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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTG > NC_002947/3787762‑3788053 | ggTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTc > 1:40739/1‑148 (MQ=255)agtgcctgatggcggccgaacagccgcgtgccgaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTc < 6:305570‑M1/2‑1 (MQ=255)agtgcctgatggcggccgaacagccgcgagccgaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgcaggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaacgctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTc < 5:275655‑M1/2‑1 (MQ=255) gCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCacgac > 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8:18890‑M1/17‑149 (MQ=255) cggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTc < 2:353534‑M1/79‑1 (MQ=255) gCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcaca > 5:65429‑M2/1‑43 (MQ=255) cAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctaccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagc < 4:397537‑M2/148‑107 (MQ=255) ggTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaa > 4:35627‑M2/1‑40 (MQ=255) gtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttgaggttga > 8:86740‑M1/9‑149 (MQ=255) gTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaat < 4:324350‑M2/149‑111 (MQ=255) gTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggtcttcagcgggcgcacagcgaat > 5:246792‑M2/1‑39 (MQ=255) ccATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCATAtccacgacgccgaaagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatg < 5:251393‑M2/148‑112 (MQ=255) ccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGc < 1:369107‑M1/144‑1 (MQ=255) cATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgc > 6:275655‑M2/1‑36 (MQ=255) taTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGAtgtt > 8:25790‑M1/3‑54 (MQ=255) taTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGAtgtt < 7:25790‑M1/52‑1 (MQ=255) taTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCaa > 4:83028‑M1/3‑76 (MQ=255) taTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCaa < 3:83028‑M1/74‑1 (MQ=255) ttCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatc < 1:358719‑M2/147‑116 (MQ=255) | GGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTG > NC_002947/3787762‑3788053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |