| Predicted mutation | |||||||
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| ? | NC_002947 | = 3787938 | 10 (0.150) | coding (697/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
AGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGAT > NC_002947/3787793‑3788082 | cgaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTagag < 2:88126‑M1/34‑1 (MQ=255)aGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGAGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCAGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAACGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtc < 5:275655‑M2/148‑3 (MQ=255) gaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAgg < 6:133441‑M1/35‑1 (MQ=255) gaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAgg < 7:86740‑M1/35‑1 (MQ=255) gaaagtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAgg < 6:246792‑M1/35‑1 (MQ=255) agtgtagcgctgctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCg < 1:368336‑M1/38‑1 (MQ=255) ctcgtcacccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGa > 6:409420‑M1/100‑147 (MQ=255) acccgactcgccggccagggtgcggtcgtcggtttccaggccaaaggctagcaggtccatgttccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtaTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGAtgttgttg < 8:90048‑M1/56‑1 (MQ=255) 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cACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGgcgcg > 3:250232/1‑149 (MQ=255) gacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgc > 5:305570‑M2/1‑26 (MQ=255) gacgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCAc < 4:250232/149‑1 (MQ=255) cgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttg < 1:268204/127‑1 (MQ=255) cgCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCttg > 2:268204/1‑127 (MQ=255) gCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGcc > 7:290499/1‑149 (MQ=255) aGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCATAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCg > 3:313058/1‑147 (MQ=255) gCGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtcctt > 8:18890‑M2/1‑16 (MQ=255) cGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtc > 1:353534‑M2/1‑15 (MQ=255) cGGCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtc < 2:353534‑M2/94‑80 (MQ=255) ggCAAGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttga > 7:90048‑M2/1‑14 (MQ=255) aaGGTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttga > 1:56540‑M2/1‑11 (MQ=255) aaGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAg > 5:287909/1‑149 (MQ=255) gTGCCGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttga > 8:86740‑M2/1‑8 (MQ=255) tGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCgg < 8:290499/149‑1 (MQ=255) ccGTAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaactgtcttcaccggttttcagcgggcgcacagcgaatgcatccagcttgcgtccgtccttgaggttgaggc < 1:369107‑M2/149‑145 (MQ=255) tAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgttgttgttgctgccatcgtcccaa < 3:83028‑M2/76‑75 (MQ=255) tAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgtt > 8:25790‑M2/1‑2 (MQ=255) tAtccacgacgccgacagcggcaaggtgccgtagaggccgtagaatttgatgtt < 7:25790‑M2/54‑53 (MQ=255) tAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAg > 4:401957/1‑135 (MQ=255) | AGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTGCGGTCGTCGGTTTCCAGGCCAAAGGCTAGCAGGTCCATGTTCCACGACGCCGACAGCGGCAAGGTGCCGTAGAGGCCGTAGAATTTGATGTTGTTGTTGCTGCCATCGTCCCAACTGTCTTCACCGGTTTTCAGCGGGCGCACAGCGAATGCATCCAGCTTGCGTCCGTCCTTGAGGTTGAGGCTGGCGCGCACGCCGTCGAAGCTCAGGCGGAT > NC_002947/3787793‑3788082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |