| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 2753981 = | 3 (0.090) | 31 (0.920) | 28/280 | 0.3 | 66.7% | intergenic (+35/+27) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | 4502091 = | 28 (0.830) | intergenic (+501/+13) | yjgZ/insG | uncharacterized protein/IS4 transposase | |||||
CCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCAT > NC_000913_3_bme_pgi/4501945‑4502235 | ccGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTaa > 1:351936/1‑149 (MQ=255) gcaaaactaagcgatagtgtgcatgatggcgatcgggtggatatttatcgccctctcagtgccgatccgaaagatcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCca < 1:366385‑M2/8‑1 (MQ=255) ggCAAGACAATGTCAAACAATCGAAGATTGTGGCGATGACAGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATTCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGACAGTTa < 2:404380/149‑1 (MQ=255) gCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTaa > 1:144695/1‑149 (MQ=255) aTGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGc < 1:581990/149‑1 (MQ=255) gtgtgcatgatggcgatcgggtggagatttatcgccctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactg > 1:311425‑M2/126‑149 (MQ=255) aaaGATTGTGGCGTTGACGGTCAACCTAGGAGACGAAAAAGCACAGTATTCTCGTTGGCCACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACAGACTGGCTCTTTTTc > 1:592693/1‑149 (MQ=255) atcgggtggtgatgtatggctctctgatttgcgatccgaaacagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacataaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCg < 2:588643‑M2/39‑1 (MQ=255) tcgggtggagattgatcgccctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCgg < 1:338084‑M2/40‑1 (MQ=255) gatttatcgccctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTggg > 1:172154‑M2/101‑149 (MQ=255) tttatcgccctctaattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGt < 1:332485‑M2/51‑1 (MQ=255) ttGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGt > 1:4680/1‑149 (MQ=255) tatcgccctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAt < 2:288636‑M2/53‑1 (MQ=255) aCGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAtt < 2:4680/149‑1 (MQ=255) ggTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTc < 2:562520/149‑1 (MQ=255) cgctctcattgccgttccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgggcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCa < 2:107078‑M2/58‑1 (MQ=255) ccctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggccacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGACTTTGGGCTATTTCCa > 1:265849‑M2/92‑149 (MQ=255) cctctcattgccgatccgaaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAg < 2:311425‑M2/59‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cgaaagagcttcgcagggaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCa < 2:393795‑M2/75‑1 (MQ=255) aaagagcttcgcaggcaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGAGCTTTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCaca > 1:222559‑M2/73‑148 (MQ=255) tCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTGTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCACGCGCATCTCCTTTTCCACtctc > 2:481927/1‑149 (MQ=255) tCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACtctc > 2:350241/1‑149 (MQ=255) gTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCGGGGCCTCTCCTTTACCCCTCTCggg > 1:593565/1‑149 (MQ=255) tcgcaggtaacgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTCACTGGCTCTTTTTCGGTGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGaa < 1:141727‑M2/85‑1 (MQ=255) ttacacttGGCAACCAGATAAGGTAAGCGTTGATGGTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGGCAGTCAGGTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGTTGTGGGGTATTTCCATGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAg < 2:588663/143‑1 (MQ=255) tcGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGcc < 2:351936/149‑1 (MQ=255) ttGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCtt < 1:350241/149‑1 (MQ=255) gCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTCAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTcc > 2:8349/1‑149 (MQ=255) cgagcagaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTcc < 2:72522‑M2/95‑1 (MQ=255) cgagcagaaaaagcagcgaataaatagcagaaagaaaaaaggtgctcattgagtTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCATTCTCGGTAAGGCCCTTTcc < 2:222560‑M2/95‑1 (MQ=255) cAACCAGATAAGTGAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGTTATTTCCAGGGCCGCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTccc < 2:243862/149‑1 (MQ=255) agaaaaatcagcgaataaataacagacagaaaaaaggtgctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCcttct > 2:22228‑M2/50‑149 (MQ=255) gATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCGTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTg < 2:208232/149‑1 (MQ=255) 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gctcattgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCTTGGCTGTTGGGTATTTCGAGGGCCTCCCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTACTTTCACAAGTTGTCCCATACTTTCAAGAt > 2:14279‑M2/12‑149 (MQ=255) attgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTccc > 2:392589‑M2/8‑103 (MQ=255) attgagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTccc < 1:392589‑M2/96‑1 (MQ=255) ttCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCa > 2:411145/1‑149 (MQ=255) tCTTTAATTCTAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCACTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCAt < 1:278326/149‑1 (MQ=255) gagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGTCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCgcgc < 2:34315‑M2/143‑1 (MQ=255) gagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcgc < 2:390540‑M2/141‑1 (MQ=255) gagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATcgc > 1:390540‑M2/5‑145 (MQ=255) gagcTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCgcgc > 1:34315‑M2/5‑147 (MQ=255) | CCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCAT > NC_000913_3_bme_pgi/4501945‑4502235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |