New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 685159 | 76 (1.170) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 5.4% | coding (1088/2400 nt) | cadA‑II | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | = 685252 | 70 (1.150) | coding (995/2400 nt) | cadA‑II | cadmium translocating P‑type ATPase |
GTACCAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGAC > NC_002947/685013‑685307 | gTACCAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCgg > 2:71485/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGcc > 5:121519/1‑149 (MQ=255) cAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCtt > 5:285226/1‑149 (MQ=255) cAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCtt > 4:82751/1‑149 (MQ=255) aGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTc < 6:121519/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCg > 6:245116/4‑149 (MQ=255) gCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGTGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCg > 7:211463/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGc < 5:254506/149‑1 (MQ=255) gggACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGAt < 2:230596/149‑1 (MQ=255) ggACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATg < 6:285226/149‑1 (MQ=255) aCGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGgc < 3:236211/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGcc > 8:64431/1‑133 (MQ=255) ccTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGcc < 7:64431/133‑1 (MQ=255) ccTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTCGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCg < 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ccAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGTATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCg > 6:221799/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCa < 4:282532/119‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCa > 3:282532/1‑119 (MQ=255) ggTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGaa < 3:116938/147‑1 (MQ=255) ggTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGaa < 3:111388/147‑1 (MQ=255) gTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCg < 5:245116/149‑1 (MQ=255) ccgcagcCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCgg < 5:357606/147‑1 (MQ=255) cagcagCCatgccgatgaggccctgatcagcggcgagagcctgccagtgcccaagcaacccggtgacagcgtcaccggtggcgccatcaatggcgaaggccggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgctggcgc < 8:285464‑M1/149‑142 (MQ=255) cagcagCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgctggcgc < 3:168717‑M2/149‑49 (MQ=255) cagcagCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCgg < 6:107186/149‑1 (MQ=255) cagcagCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCgg > 8:144387/1‑149 (MQ=255) cagcagCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCCCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgctggcgc < 6:189428‑M2/149‑49 (MQ=255) gcagcCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGc < 4:292495/149‑1 (MQ=255) cagcCatgccgatgaggccctgatcagcggcgagagcctgccagtgcccaagcaacccggtgacagcgtcaccggtggcgccatcaatggcgaaggccggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgatggcgcgca > 5:150520‑M1/1‑5 (MQ=255) cagcCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCt > 3:124200/1‑149 (MQ=255) ccatgccgatgaggccctgatcagcggcgagagcctgccagtgcccaagcaacccggtgacagcgtcaccggtggcgccatcaatggcgaaggccggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgctggcgcgcatca > 3:385987‑M1/1‑2 (MQ=255) ccGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGa > 2:207683/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCCCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATggctgctggtgcgtacccaggcgctgggcaccgagaccgtgctggcgcgcatca > 5:189428‑M2/1‑95 (MQ=255) catgccgatgaggccctgatcagcggcgagagcctgccagtgcccaagcaacccggtgacagcgtcaccggtggcgccatcaatggcgaaggccggctgctggtgcgtacccaggagctgggcaccgagaccgtgctggcgcgcatcat > 8:373784‑M1/1‑1 (MQ=255) cGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGTGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGAc < 3:212835/149‑1 (MQ=255) | GTACCAGCACGGCCGGGACGAACACCTGGCTGACACGGTCGACCAGCTTCTGGATCGGCGCTTTGGCGGCCTGGGCGTCTTCCACCAGGCGGATGATGCGCGCCAGCACGGTCTCGGTGCCCAGCGCCTGGGTACGCACCAGCAGCCGGCCTTCGCCATTGATGGCGCCACCGGTGACGCTGTCACCGGGTTGCTTGGGCACTGGCAGGCTCTCGCCG‑CTGATCAGGGCCTCATCGGCATGGCTGCTGCCGTCTTCGACCACGCCGTCGACCGGGAAGCGTTCGCCGGGCTTGAC > NC_002947/685013‑685307 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |