New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3895667 | 60 (0.920) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 6.6% | coding (318/582 nt) | PP_3438 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 3895689 | 57 (0.930) | coding (340/582 nt) | PP_3438 | membrane protein |
CCTGCATCAACTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGATCTGTTTCATCTCGGTAGCCTGC > NC_002947/3895523‑3895814 | ccTGCATCAACTACTGTTACGCTGGCCCTTTCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGAGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTTGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTgg > 6:332943/1‑148 (MQ=255) tCAACTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGgcg > 5:137914/1‑149 (MQ=255) cAACTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTg > 8:344756/1‑140 (MQ=255) cAACTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTg < 7:344756/140‑1 (MQ=255) aaCTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCa < 5:177482/149‑1 (MQ=255) actactGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAg > 3:215881/1‑149 (MQ=255) tGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATg > 2:255558/1‑149 (MQ=255) gTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATg > 3:222929/1‑148 (MQ=255) ttACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTg < 2:126795/131‑1 (MQ=255) ttACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTg > 1:126795/1‑131 (MQ=255) aCGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGTGTGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAg > 1:209843/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTgg < 3:88861‑M2/149‑3 (MQ=255) gCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCactgcatcgctgcgccgtgccaggctg > 4:354552‑M1/1‑121 (MQ=255) gCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTggctg > 5:55054‑M2/1‑143 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGa > 1:15951/1‑149 (MQ=255) cTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCACAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGAt > 7:248393/1‑149 (MQ=255) aacGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACgg > 5:249108/1‑149 (MQ=255) acaGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGa > 2:119886/1‑149 (MQ=255) caGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGAt < 4:10596/149‑1 (MQ=255) 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cccTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagc < 3:225399‑M2/147‑116 (MQ=255) ccTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagcaag < 6:399456‑M2/149‑119 (MQ=255) cTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGATCTGTTTCATCTCGGTa < 2:263949/149‑1 (MQ=255) ttCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGATCTGTTTCATCTCGGTAg > 2:379752/1‑149 (MQ=255) cAGCCactgcatcgctgcgccgtgccaggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagcaagggc > 5:55054‑M1/1‑5 (MQ=255) cAGCCactgcatcgctgcgccgtgccaggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagcaagggc < 1:213982‑M1/148‑144 (MQ=255) cAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagcaagggc > 4:354552‑M2/1‑27 (MQ=255) ccactgcatcgctgcgccgtgccaggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaacatcaggcccagcaagggccagc < 3:88861‑M1/149‑148 (MQ=255) ccactgcatcgctgcgccgtgccaggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaa < 6:117304‑M1/126‑125 (MQ=255) ccactgcatcgctgcgccgtgccaggctgaaggggcttggctaggctgtgcgttgttcaggttaccgtcgtcactggccagcttccacgccatgtacagcagaaacgctacaccgccccagtgcaa > 5:117304‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGATCTGTTTCATCTCGGTAGCctgc > 3:64560/1‑149 (MQ=255) | CCTGCATCAACTACTGTTACGCTGGCCCTTGCTGGGCCTGATGT‑TGCACTGGGGCGGTGTAGCGTTTCTGCTGTACATGGCGTGGAAGCTGGCCAGTGACGACGGTAACCTGAACAACGCACAGCCTAGCCAAGCCCCTTCAGCCTGGCACGGCGCAGCGATGCAGTGGCTGAACCCCAAAGCCTGGTTGGCAGCCGTTGCCGGGGTGGGTGCCTACACCGGCGGTGAACAGCACTTGCTGTGGCTGTTTACCTGGATCTACGGGCCGATCTGTTTCATCTCGGTAGCCTGC > NC_002947/3895523‑3895814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |