New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2510081 = | 71 (1.090) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 5.9% | coding (1650/1725 nt) | copA‑I | copper resistance protein A |
? | NC_002947 | 2510127 = | 58 (0.920) | coding (1604/1725 nt) | copA‑I | copper resistance protein A |
CATCGCCCGTTCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCG > NC_002947/2509939‑2510228 | gctCGCCAGTGAACGGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAggcccagcggcccagc > 6:164486/3‑149 (MQ=255) cATCGCCCGTTCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAggcccagcggcccagc > 7:354557/1‑149 (MQ=255) cccGTTCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTc > 2:32551/1‑149 (MQ=255) gTTCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTcggc > 1:387828/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTcggcg < 1:360059/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGt > 6:414954/1‑148 (MQ=255) cTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCa > 5:419166/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCAc > 7:192319/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCAAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCAc > 7:192324/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCgg > 6:108799/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCgg < 6:419166/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTa < 8:194191/149‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGt < 3:67930/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTg > 6:94509/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCg > 5:177511/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCg > 3:214516/1‑149 (MQ=255) atcaccctggtcaacgacaccatgatgacccaccccatccacctgcacggcatgtggagcgacatggaagacgagcatggccagttcctggtgcgcaagcacaccgtcgatatcccGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCg < 8:26705‑M1/33‑1 (MQ=255) agcagcGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTc > 1:241079/1‑149 (MQ=255) cagcGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGCTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGCCCCAGCGCCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGCTAGGTGCGTCgg > 4:5312/1‑149 (MQ=255) agcGCCACGCCTGCCACGAAGCTGAGGTTGAGTGTGTCATTCATCGACGCGTACATCGCGGAGCATGACGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTCGCAGTGTTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCAAACGGTAGGTGCGTCgga > 6:11850/1‑148 (MQ=255) aCGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgg > 3:331180/1‑149 (MQ=255) ccTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgggcg < 5:414954/149‑1 (MQ=255) acgacaccatgatgacccaccccatccacctgcacggcatgtggagcgacctggaagacgagcatggccagttcctggtgcgcaagcacaccgtcgatatcccGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgggc > 7:26705‑M1/104‑149 (MQ=255) cTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgggcgg < 3:287625/149‑1 (MQ=255) cACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGata > 2:143116/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACg < 2:293008/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACg < 6:177511/149‑1 (MQ=255) tGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGgt > 2:150026/1‑149 (MQ=255) cGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGCCGgt < 6:362223/147‑1 (MQ=255) cGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGgt < 1:32551/147‑1 (MQ=255) ttGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCt < 5:164486/149‑1 (MQ=255) gtgtCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGat < 2:129560/129‑1 (MQ=255) gtgtCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGat > 1:129560/1‑129 (MQ=255) tgtCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCAc > 6:32096/1‑149 (MQ=255) attcatCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCTGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAgg < 3:5312/149‑1 (MQ=255) attcatCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTCTTCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAg > 1:271747/1‑149 (MQ=255) acggcatgtggagcgacctggaagacgagcatggccagttcctggtgcgcaagcacaccgtcgatatcccGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgggcg < 6:200756‑M1/47‑1 (MQ=255) acggcatgtggagcgacctggaagacgagcatggccagttcctggtgcgcaagcacaccgtcgatatcccGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCcgggcg > 5:200756‑M1/71‑117 (MQ=255) agcgTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCa < 8:354557/148‑1 (MQ=255) cgTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATg < 5:32096/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGc < 3:335548/90‑1 (MQ=255) ccTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGc > 4:335548/1‑90 (MQ=255) tCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTc > 3:116870/1‑149 (MQ=255) cgGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGTCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTATGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGTATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTc < 5:11850/149‑1 (MQ=255) cgGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTc < 5:108799/149‑1 (MQ=255) ggAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTcc < 8:131970/149‑1 (MQ=255) ggAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTc > 7:131970/1‑148 (MQ=255) gAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCa < 5:226373/149‑1 (MQ=255) gCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGc > 6:164130/1‑149 (MQ=255) cGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTc < 2:241079/149‑1 (MQ=255) tc‑tcCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGGCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCcac < 2:387828/149‑1 (MQ=255) tcCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAg > 4:224006/1‑137 (MQ=255) tcCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAg < 3:224006/137‑1 (MQ=255) cATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGc > 5:274059/1‑149 (MQ=255) tgGTAGAGCAAGTGGGAGTGGTAGGCCAAGCGGCCAAGCGCGTCGCCACTCACCCTGTAGCTGCGACGGCTGCCGGGCGGGAAATCGACGGTGTGCTTTCCCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTACACATGcc > 6:387121/1‑146 (MQ=255) gTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCa < 4:214516/149‑1 (MQ=255) agagCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGgtg < 1:250509/89‑1 (MQ=255) agagCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGgtg > 2:250509/1‑89 (MQ=255) gagCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTg < 1:406134/108‑1 (MQ=255) gagCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTg > 2:406134/1‑108 (MQ=255) gagCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGt > 1:155771/1‑149 (MQ=255) cAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCTCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACCTGCACGGCATGTGGa < 8:110169/149‑1 (MQ=255) cAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACCTGCACGGCATGTGGa < 8:192319/149‑1 (MQ=255) cAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACCTGCACGGCATGTGGa < 5:94509/149‑1 (MQ=255) aaGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCtt < 6:400573/89‑1 (MQ=255) aaGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCtt > 5:400573/1‑89 (MQ=255) aGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATg > 8:144165/1‑149 (MQ=255) gTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATgg > 4:90318/1‑149 (MQ=255) tGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAgg > 8:210336/1‑141 (MQ=255) tGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAgg < 7:210336/141‑1 (MQ=255) gCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGt > 5:194208/1‑140 (MQ=255) gCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGt < 6:194208/140‑1 (MQ=255) gCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGgggt > 3:82199/1‑149 (MQ=255) gTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGtca > 5:14156/1‑149 (MQ=255) cgcagcggcccagcgCGTCGGCAGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGTAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATg < 5:387121/147‑1 (MQ=255) cccagcggcccagcgCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATg < 6:274059/149‑1 (MQ=255) cagcggcccagcgCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGgt < 1:143116/149‑1 (MQ=255) cggcccagcgCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTc < 7:144165/149‑1 (MQ=255) cggcccagcgCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTc < 2:271747/149‑1 (MQ=255) ggcccagcgCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCg > 3:196215/1‑149 (MQ=255) | CATCGCCCGTTCACTGGCGAGCAAGGTCAGCAGCGCCACGCCTGCCACGAAGCTGCGGTTGCGGGTGTCATTCATCGACGCGTACCTCGCGGAGCATGCCGGTC‑TCCATGTGGTAGAGCAAGTGGCAGTGGTAGGCCCAGCGGCCCAGCGCGTCGGCGGTCACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCG > NC_002947/2509939‑2510228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |