New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3083831 = | 123 (1.160) | 18 (0.180) | 10/276 | 8.3 | 13.7% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
? | NC_000913 | 3083868 = | 112 (1.130) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCA > NC_000913/3083724‑3084013 | ttCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGAtt > 1:719984/1‑149 (MQ=255) aTCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGt > 2:1090244/1‑149 (MQ=255) aTCGGCAGGCGTAAAAAACCAAACGCATTGGAAACCACTGAGTTATCGTATTGATTACCTAAGGTGCTCATGGATCGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTAGTTATGCCCGACGAGCAAGGTTTCGATTTGt > 2:1332773/1‑149 (MQ=255) aTCGGCAGGCGTAAAAAACAAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGCTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGt 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cgtTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAAc > 2:361296/1‑149 (MQ=255) gtTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACt > 1:1417515/1‑149 (MQ=255) ttAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTCCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACtg < 1:1002592/149‑1 (MQ=255) ggCCCCACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTCTCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACTCAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGATCtgttg < 1:1332773/149‑1 (MQ=255) gCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACtgttgt > 1:1253075/1‑149 (MQ=255) cccGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTgttgtt < 1:1090244/149‑1 (MQ=255) cccGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGAGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTgttgtt < 1:53429/149‑1 (MQ=255) acgaGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAg > 2:376360/1‑149 (MQ=255) acgaGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAg > 2:1690057/1‑149 (MQ=255) tggtaGGGTTGGATTTGTCTCAATAATTTGTGGCGGTTTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACTGGTCTTACTGATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGGCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGGTGTTc < 1:530316/145‑1 (MQ=255) aGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTc < 1:703438/149‑1 (MQ=255) aaGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGc < 2:1419147/149‑1 (MQ=255) aaGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGc < 2:1080752/149‑1 (MQ=255) ggTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGACCTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATc > 1:1148870/1‑149 (MQ=255) gTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCa < 1:8998/149‑1 (MQ=255) | TTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCA > NC_000913/3083724‑3084013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |