New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2331608 | 64 (0.980) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 6.0% | coding (152/1164 nt) | PP_2049 | alcohol dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2331631 | 63 (1.010) | coding (175/1164 nt) | PP_2049 | alcohol dehydrogenase |
CCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTGGTTG > NC_002947/2331492‑2331778 | ccTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGgt < 7:231002/148‑1 (MQ=255) ctctGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGgtgt > 6:4338/1‑149 (MQ=255) tGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGACAGCCAAGGTCGGTGTGGc > 4:302987/1‑149 (MQ=255) cGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCCGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGc < 5:256666/147‑1 (MQ=255) cGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTgg < 4:388365/146‑1 (MQ=255) gAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAaggtc > 8:285573‑M2/1‑133 (MQ=255) gAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAaggtc < 7:285573‑M2/138‑6 (MQ=255) cccGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCtt < 5:4338/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGCGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCa < 1:71329/149‑1 (MQ=255) cgGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGGCCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAg < 3:239440/149‑1 (MQ=255) cgGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAg < 6:322419/149‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGt > 6:381250/1‑148 (MQ=255) aGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑Cg > 6:415664/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑Cgg < 5:381250/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAg < 1:39134/135‑1 (MQ=255) gCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAg > 2:39134/1‑135 (MQ=255) gCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGAccc > 3:286343/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGAcc < 3:149511/148‑1 (MQ=255) aGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCa > 6:264634/1‑149 (MQ=255) ggTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAg < 4:286343/149‑1 (MQ=255) tgCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGa < 3:23251/146‑1 (MQ=255) gTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGc > 2:50054/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGc < 4:340811/149‑1 (MQ=255) cgGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTgg > 7:36833/1‑149 (MQ=255) ggTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTggc > 5:19395/1‑149 (MQ=255) ccAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTATCGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTggcgg < 1:55052/148‑1 (MQ=255) gCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCa < 3:103204/122‑1 (MQ=255) gCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCa > 4:103204/1‑122 (MQ=255) tgtTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAgc < 7:190874/149‑1 (MQ=255) ttttGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCa < 8:222726/96‑1 (MQ=255) ttttGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCa > 7:222726/1‑96 (MQ=255) ttttGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAgcgc > 6:395427/1‑149 (MQ=255) tGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGGGGTACCGCCCAgcgcg > 1:343450/1‑149 (MQ=255) gATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGccc > 3:359262/1‑149 (MQ=255) ttATCAGGGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCgg < 6:336822/149‑1 (MQ=255) tATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCgg < 3:352092/148‑1 (MQ=255) tATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCgg > 4:352092/1‑148 (MQ=255) aTCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑Ca > 1:166608/1‑149 (MQ=255) tCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑Ca > 2:231964/1‑148 (MQ=255) tGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCg < 1:246955/149‑1 (MQ=255) ccGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCAG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGACCGG‑CATATCGgcgc > 4:166262/1‑149 (MQ=255) cccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCtggtg > 8:120904/1‑149 (MQ=255) cgctTTGGCTTGGTGGATGACCTGCTGGGG‑GGGTTGACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATGTTCTGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGGGCCCGG‑CTTATCGGCGCCGACCtggtggt < 8:36833/149‑1 (MQ=255) gccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATTGGCGCCGACCtggtggtg < 5:264634/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCtggtggtgg > 5:294453/1‑149 (MQ=255) cTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTggg < 6:19395/149‑1 (MQ=255) gCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTc > 2:395182/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcgg > 6:255941/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggc < 3:80768/149‑1 (MQ=255) cTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggcgg < 5:395427/149‑1 (MQ=255) tCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggcggc > 7:354078/1‑149 (MQ=255) gATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAaggtcatcgagcatgccaaggcgggcgatacccgggtcactgataatcaaaacacgcttggcaccgcgctcacggcacagacctgcaaggcgc < 8:133503‑M2/124‑94 (MQ=255) gATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAaggtcatcgagcatgccaaggcgggcgatacccgggtcactgataatcaaaacacgcttggcaccgcgctcacggcacagacctgcaaggcgc > 7:133503‑M2/1‑31 (MQ=255) gATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggcggcgg > 6:59327/1‑149 (MQ=255) gATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggcggcgg > 8:341537/1‑149 (MQ=255) gATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggcatccg > 5:27057/1‑144 (MQ=255) aTGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAaggtcatcgagcatgccaaggcgggcgatacccgggtcactgataatcaaaacacgcttggcaccgcgctcacggcacagacctgcaaggcgctgcaccgcgccggcttcgcagaggat < 1:140509‑M2/149‑120 (MQ=255) tGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCa < 6:131130/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGGCCATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggc < 1:54686/141‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTcggc > 2:54686/1‑140 (MQ=255) ctgctgCCG‑GGGTTCACGGCAGC‑ggtcatcgagcatgccaaggcgggcgatacccgggtcactgataatcaaaacacgcttggcaccgcgctcacggcacagacctgcaaggcgctgcaccgcgccgggttcgcagaggatctgcgca < 3:8566‑M2/149‑126 (MQ=255) tgctgcCG‑GGGTACACGGCAGCCAAGGACGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCAGACACCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTc > 6:140899/1‑148 (MQ=255) ctgcCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCgat < 4:35962/149‑1 (MQ=255) cG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCgatggat < 1:231964/149‑1 (MQ=255) cG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCgatggat > 2:289339/1‑149 (MQ=255) gggTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGAtgt > 1:40069/1‑149 (MQ=255) gTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTgg < 6:294453/149‑1 (MQ=255) cACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGcc < 1:395182/148‑1 (MQ=255) aCGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGcc > 4:363893/1‑147 (MQ=255) aCGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCaa < 8:354078/149‑1 (MQ=255) aCGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCaa < 5:59327/149‑1 (MQ=255) aGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTgg < 5:255941/149‑1 (MQ=255) aGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTgg < 2:166608/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CACATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTGGtt > 4:168645/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTGGTTg > 8:179679/1‑149 (MQ=255) aaggtcatcgagcatgccaaggcgggcgatacccgggtcactgataatcaaaacacgcttggcaccgcgctcacggcacagacctgcaaggcgctgcaccgcgccgggttcgcagaggatctgcgcagtggtggcaaagctgaaaggct < 2:318515‑M2/149‑149 (MQ=255) | CCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCG‑GGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTA‑CGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGG‑‑CCGCCCAGCGCGCCCGG‑CATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGGGGTTCGGCGGCGGCAGCTCGATGGATGTGGCCAAGCTGGTTG > NC_002947/2331492‑2331778 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |