New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3083831 = | 123 (1.160) | 18 (0.180) | 10/276 | 8.3 | 13.7% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
? | NC_000913 | 3083868 = | 112 (1.130) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTC > NC_000913/3083684‑3083976 | aGTAATCACGCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATTGACTCCTATTACAAAGTCGATATaaaaaaa < 1:1035786/149‑1 (MQ=255) aGTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATaaaaaaa < 2:63700/149‑1 (MQ=255) gTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAAc < 2:204707/149‑1 (MQ=255) tAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATCACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAAcc < 1:398139/149‑1 (MQ=255) tCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCtt > 2:474597/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGCTGCATCGCTGTCATCCGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCACAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTACGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTcc < 2:843774/149‑1 (MQ=255) cccAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCcg > 2:1625464/1‑149 (MQ=255) gTCGGCTTCGCTGGCATCCGGCTGGTAGTTCTTGGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCTTTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGTCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGcgtc < 2:1464022/149‑1 (MQ=255) cTGCATCGCTGTCATACGGCTGGATGTTCATCGGCAGGCGTAATAAACCAAAGGCATTGGATTCCAGTGTGTTATCGTTTTGTTGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGcgtcgt < 2:31264/149‑1 (MQ=255) cTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGcgtcgt < 2:460464/149‑1 (MQ=255) cATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCC‑TCCGCGTCGTTAgg > 1:759075/1‑149 (MQ=255) aTCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAgg > 2:593618/1‑149 (MQ=255) aTCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAgg < 2:1637361/149‑1 (MQ=255) 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tCGATATAAAAAAACCCTTCCGGGTCGTTTGGGCCTACGAGGAAGGGTTGGATTTGTAACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACaa < 2:719984/149‑1 (MQ=255) gATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAAc < 1:923983/149‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCt < 2:1264910/149‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTGAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCGCCGCTTAATTAAGCGGATTCTAGTAACACAGGACTTAATCATATTCAAGAGAAGTATAACCGAACACAccg > 2:966040/1‑148 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGc > 1:1218262/1‑149 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGc < 1:1383389/149‑1 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGc < 2:1702724/149‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGTATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGcc < 1:1044368/149‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGcc > 2:1225262/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAACCCTGccg > 1:867665/1‑148 (MQ=255) aaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTc > 2:1424681/1‑149 (MQ=255) aaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTc < 1:1712612/149‑1 (MQ=255) | AGTAATCACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTC > NC_000913/3083684‑3083976 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |