| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 4131004 = | 45 (1.340) | 89 (2.790) | 69/266 | 0.0 | 70.4% | coding (1170/2433 nt) | metL | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2 |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 4295543 | 32 (1.000) | coding (1062/1314 nt) | gltP | glutamate/aspartate:proton symporter | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TGAAACGCGCGCAGGTACGCCCGCTGGCGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCAGTACTGCGCACCGGCC > NC_000913_3_bme_pgi/4130856‑4131152 | tGAAACGCGCGCAGGTACGCCCGCTGGCGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAgggg > 1:407339/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCGCAGGTACGCCCGCTGGCGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTg > 1:472390/1‑149 (MQ=255) cggttactcttttatccttgatggttcgacgctttatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGgcg > 1:175828‑M1/143‑149 (MQ=255) actcttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtcttgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCtggt > 1:308133‑M1/138‑149 (MQ=255) aGGTACGCCCGCTGGCGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTTCTATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGACTGGCGCtgatt > 1:293294/1‑146 (MQ=255) tcttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatgtcattgacctgtccgtctggcaggaaatcattctggtgcttacgctgatggtaacctcgaaagggattGCTGGCGGtggtgg < 1:124711‑M1/14‑1 (MQ=255) tcttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCtggtgg < 2:66302‑M1/14‑1 (MQ=255) tcttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCtggtgg < 2:473616‑M1/14‑1 (MQ=255) tcttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCtggtgg > 1:300526‑M1/136‑149 (MQ=255) ggTACGCCCGCTGGCGGTTGGCGCACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCtggtgg < 2:46178/149‑1 (MQ=255) ttttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtcacctcgaaagggattCCTGGCGCTGATGgcc < 2:155288‑M1/16‑2 (MQ=255) ttaaccttgatggttcgacgctgtatcaaagtattcccgctatcttcatcgcgcagttgtatgacattaacctgtccatctagcaagaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGAt < 1:204293‑M1/18‑1 (MQ=255) cccGCTGGCGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATgg < 1:463736/149‑1 (MQ=255) gcttgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggcaataataatcgtgatgatgctggtggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTc > 2:547365‑M1/128‑149 (MQ=255) tgatggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGt > 1:545204‑M1/125‑149 (MQ=255) tggttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCa > 1:66302‑M1/122‑149 (MQ=255) cGGTTGGCGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCa < 1:462378/149‑1 (MQ=255) ttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGc > 2:345895‑M1/119‑149 (MQ=255) ttcgacgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGc < 1:345536‑M1/31‑1 (MQ=255) cGTACATAACGATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCa > 2:425493/1‑149 (MQ=255) acgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctggtaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCa < 1:388236‑M1/35‑1 (MQ=255) acgctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCa < 1:253852‑M1/35‑1 (MQ=255) gctgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgtcctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCAcc < 2:566002‑M1/37‑1 (MQ=255) tgtatcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCGGGCGTCACCCg < 1:76700‑M1/39‑1 (MQ=255) tcaaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcggaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCTCccgtgac < 1:281219‑M1/43‑4 (MQ=255) gATCGCCAGTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAAccc > 2:194598/1‑149 (MQ=255) aaagtattgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgcaagggcttGCTGGCGCTGGTGGCGATGATCGGTGCAGGCGTCACCCGTAcccc < 2:235402‑M1/45‑1 (MQ=255) aagtatagccgcgatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCg < 2:307497‑M1/46‑1 (MQ=255) ttgccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtacatctggcaggaaataattctggtgctgtcgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTACCCCGCTGCa < 2:74711‑M1/51‑1 (MQ=255) gccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCAtt > 2:345536‑M1/97‑149 (MQ=255) gTTGCTGCAATTTTGCTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCAtt < 2:407339/149‑1 (MQ=255) ccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTg < 1:225660‑M1/54‑1 (MQ=255) ccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTg < 2:556951‑M1/54‑1 (MQ=255) ccgctatcttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGAGGGTGTAACGCGGAGCCCGGTGGATTg < 1:556000‑M1/54‑1 (MQ=255) ccgctatcttcatcgcgcagttctatggcattgacctgtccatccggcaggaaatcattctggagctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGACGGTGGCGGGTTCCTCCGTAACCCGCTGCATTg < 2:571059‑M1/54‑1 (MQ=255) tgcAATTTTGCTACACCTCAGAAATGGCCGCCAGTGCGCTGAAAATCATCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGTTGGTAGGTGCAGTCGCCACCCTTAAACCACTGCAtttcacc > 2:286572/1‑144 (MQ=255) cttcatcgcgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTCCCACCGc < 2:305229‑M1/61‑1 (MQ=255) cTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCAc < 1:28206/117‑1 (MQ=255) cTACACCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCAc > 2:28206/1‑117 (MQ=255) gacacCTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTCAAAATCCTCGACGCAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTACGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGCCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCCTCACCCGCCGCCTTGCCCCCCCTTCTGgca > 2:104439/2‑149 (MQ=255) cgcagttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGgca > 1:537105‑M1/81‑149 (MQ=255) ccTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAATCCTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAAGCGTCACCCGTAAACCGCTGCATTGCAACCGCTTCTGGCAGCaa > 1:62116/1‑149 (MQ=255) ccTCAGAAGTGGCCGACAGTGCGCTGAAAAGCGTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCGCCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGgcgccaa > 2:155707/1‑144 (MQ=255) ttgtatggcattgacctgtccatctggcaggaaatcattctggtgctgacgctgatggtgaccccgaaggggtttGCTGGGGCTGGGTGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAAc > 2:141715‑M1/76‑149 (MQ=255) 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ccTCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAAGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGc > 2:487167/1‑149 (MQ=255) tCGACGAAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACGGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAg > 1:465584/1‑149 (MQ=255) tcattctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGCCGAATTTACCTGGCCGTc < 2:587289‑M1/108‑1 (MQ=255) acgaAGCGGGATTACCTGGCGAACTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTATAGAAGGTATGCAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTcc < 1:143524/149‑1 (MQ=255) attctggtgctgacgctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCg < 2:24742‑M1/110‑1 (MQ=255) 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gctgatggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGc > 1:576713‑M1/26‑149 (MQ=255) atggtgacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCtgg > 2:120732‑M1/22‑149 (MQ=255) aaCTGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCACCCtggta > 1:108560/1‑148 (MQ=255) tGCGCCTGCGTCAGGGGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACTTGTCGGATCGAAAAGAGAATCAGCCTGGTGGCa > 1:177596/1‑149 (MQ=255) gacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCa > 2:379327‑M1/17‑149 (MQ=255) gacctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCa < 1:332392‑M1/133‑1 (MQ=255) acctcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCAg < 2:276977‑M1/134‑1 (MQ=255) tcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCAGTAc < 2:469177‑M1/137‑1 (MQ=255) tcgaaagggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCAGTAc < 2:590916‑M1/137‑1 (MQ=255) ggattGCTGGCGCTGGTGGCGATGGTCGGTGCAGGCGTCACCCGTAACCCGCTGCATTGCCACCGCTTCTGGCAGCAACTGAAAGGCCAGCCGGTCGAATTTACCTGGCAGTCCGATGACGGCATCAGCCTGGTGGCAGTACTGCGCAc > 2:446208‑M1/6‑149 (MQ=255) 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NC_000913_3_bme_pgi/4130856‑4131152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |