16.0 | 23.5% | intergenic (+25/+81) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
? | NC_002947 | 1780171 = | 137 (0.410) | intergenic (+88/+18) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGACC > NC_002947/1780023‑1780319 | gtgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCTGCGCTTTAAATCAGCGCTGTACCGGGGGGAGCGGGCGTg > 2:2198260/1‑149 (MQ=255) tgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACACGTACAGCGCTGCGCGTGGAATAGGCGCTGTTACGGTGGGGGCGGGCGTGc > 1:4032797/1‑149 (MQ=255) tgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACCGGTACTGCGCGGGGGGTGGAAACAGCGCGGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:3938868/1‑149 (MQ=255) tgCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCCCAGGTACTGCGCTGCGCGTGAAAACAGCCCGGTACCGGTGGGAGCgggcgggc > 1:1688446/1‑149 (MQ=255) aGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCGGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑aa > 2:1674406/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCCCCGGGACTGCGCGGCGCGGGAAAACACCGCGGTCCCAGGGGGAGCGGGCGTGGCCGCC‑AAgcgg > 1:4576008/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACACGTTATGGGCTGGGCGTTTAATAAGCGCGGTAACAGGGGGTGGGGGCGGGCCCCCG‑GCgggg > 1:4575993/1‑149 (MQ=255) tGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCTGCGCTTGAAAGCAGCGCAGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAggggg > 2:1445379/1‑148 (MQ=255) gggTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACCCGGACTGCGCAGCCCGTGAAATCAGCCCGGGAACAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAcggggt > 1:5447801/1‑147 (MQ=255) gTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGAGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCG‑AAGGGGTTGa > 2:6693322/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTAATGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGAt > 2:5133424/1‑149 (MQ=255) atatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACATCGCTGCGCTTGAAAACAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCC‑AAGGGGTTGATAAGCGGtt > 2:1929417/1‑149 (MQ=38) atatGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGCTGCGCTTGCAATCAGCGCTGTACCGGGGGGCGCGGGCGGGCCCGCG‑CAGGGGTTGATCAGCgggt > 2:6402691/1‑147 (MQ=255) atGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGGTGTTCAGCGGtttt > 2:7127449/1‑149 (MQ=255) atGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCCCACGTACGGCGCGGCGCGTGCAAACAGCCCTGTAACAGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑GAGGGGGTTGTCAGGGGtttt > 1:2911666/1‑149 (MQ=255) atGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCTCCCACAGGGACGGCGCTGCGCGTGTAAAAAGCGCGGTACCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCG‑CAGGGGGTGATCAGCGGtttt > 1:6752826/1‑149 (MQ=255) atGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCCCGCCCACAGGGACTGCGCTGCGCTTGAGATCAGCGCTGTACCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑TACGGGGTGTGAAGCGGgttt > 1:6752812/1‑149 (MQ=255) gagtgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCCGGTAATGCGCTGGGGTTGTAAACAGCGCTGTTCCGGTGGGGGCGGGGGTGCCCGCG‑GCGGGGTTGGTAAGCGGGTTTGc > 2:215593/1‑149 (MQ=255) ggCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACAGCGCGGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCAGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGGTTTGCAGGAAg > 1:7521099/1‑149 (MQ=255) cAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCGGCGCGTGAAAAAAGCGCGGTACCGGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCG‑GAGGGGGTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTccgcc > 1:4331128/1‑149 (MQ=37) cAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAAACAGCGCGGTTCCGGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGCACGGGGTTG‑TCAGCGGTTTTTCAGGAAGGCGCGCCGGCGCTccgcc > 2:4120765/1‑149 (MQ=255) gttgACCCTATCACGGCCCTGGGGGGGGGGGCCCGCACCCCCGGGTACTGGGGTGCGTTTTAAATCCGGGCTGAACGGGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCt < 2:4248491/146‑1 (MQ=255) gTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCt > 2:5533301/1‑149 (MQ=255) gACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCACTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCg < 2:4041230/149‑1 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACAGGGACGGCGCTGCGCGTGGAAACAGCGCGGTACCGGGGGGCGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGGTTTGCAGGAAGGCGCGCATGCGCTCCGCCCCGGCGATg > 2:1368118/1‑149 (MQ=25) cTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGTTCAGCGGTTTTGCCGGGAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTCGATGc > 2:7076015/1‑149 (MQ=255) aGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCACCGGGACTGCGCTGCGCTGGGAATCAGCGCTGTACCGGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCG‑AAGGGGGTGGTCAGCGGGTTTGCAGGAAGGCGCGAAGGCGCGCCGCCGCTTCGCTGCCGTCgg > 2:7350787/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTTCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCGTCGAAGCATTCGGcc > 2:7492414/1‑149 (MQ=255) cccTTCGCGGGCGCGCCCGCGCCCCCAGGGGCTGCCCAGCGCGTTAAAGCCCCGCGGTACCAGTGGGAGCCGGCGGGCCCGCC‑CCCGGGGTTAGCCCCGGGTTTGCAGGCAGGCGCGCAAGCGCACCCCCGCCGCGCTGCAGTCGGccc > 2:1553700/1‑148 (MQ=255) ggCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCGTGAAAACAGCGCTGTACCGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AACGGGTTGATAAGCCGTTTTGCAGGAAGGCCCGAAATCGCACCGCCGCGTCGATGCATTCGGCCACCGGTGCaa > 2:3941775/1‑149 (MQ=37) gcgcgcCCGCGCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATAAGCCCGGTACCTGTGGGAGCGGGCCAGCCCGCG‑AAGGGGTTGAACAGCGGTTTTGGAGGAAGGCGCGAATTCGCTCCCCCCCTTCGATGCATTCGGCCCGCGGTGCAAc > 2:3406364/1‑149 (MQ=255) cgcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAg > 2:3055494/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTg > 2:7514573/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAACGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTg > 1:5214878/1‑149 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCAt > 1:2003891/1‑149 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCAt > 2:5025910/1‑149 (MQ=255) cTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCAt > 2:433670/1‑149 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAACTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 2:6839633/1‑149 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 1:5290300/1‑149 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 2:1941756/1‑149 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGATGAACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGTCGCGAATGCTCTCCGCCGCTTCGATGAATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATgcgc > 1:1004596/1‑149 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 1:2804519/1‑149 (MQ=255) caGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:6845712/1‑149 (MQ=255) caGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:7594417/1‑149 (MQ=255) caGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAc > 1:7594430/1‑149 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcg > 2:6052182/1‑149 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACgcgc > 2:2793795/1‑149 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACgcgc > 1:6299422/1‑149 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGAAACCAGTGCCATGCGCACgcgc > 1:3165036/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGcc > 2:2000469/1‑149 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGccc > 2:1199192/1‑149 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGccc > 1:74963/1‑149 (MQ=255) tgcgctgcgcTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCg > 1:4856357/1‑149 (MQ=255) gcgctgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCgg > 1:3932556/1‑149 (MQ=255) gcgctgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCgg > 1:2514528/1‑149 (MQ=255) ctgcgctTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCAc > 1:554651/1‑149 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGt > 1:4397358/1‑149 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGt > 1:5482699/1‑149 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGt > 1:5946087/1‑149 (MQ=255) ttGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGAGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGt > 1:4397338/1‑149 (MQ=255) tGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGtt > 1:1750798/1‑149 (MQ=255) tGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCAGCACCCGGGtt > 1:812365/1‑149 (MQ=255) gAAATCCGCGCTTAACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTc < 2:6206991/149‑1 (MQ=255) aaaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCa > 1:106215/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCa > 1:116119/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCAGGCACCCGGGTTCa > 1:7023497/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTCATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCa > 1:6495657/1‑149 (MQ=255) aaTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAc > 2:7320237/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcc > 1:4932972/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAcc > 2:4592142/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAccc > 1:1431428/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCAt > 2:4361269/1‑149 (MQ=255) gcTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATcc > 1:152888/1‑149 (MQ=255) cTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCa > 1:3053582/1‑149 (MQ=255) tGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAc > 1:7115172/1‑149 (MQ=255) tGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAc > 2:4273306/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCa > 1:1335939/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAc > 1:918288/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAc > 2:6567400/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcg > 1:5928782/1‑149 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgcg > 1:579313/1‑149 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgcg > 1:578918/1‑149 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgcg > 1:2656944/1‑149 (MQ=255) tgGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCAcgcg > 2:6997876/1‑149 (MQ=255) gggcgggggCGTGCCCGCG‑TAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGTATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGa < 2:2030926/143‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGa > 1:2011359/1‑149 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGa > 2:6040880/1‑149 (MQ=255) cttcgCGGGCACGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGa > 1:3375752/5‑149 (MQ=255) tcgCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa < 2:4681142/147‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa > 2:7530442/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa > 2:2649714/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACa > 2:6487374/1‑149 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAgg < 2:4576008/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTa > 2:5286111/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTAc > 1:6922878/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTAc > 2:1545500/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACg > 2:378786/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGa < 1:3941775/149‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGa > 2:2393592/1‑149 (MQ=255) tGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGAcc > 1:6333908/1‑149 (MQ=255) | GGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAATCAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCACTTCACGCGACAGGTACGACC > NC_002947/1780023‑1780319 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |