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3:551117‑M1/150‑132 (MQ=255) cccTCGGCTTTACCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcactctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatg < 3:325409‑M1/150‑132 (MQ=255) ccTCGGCTTTACCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcactctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatgt > 4:1487552‑M1/1‑18 (MQ=255) tCGGCTTTACCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcactctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatgatc > 3:1269458‑M1/1‑16 (MQ=255) gCTTTACCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcactctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatgatctcc > 2:1684429‑M1/1‑13 (MQ=255) aCCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctg < 3:1200554‑M1/93‑86 (MQ=255) aCCAATAAtggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgc < 2:1732706‑M1/81‑74 (MQ=255) 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ataatggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcactctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatgatctccgcggcgctg < 3:1340325‑M1/150‑147 (MQ=255) taatggcgggtgacccgactgcgggtaaactgtctggtggcttcctgttcaaaatgtacggtctgccagctgccgcaattgctatctggcacgctgctaaaccagaaaaccgcgcgaaagtgggcggtattatgatctccgcggcgctga < 3:1266584‑M1/150‑148 (MQ=255) | TATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGTTCCGTCTTTGCAAACATGCCACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGCTTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTTGCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTGAAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/1157940‑1158236 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |