| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1125330 | 77 (1.180) | 4 (0.060) | 3/254 | NT | 5.2% | coding (1217/1377 nt) | tdcG‑II | L‑serine dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 1125398 | 72 (1.150) | coding (1149/1377 nt) | tdcG‑II | L‑serine dehydratase | |||||
TGTTGACGGCCAGGCCGCCACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTACGAGGCCGCCGATCGGGTCGCAGGTCAGGCCCAGGTTGTGTTCCATGCCTATTTCGGCGGCGTTCTCCACCTGCTGCACGCTGCCGCCCATCACTTCGCA > NC_002947/1125184‑1125472 | tgTTGACGGCCAGGCCGCCACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTc < 2:51950/149‑1 (MQ=255) ttGACGGCCAGGCCGCCACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCAc > 6:225641/1‑149 (MQ=255) aCGGCCAGGCCGCCACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGa < 4:259597/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATc < 2:406335/149‑1 (MQ=255) gccgccACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCg < 7:223991/149‑1 (MQ=255) ccACGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCAtt < 6:266745/149‑1 (MQ=255) aCGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTgc > 1:268709/1‑149 (MQ=255) cGGGCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGAATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTgcg < 5:225641/149‑1 (MQ=255) gCGGTCTCTTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCt > 7:57238/1‑148 (MQ=255) tctTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTc < 3:294375/143‑1 (MQ=255) tctTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCAGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTc > 4:294375/1‑143 (MQ=255) ctTTGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCAAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAg > 8:270062/1‑149 (MQ=255) ctTTGTATTTGCTTTTAATGTCGGAGCAGGTATGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGAGACACGTAGTGCTGCCAGTCGCAGCGCAGGGCCATGCCTAACTCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCAATCGCATTGCGCTCGATAc > 2:127223/1‑147 (MQ=255) tttGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGGGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAgg > 1:282197/1‑149 (MQ=255) tttGTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAgg > 1:371119/1‑149 (MQ=255) gTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGc < 3:65596/148‑1 (MQ=255) gTATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCa > 6:167108/1‑149 (MQ=255) tATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCGGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGAAACAGGGCAc < 3:78498/149‑1 (MQ=255) tATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGGAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCAc < 2:371119/149‑1 (MQ=255) tATTTGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCAc < 2:268709/149‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTgacctgcgacccgatcggcggcctcgtacaggtgccctg > 5:395460‑M1/1‑110 (MQ=255) cTTTTCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTAc < 2:368721/149‑1 (MQ=255) cTTTTCATGTCGGCGCCGGTATTGCGGATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGAAACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGATCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTa < 8:177245/148‑1 (MQ=25) ttCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCg < 6:385366/129‑1 (MQ=255) ttCATGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCg > 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aTGTCGGCGCCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTACGAGgcc > 6:54389/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTCTGGCGCATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTACGAGGCCGCCGATc > 1:280969/1‑149 (MQ=255) gcgcATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTACGAGGCCGCCGATCGGGTCGCa < 1:269166/147‑1 (MQ=255) gcgcATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAGGGCACCTGTACGAGGCCGCCGATCGGGTCGCAg < 2:4484/148‑1 (MQ=255) gcATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAg > 3:27121/1‑113 (MQ=255) gcATGGTGCGGATGACCTTGTCCAGCGACACGTAGTGCTGCCCGTCGCCGCGCAGGGCCATGCGTACCGCGTTGATGGCCTTCACCGAGCCCATCGCATTGCGCTCGATACAg < 4:27121/113‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |