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tttgcgatcggtgtcgccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGaa > 1:2448243‑M2/36‑150 (MQ=255) tttgcgatcggtgtcgccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGaa > 1:1818348‑M2/36‑150 (MQ=255) cggtcggtgtcgccctcggctttaccaatgaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCCTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCGAGCTGGCGATCTGCTAAACCAGGAAACCGCGCGAAAGTg < 4:1500768‑M2/119‑1 (MQ=255) cgatcggtgtcgccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTg > 2:1401853‑M2/32‑150 (MQ=255) gtcgccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtat > 3:1492741‑M2/24‑150 (MQ=255) gccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTCCGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtattat < 3:1647671‑M2/130‑1 (MQ=255) gccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGt > 2:600382‑M2/21‑79 (MQ=255) gccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtattat > 1:1294590‑M2/21‑150 (MQ=255) ccctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATg < 2:807593‑M2/131‑1 (MQ=255) cctcggctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTAtgt > 4:1487552‑M2/19‑149 (MQ=255) gctttaccaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTcc < 2:2231790‑M2/137‑1 (MQ=255) accaataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGc > 1:1732706‑M2/9‑81 (MQ=255) aataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCt > 3:987768‑M2/6‑85 (MQ=255) aataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCt < 4:987768‑M2/80‑1 (MQ=255) aataaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCt > 2:2044803‑M2/6‑150 (MQ=255) taaTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACGCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGa < 3:1266584‑M2/147‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGCCCt < 4:1108216/150‑1 (MQ=255) | AGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCT > NC_000913_3_hsa_tpiA/1158444‑1158739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |