| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 4131004 = | 45 (1.340) | 89 (2.790) | 69/266 | 0.0 | 70.4% | coding (1170/2433 nt) | metL | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2 |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 4295543 | 32 (1.000) | coding (1062/1314 nt) | gltP | glutamate/aspartate:proton symporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCG > NC_000913_3_bme_pgi/4295395‑4295687 | ggCCGTCCGGTTTCTCTTTTAACCTTGATGTTTCGATGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGTTGACGCGGATGGTGACCTCGAAAGGGAtt < 1:118474/148‑1 (MQ=255) gACTGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTTTTAAAGAATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCGGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctg > 1:316187‑M2/1‑145 (MQ=255) cGGTTACTCTTTTATCCTTGATGGTTCGACGCTTTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcg > 1:175828‑M2/1‑142 (MQ=255) tctTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGTCATTGACCTGTCCGTCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTTACGCTGATGGTAACCTCGAAAGGGATTgctggcggtggtgg < 1:124711‑M2/149‑15 (MQ=255) tctTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtgg < 2:66302‑M2/149‑15 (MQ=255) tctTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtgg < 2:473616‑M2/149‑15 (MQ=255) tctTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtgg > 1:300526‑M2/1‑135 (MQ=255) tctTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATACGCCACTAGCCTCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTgg > 1:444221/1‑149 (MQ=255) ttttAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTCACCTCGAAAGGGATTcctggcgctgatggcc < 2:155288‑M2/149‑17 (MQ=255) tttAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcga < 1:362020‑M2/149‑18 (MQ=255) ttAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTCCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGACATTAACCTGTCCATCTAGCAAGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgat < 1:204293‑M2/149‑19 (MQ=255) gctTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGCAATAATAATCGTGATGATGCTGGTGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtc > 2:547365‑M2/2‑127 (MQ=255) ccTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtc < 1:545393‑M2/149‑23 (MQ=255) aTGGTTCGATGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTtgtg < 1:124883/149‑1 (MQ=255) aTGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGTCAGGAAATCATTCTGGTGATGACGCGGATGGTGAACTCGAAAGGGCTTgcgggccctgattgcgatgtgcggtgc < 2:334187‑M2/149‑28 (MQ=255) tGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgca > 1:66302‑M2/1‑121 (MQ=255) ggTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCg > 2:72390/1‑136 (MQ=255) ggTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCg < 1:72390/136‑1 (MQ=255) ttCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggc < 1:345536‑M2/149‑32 (MQ=255) ttCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggc > 2:345895‑M2/1‑118 (MQ=255) aCGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGGGCAGTTTTATGGCATTTACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATGCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCt < 1:464548/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTGGTAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtca < 1:388236‑M2/149‑36 (MQ=255) aCGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtca < 1:253852‑M2/149‑36 (MQ=255) gCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGTCCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacc < 2:566002‑M2/149‑38 (MQ=255) tGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcgggcgtcacccg < 1:76700‑M2/149‑40 (MQ=255) aaaGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGCAAGGGCTTgctggcgctggtggcgatgatcggtgcaggcgtcacccgtacccc < 2:235402‑M2/149‑46 (MQ=255) aaGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCt > 1:51599/1‑147 (MQ=255) aaGTATAGCCGCGATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccg < 2:307497‑M2/149‑47 (MQ=255) aTTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCAATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctgtcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcagccgtaacccgcagc < 2:262533‑M2/149‑51 (MQ=255) ttGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTACATCTGGCAGGAAATAATTCTGGTGCTGTCGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaccccgctgca < 2:74711‑M2/149‑52 (MQ=255) gCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcatt > 2:345536‑M2/1‑96 (MQ=255) ccTCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGTCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggccatggtagtgaagccatgggcaggcgtcacccgtaacccgctgcattg < 2:424754‑M2/149‑55 (MQ=255) ccGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattg < 2:549466‑M2/149‑55 (MQ=255) ccGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattg < 1:225660‑M2/149‑55 (MQ=255) ccGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgagggtgtaacgcggagcccggtggattg < 1:556000‑M2/149‑55 (MQ=255) ccGCTATCTTCATCGCGCAGTTCTATGGCATTGACCTGTCCATCCGGCAGGAAATCATTCTGGAGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggacggtggcgggttcctccgtaacccgctgcattg < 2:571059‑M2/149‑55 (MQ=255) cTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattcccaccgc < 2:305229‑M2/149‑62 (MQ=255) aTCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttct > 1:307497‑M2/1‑84 (MQ=255) 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aaTCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCg > 1:206668/1‑149 (MQ=255) tCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggccgaatttacctggccgtc < 2:587289‑M2/149‑109 (MQ=255) aTTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccg < 2:24742‑M2/149‑111 (MQ=255) tCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgat < 2:384853‑M2/149‑113 (MQ=255) tCTGGTGCTGACGCGGATTGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaagcccatccggtcgaatttacctggcagtccgat > 2:281219‑M2/1‑37 (MQ=255) tGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagctgttcgaatttacctggcagtccgatga > 2:281427‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGTGCTGACGCTGATAGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatga < 1:522756‑M2/149‑115 (MQ=255) ggTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgatgccaaacagactcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgac > 1:136445‑M2/1‑34 (MQ=255) tGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgacgg < 1:120732‑M2/149‑118 (MQ=255) gCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGGATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTa < 2:521755/149‑1 (MQ=255) 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tGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGCCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACgtg > 1:396416/1‑149 (MQ=255) gACCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgacggcatcagcctggtggca > 2:379327‑M2/1‑16 (MQ=255) aCCTCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgacggcatcagcctggtggcag < 2:276977‑M2/149‑135 (MQ=255) tCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgacggcatcagcctggtggcagtac < 2:590916‑M2/149‑138 (MQ=255) tCGAAAGGGATTgctggcgctggtggcgatggtcggtgcaggcgtcacccgtaacccgctgcattgccaccgcttctggcagcaactgaaaggccagccggtcgaatttacctggcagtccgatgacggcatcagcctggtggcagtac < 2:469177‑M2/149‑138 (MQ=255) tCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCGGGGTAGCGTAGGTAt > 1:470621/1‑71 (MQ=255) 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TGCCGACCGGTTACTCTTTTAACCTTGATGGTTCGACGCTGTATCAAAGTATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCG > NC_000913_3_bme_pgi/4295395‑4295687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |