| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3186096 = | NA (NA) | 155 (0.740) | 104/258 | 1.5 | 88.1% | intergenic (+6/‑91) | yqiG/insC1 | pseudogene; fimbrial export usher family;putative membrane; Not classified; putative membrane protein/IS2 repressor TnpA |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 3291501 | 21 (0.100) | coding (161/1092 nt) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_tpiA/3186244‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAA < NC_000913_3_hsa_tpiA/3291501‑3291357 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAC > 4:748490/1‑150 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCT > 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GCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCT < 2:502482/150‑1 GCCGTATGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCCCTCATCTGTGCTCCAATGACTAGTCTAAAGACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCT < 1:883040/150‑1 GTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGT > 2:1346671/1‑150 TGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCA < 4:368499/150‑1 TCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACA > 2:1940332/1‑150 TCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTG > 1:1278416/1‑137 TCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTAT > 4:82748/1‑130 TCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTAT < 3:82748/130‑1 CCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACAT < 1:1003263/150‑1 CCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTC > 2:103612/1‑140 GGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGAGTCAGGGTGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTATCATCA > 2:1044193/1‑150 CCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATC < 2:1159708/150‑1 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4:568559/1‑150 TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTT > 1:346822/1‑150 GTTCTCCAATTACTACTCTAAAAACTAGTATTAATACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGTAGATTCAGGGCCCCAGTCTACCTCCTCTCACGTTATCTATCTTTTTCACCGTAACATCATCAACCACCCTGCTCTAATTTG < 2:1962245/150‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTG < 2:962677/150‑1 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGT < 1:1189797/150‑1 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGT < 3:748490/150‑1 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2:1503886/1‑150 TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCC < 4:1337582/115‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAA < 1:711202/150‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGC < 1:603804/74‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGC > 2:603804/1‑74 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTAT > 2:872446/1‑37 TTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAA < 1:647554/60‑1 TTCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAA > 2:647554/1‑60 TCAGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCA < 2:1190648/58‑1 AGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCA > 3:338892/1‑60 AGGGGGCCAGTCTACGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCA < 4:338892/60‑1 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< NC_000913_3_hsa_tpiA/3186244‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAA < NC_000913_3_hsa_tpiA/3291501‑3291357 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |