| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1785193 = | 57 (0.880) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.6% | noncoding (72/100 nt) | PP_mr21 | t44 ncRNA |
| ? | NC_002947 | 1785229 = | 59 (0.970) | intergenic (+8/‑18) | PP_mr21/rpsB | t44 ncRNA/30S ribosomal protein S2 | |||||
CTGACAGACGCAACAGTATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATGGGCAAGTACATTT > NC_002947/1785052‑1785340 | gacgatgtggatcttgttacgcgcgccgaaaatgtacttgcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggccttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTgg < 4:363469‑M1/8‑1 (MQ=255) gACGCAGCAGTATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTg < 8:292023/149‑1 (MQ=255) aCGCAACAGTATCAGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCgg < 6:369966/137‑1 (MQ=255) gCAACAGTATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGa > 7:101871/1‑149 (MQ=255) gTATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTg < 4:82106/149‑1 (MQ=255) tATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTg > 3:198276/1‑148 (MQ=255) tCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAg > 5:17098/1‑149 (MQ=255) ggTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGccc < 7:100085/149‑1 (MQ=255) cgaaaatgtacttgcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggccttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAAcc > 5:55849‑M1/116‑149 (MQ=255) aatgtacttgcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggccttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGACCCAACCCGAc > 2:277070‑M1/112‑149 (MQ=255) tcgcGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTa > 6:295286/1‑148 (MQ=255) gcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggtcttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTgg > 7:30368‑M1/103‑110 (MQ=255) gcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggtcttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTgg < 8:30368‑M1/8‑1 (MQ=255) gcccattttcgggttccagtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggccttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCaa > 2:106712‑M1/103‑147 (MQ=255) gtgGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAAc > 5:33831/1‑148 (MQ=255) ggTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTAt > 5:256567/1‑149 (MQ=255) gTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTAt > 2:3567/1‑148 (MQ=255) ataAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTcgc < 3:101592/94‑1 (MQ=255) ataAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTcgc > 4:101592/1‑94 (MQ=255) aaaaTGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGt > 7:159566/1‑149 (MQ=255) aaaTGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTc < 6:33831/149‑1 (MQ=255) cgccgcTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCaa < 5:267881/148‑1 (MQ=255) agtaacgggtctggtggccgaagtgcacaccggccttcagcatatcgcgcatgttgacttgggacatgatagttccttgataagtCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAAccc > 8:240988‑M1/86‑120 (MQ=255) gccgcTTTCGGGGACGACCACGTCAGCACTTAACACAAACAAGTGTAGAAACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTTGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAATGAACTATCATGTCCAAAg > 8:87122/1‑148 (MQ=255) ccgcTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATc > 2:55958/1‑137 (MQ=255) ccgcTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATc < 1:55958/137‑1 (MQ=255) tttCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGTCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTg < 6:127843/102‑1 (MQ=255) tttCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGTCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTg > 5:127843/1‑102 (MQ=255) gggACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATgcgc < 3:195908/149‑1 (MQ=255) ggACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGcgcg < 5:295286/149‑1 (MQ=255) acgacCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGa > 4:113050/1‑148 (MQ=255) acgacCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGa > 1:158055/1‑148 (MQ=255) gacCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGatat > 4:118402/1‑149 (MQ=255) ccccGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGata > 5:160736/1‑146 (MQ=255) ccccGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGata < 6:160736/146‑1 (MQ=255) ccccGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGc > 5:336839/1‑149 (MQ=255) ccGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGTTGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTg < 7:386220/149‑1 (MQ=255) gTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGaa < 1:147607/149‑1 (MQ=255) 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cacacaCGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACt < 6:17098/149‑1 (MQ=255) cacacaCGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACt > 6:314053/1‑149 (MQ=255) tgtCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGccac < 8:159566/149‑1 (MQ=255) tCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGccacca < 2:158055/149‑1 (MQ=255) acacGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGAc < 8:101871/149‑1 (MQ=255) 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gATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGt > 2:130765/1‑149 (MQ=255) tGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTa < 4:198276/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAg > 6:109067/1‑73 (MQ=255) ccTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAg < 5:109067/73‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTg < 1:3567/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTg < 5:314053/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGgt > 5:313422/1‑119 (MQ=255) cTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGgt < 6:313422/119‑1 (MQ=255) cTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTg > 1:102202/1‑148 (MQ=255) aGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATg < 3:113050/149‑1 (MQ=255) tCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATgt > 2:405324/1‑147 (MQ=255) cGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGAGATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATggg > 7:82450/1‑148 (MQ=255) cAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATGGGc > 7:77651/1‑147 (MQ=255) gAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATGGGCAAg > 8:209472/1‑148 (MQ=255) aTTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATGGGCAAGTa > 8:91011/1‑148 (MQ=255) gcgGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCAAAGTCAACATGCGCGATATGATGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCCCAAGACCCGTTACTGGACCCCGAAAATGCGCAAGTACAttt > 8:355951/1‑149 (MQ=255) | CTGACAGACGCAACAGTATCCGGGTTCCGTTCGCTCGCGGTCTGTGGTATAAAATGCGCCGCTTTCGGGGACGACCCCGTCAGCACTTAACCCACACACGTGTCGACACGATGACCTGGGTGCCCCGAGTCGCAGAATTCGCGGGTTGGTCATTGGGATACGTGGAGGCCCAACCCGACTTATCAAGGAACTATCATGTCCCAAGTCAACATGCGCGATATGCTGAAGGCCGGTGTGCACTTCGGCCACCAGACCCGTTACTGGAACCCGAAAATGGGCAAGTACATTT > NC_002947/1785052‑1785340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |