New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3568272 | 57 (0.880) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.3% | coding (829/1998 nt) | PP_3150 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3568302 | 54 (0.880) | coding (859/1998 nt) | PP_3150 | hypothetical protein |
TGACTGAAGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCA > NC_002947/3568126‑3568420 | tcagtcaaGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCaa < 5:311044/142‑1 (MQ=255) tGAAGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGt > 2:228375/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGt > 3:14227/1‑149 (MQ=255) aaGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACGGCACCAAGCTGTc < 2:63044/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGgc > 5:153288/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTc > 4:78803/1‑143 (MQ=255) cAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTc < 3:78803/143‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCa < 5:288896/149‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCa < 7:282333/149‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCCTGACCTCACCAGCACCGGCTGGCGATAGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCGGTCCAGGCGcccccc > 7:256962/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGa < 6:153288/149‑1 (MQ=255) cgcTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGaa < 7:40961/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAgcgc < 1:174354/148‑1 (MQ=255) gcgcGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGt < 6:86458‑M2/149‑2 (MQ=255) gcgGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtgg < 2:132204‑M2/149‑4 (MQ=255) gTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcg < 1:64844‑M2/149‑8 (MQ=255) gTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcg < 4:45708‑M2/149‑8 (MQ=255) aaGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCActtgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggta > 3:267908‑M1/1‑109 (MQ=255) aaGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctg < 4:261885/149‑1 (MQ=255) aGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCActtgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtac < 4:328102‑M1/149‑42 (MQ=255) ggACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctggc < 1:228375/149‑1 (MQ=255) ggACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctggc < 3:49938/149‑1 (MQ=255) gACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTGTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctgg > 1:25035/1‑148 (MQ=255) gACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctggct < 3:52128/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGt < 5:86458/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCActtgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtacggatc < 4:267908‑M1/149‑47 (MQ=255) ccgccTATACCGCGATGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACGAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTTTACTGGCGCCCGCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGTCTGTCCATc < 4:149274/149‑1 (MQ=255) cgccTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATcc < 1:132204/149‑1 (MQ=255) ccTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATcc > 3:111672/1‑147 (MQ=255) ccTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCa < 1:346292/149‑1 (MQ=255) cTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATcc > 2:218051/1‑146 (MQ=255) ccGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATc > 8:234870/1‑149 (MQ=255) aCCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGc < 1:363568/148‑1 (MQ=255) aCCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCt > 8:96427/1‑149 (MQ=255) cT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCg > 5:245158/1‑149 (MQ=255) ccAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAgcgc > 1:163780/1‑149 (MQ=255) aCTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGt > 5:161404/1‑148 (MQ=255) cTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAgcgc < 7:202448/141‑1 (MQ=255) cTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAgcgc > 8:202448/1‑141 (MQ=255) cTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAtgtg < 7:96427/149‑1 (MQ=255) tgctCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtg > 4:34999/1‑149 (MQ=255) ctCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgt < 1:4990/148‑1 (MQ=255) ctCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgt < 4:14227/148‑1 (MQ=255) ctCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgt < 2:64844/148‑1 (MQ=255) tCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCAACAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCTGCCCGCTAGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgtg > 3:305193/1‑148 (MQ=255) aaCCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTAt > 3:301436/1‑149 (MQ=255) aCCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATc > 4:308628/1‑149 (MQ=255) cTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGt > 8:34650/1‑149 (MQ=255) cTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGt > 2:125242/1‑149 (MQ=255) cAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCa > 7:207054/1‑149 (MQ=255) aaCGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGtt < 4:111672/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCt > 4:18467/1‑149 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAAGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCca > 5:354048/1‑149 (MQ=255) gCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCca > 7:349559/1‑147 (MQ=255) gATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGt < 6:354048/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCAGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGc < 2:25035/149‑1 (MQ=255) gcgATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGa > 4:230871/1‑148 (MQ=255) cgATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATa < 2:163780/149‑1 (MQ=255) gATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagc < 4:267908‑M2/149‑104 (MQ=255) gATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCGTCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATAc > 5:243962/1‑149 (MQ=255) aTCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATAcc < 3:308628/149‑1 (MQ=255) tCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATAcc > 2:207510/1‑148 (MQ=255) gTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtcct < 4:328102‑M2/149‑109 (MQ=255) tACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtcctt > 3:267908‑M2/1‑40 (MQ=255) ccGCACCAAGCTGTCCTGTCGCCCCCAGGAATCGCAACTGGTGCGCTGGATATCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATCTGCTTGCCTTGAGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCta > 6:153042/1‑147 (MQ=255) ccGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCtt > 8:162111/1‑148 (MQ=255) ccGCACCAAGCTCTCCTGGCGCCCCCAGCAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTCATCTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCtt > 7:127087/1‑148 (MQ=255) cGCACCActtgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtccttgac < 1:64844‑M1/149‑143 (MQ=255) cGCACCActtgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtccttgac < 4:45708‑M1/149‑143 (MQ=255) cGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCGTCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCa < 6:243962/149‑1 (MQ=255) cACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGc > 8:376774/1‑149 (MQ=255) ccacttgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtccttgacccgc < 2:132204‑M1/149‑147 (MQ=255) cAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAg > 6:187889/1‑145 (MQ=255) cAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAg < 5:187889/145‑1 (MQ=255) cAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTg > 6:18871/1‑148 (MQ=255) acttgcgcttcctgggggcgccaggacagcttggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtccttgacccgcgc < 6:86458‑M1/149‑149 (MQ=255) | TGACTGAAGGCCAGTTGCGCGCGCTGCAGGCGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCT‑TCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCA > NC_002947/3568126‑3568420 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |