| New junction evidence | |||||||||||
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AGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGA > NC_002947/503381‑503673 | aGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt < 3:98582/149‑1 (MQ=255)aGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt < 4:121675/149‑1 (MQ=255) gTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGt > 2:214515/1‑148 (MQ=255) tCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGAc < 1:318509/148‑1 (MQ=255) ccggcgaggaacagcgtcaccaccacctcgtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccCGGCGGCCAGCCTGGGGCGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGAc > 1:260042‑M1/100‑149 (MQ=255) ccTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTg > 1:272879/1‑149 (MQ=255) cTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCt < 4:133715/149‑1 (MQ=255) ttCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGAtt < 2:199849/149‑1 (MQ=255) gTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTgcgc < 5:187839/148‑1 (MQ=255) aTGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTGCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGgt < 8:32521/149‑1 (MQ=255) gCGGTACTGGTTGTGCTGTTGGTCATCTTTACCGTGTGTGCGACGGTGCTTGTGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCGAGGCTGGG‑GGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCGGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGgtg < 8:277954/148‑1 (MQ=255) gTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCAt > 2:57204/1‑149 (MQ=255) gtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCgg > 1:14298‑M1/71‑114 (MQ=255) gtcaaacgaggtggcaaaggcaaacagggctcccgagatgacaccgggcgcaatcagcggcagggtcaccCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCgg < 2:14298‑M1/44‑1 (MQ=255) tGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCg > 1:162408/1‑149 (MQ=255) 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ctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTACCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCcg > 7:124752/1‑135 (MQ=255) ctgGCTTTCCGCCGGGTGACCCTACCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCcg < 8:124752/135‑1 (MQ=255) cTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCgg > 2:333664/1‑148 (MQ=255) tttCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTa > 3:342554/1‑149 (MQ=255) cgccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcg > 8:251830‑M2/6‑149 (MQ=255) cgccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGACCGGTGTCATCTCGCGACCCCTGTTTGCCTTTTCCACCTCATTTGACGAGGTGGTGGTCACCCTGTTCCTCGCCGCGCCGGAGCAGGCAACACTTCCGCGGCAGATTTTAACCGGTATTcg > 2:310326/1‑149 (MQ=255) gccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc < 5:83825‑M2/145‑1 (MQ=255) gccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc < 7:285065‑M2/145‑1 (MQ=255) gccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGACGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTcgc > 6:375786‑M2/5‑149 (MQ=255) ccgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTagc > 6:213770‑M2/4‑148 (MQ=255) ggggTTATCCTGGCGCTTTTTGCGCCCTTTTTCATCTAGGTAGCCGTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGGTGTTCCTCGCCTTGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTAttgtcta < 8:283535/148‑6 (MQ=255) cgGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCga < 6:250294‑M2/147‑1 (MQ=255) gGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAg > 2:131883‑M2/2‑128 (MQ=255) gGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAg < 1:131883‑M2/127‑1 (MQ=255) | AGTTTCACCTCGCTGATTCTGGTGCATGCGGTACTGGGTGTGCCGTTCGTCATCATTACCGTGTCGGCGACGCTGCAGGGGTTCAACTACAATCTGGTGCGTGCGGCGGCCAGCCTGGG‑CGCTTCACCTCTGCTGGCTTTCCGCCGGGTGACCCTGCCGCTGATTGCGCCCGGTGTCATCTCGGGAGCCCTGTTTGCCTTTGCCACCTCGTTTGACGAGGTGGTGGTGACGCTGTTCCTCGCCGGGCCGGAGCAGGCAACACTGCCGCGGCAGATGTTCAGCGGTATTCGCGA > NC_002947/503381‑503673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |