| New junction evidence | |||||||||||
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CAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTC > NC_002947/2331460‑2331755 | cAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCT < 3:337341‑M1/149‑1 (MQ=255)cAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCT > 4:8566‑M1/1‑149 (MQ=255) aGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACctg > 4:149511/1‑149 (MQ=255) aGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACctg < 8:1836/149‑1 (MQ=255) aGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTt < 2:318515‑M1/149‑2 (MQ=255) ccTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACctgct > 3:35962/1‑149 (MQ=255) cTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACctgctg > 5:322419/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCg > 2:246955/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCg < 6:312549/148‑1 (MQ=255) aGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGAGCTGGTGCCg‑g < 4:288276/148‑1 (MQ=255) cTTTGACACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGt > 2:71329/1‑149 (MQ=255) tttGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGt > 8:231002/1‑148 (MQ=255) tGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTc < 1:283805/148‑1 (MQ=255) caccacTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCGCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACgg < 2:199234/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTgctgccgtgaaccccggcagcag < 3:8566‑M1/149‑24 (MQ=255) tGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGcc > 5:131130/1‑148 (MQ=255) cgcATATCCTCTGGGAACCGGGCGCGGTGCAGCGGCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCGCGCCTTGGCATGCTCGATGAGCTGCTGCCG‑GGGTTCACTTCAGcag < 4:136073/147‑3 (MQ=255) aTCCTCTGCGAAGCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTtggctgccgtgaaccccggcagcaggtcat < 1:140509‑M1/149‑31 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |