| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 503484 = | 89 (1.370) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 5.0% | coding (515/828 nt) | PP_0414 | polyamine ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 503527 = | 67 (1.080) | coding (558/828 nt) | PP_0414 | polyamine ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGGTGGCCAGTTACCTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCG > NC_002947/503337‑503629 | tcgcgaataccgctgaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccg < 6:250294‑M1/2‑1 (MQ=255) gctaataccgctgaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccgg > 6:213770‑M1/146‑148 (MQ=255) gcgaataccgctgaacatctgccgcgtcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccggc > 6:375786‑M1/146‑149 (MQ=255) gcgaataccgctgaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccggc < 5:83825‑M1/4‑1 (MQ=255) gcgaataccgctgaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccggc < 7:285065‑M1/4‑1 (MQ=255) cgaataccgctgaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcacccggcg > 8:251830‑M1/145‑149 (MQ=255) gCCAGTTACCTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCggcggc > 7:312665/1‑149 (MQ=255) cAGTTACCTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCggcggc > 3:121675/1‑147 (MQ=255) aCCTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGCTGCGTGCGGCGGCCAGCCTg > 3:63863/1‑149 (MQ=255) ccTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTgg < 2:254747/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTgg > 2:7721/1‑149 (MQ=255) ccTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTg < 4:271868/148‑1 (MQ=255) gaacatctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccCGGCGGCCAGCCTggg < 2:260042‑M1/16‑1 (MQ=255) cTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTggg > 8:248907/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTggg > 7:309948/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTggg > 7:277954/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTggg > 5:413173/1‑149 (MQ=255) tGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGg‑c > 1:199849/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGg‑cg > 2:318509/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGg‑cgc > 5:248484/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGg‑cgc > 5:254174/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGg‑c < 6:402509/147‑1 (MQ=255) ctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccc < 1:131883‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgccgcggcagtgttgcctgctccggcccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccc > 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ggCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTccg > 6:187839/1‑149 (MQ=255) gCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACctct < 7:62365/136‑1 (MQ=255) cAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTccgcc > 5:259790/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTccgccg > 8:339314/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGCGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTccgccg > 3:152848/1‑149 (MQ=255) aGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt < 3:98582/149‑1 (MQ=255) aGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt < 4:121675/149‑1 (MQ=255) gTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt > 2:214515/1‑148 (MQ=255) tCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGAc < 1:318509/148‑1 (MQ=255) ccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccCGGCGGCCAGCCTGGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGAc > 1:260042‑M1/100‑149 (MQ=255) 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gCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTACCACCTCGTCAAACGAggtgg > 7:231086/1‑149 (MQ=255) cAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggt < 1:370977/149‑1 (MQ=255) aGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGAc > 3:107397/1‑140 (MQ=255) aGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGAc < 4:107397/140‑1 (MQ=255) aGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtg < 1:95314/149‑1 (MQ=255) ggggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtgg < 6:254174/149‑1 (MQ=255) ggggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGGCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAggtggtgg < 6:248484/149‑1 (MQ=255) gggTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTACCACCTCGTCAAACGAggtggcaaa < 8:231086/149‑5 (MQ=255) gTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTAGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACTTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGa > 5:259590/1‑149 (MQ=255) aaCTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCt > 3:342280/1‑149 (MQ=255) cTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGt < 8:309948/149‑1 (MQ=255) cTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGt < 3:372495/149‑1 (MQ=255) tACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCgg < 8:296930/86‑1 (MQ=255) aCAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGGGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTc < 7:248907/149‑1 (MQ=255) cAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTcc > 8:285065/1‑149 (MQ=255) cAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTc < 6:47170/148‑1 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCt > 6:155742/1‑149 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCt > 3:282650/1‑149 (MQ=255) aaTCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTACGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGACACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCt > 7:283535/1‑149 (MQ=255) gtgcgtgcGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTTCCGATGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCATGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTTGTGGTGACTCTGTTCCTAgacgg > 8:232652/1‑149 (MQ=255) gcgtgcgGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgggc > 2:316692/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCgccgggccg > 5:323033/1‑147 (MQ=255) | GGGTGGCCAGTTACCTGTTCTTCGCCCCTCTGGGTATGGGCAACAGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCG > NC_002947/503337‑503629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |