New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4168379 | 55 (0.850) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (1514/2256 nt) | katG | catalase‑peroxidase |
? | NC_002947 | = 4168417 | 50 (0.810) | coding (1476/2256 nt) | katG | catalase‑peroxidase |
TCAGGTCAGCCAGGGAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTGGGCAACGGGT > NC_002947/4168233‑4168526 | tCAGGTCAGCCAGGGAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCgcg‑c < 1:160991/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCCAGGGAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTg > 1:122015/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCCAGGGAAACCTTCTTGCAGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGACGCCAGCACCTTGTCCACGCACTGGTTTGAAGCACAGTCCTTCTTTGGCGCAAAGCGAAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑Cttt > 7:280619/1‑148 (MQ=255) gggAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGt < 5:58189/141‑1 (MQ=255) gggAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGt > 6:58189/1‑141 (MQ=255) aaaCCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCcgcg > 5:76655/1‑148 (MQ=255) ttcttGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGt > 1:179874/1‑149 (MQ=255) tGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGGGCCGCGGAAGGTCGAc > 1:7993/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGAcgc > 1:214950/1‑149 (MQ=255) ctgTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGc < 6:99577/149‑1 (MQ=255) tgTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGcc > 7:165450/1‑149 (MQ=255) ttGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCCTTGGCACCACCCCG‑CTAGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGcc > 5:281853/1‑147 (MQ=255) aCTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcg < 1:170718‑M2/149‑4 (MQ=255) cTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCAGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcgg < 6:386821‑M2/149‑5 (MQ=255) tCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggt < 4:54280‑M2/149‑6 (MQ=255) gCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtg < 7:48459‑M1/148‑45 (MQ=255) cccTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggtg < 5:153329‑M2/147‑7 (MQ=255) cccTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGga < 6:184602/149‑1 (MQ=255) ccTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggtg < 1:143614‑M2/146‑7 (MQ=255) cTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGga‑ga < 4:198472/149‑1 (MQ=255) gATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGAt > 3:322439/1‑130 (MQ=255) gATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGAt < 4:322439/130‑1 (MQ=255) gATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCa < 2:214950/149‑1 (MQ=255) tcttctCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGt > 5:24036/1‑149 (MQ=255) tctcCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCg > 5:67109/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGccc < 6:67109/148‑1 (MQ=255) gccAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtg < 7:199766‑M1/129‑48 (MQ=255) gccAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtg > 8:199766‑M1/1‑82 (MQ=255) aGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCgg > 1:287809/1‑96 (MQ=255) aGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCgg < 2:287809/96‑1 (MQ=255) cACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCg < 4:318094/149‑1 (MQ=255) ttGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGc > 4:55081/1‑149 (MQ=255) tCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCa < 6:24036/148‑1 (MQ=255) cACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAgg > 2:116362/1‑148 (MQ=255) aCGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGAt > 4:377825/1‑149 (MQ=255) tccatGGTTTGAAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAATCGAAAACGTTCGCCGTTCGCACGACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAATGTCGACTCGGATGCACATGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTAAAAAGCGAGGCCAGGATca < 8:280619/145‑2 (MQ=255) gCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGccc > 7:30665/1‑124 (MQ=255) gCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGccc < 8:30665/124‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTg < 6:76655/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTg < 2:122015/149‑1 (MQ=255) cTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGG‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTg > 5:351384/1‑148 (MQ=255) gTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTCGCAACAACGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACCCTCAACCCCGAGGCCACGATCCTCGACt > 8:81359/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGa < 3:54280/148‑1 (MQ=255) cAGCCCAGTCGTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTTCGCCGTTGGCACCACCGCG‑GTTGTGGGAGGCGCGGAAGGTCGACGGGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCAAGCTGATACCCGAGGCCTGTATCCTGGACTTGAgg < 7:81359/149‑1 (MQ=255) gTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGa < 4:93863/149‑1 (MQ=255) cTGTGGCGGCAAGGGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGTCGGGGATGCCCAGGGGGTGGATTACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTc < 1:116362/148‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTc < 5:386821/147‑1 (MQ=255) tgGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAggg < 7:142418/134‑1 (MQ=255) tgGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAggg > 8:142418/1‑134 (MQ=255) tgGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTg < 3:55081/147‑1 (MQ=255) tgGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGc < 2:170718/148‑1 (MQ=255) gcgcAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCGTCTTGACGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATc > 1:243252/1‑149 (MQ=255) cAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTg > 7:240032/1‑148 (MQ=255) aaaGGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGa < 6:281853/149‑1 (MQ=255) aaaCGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACg > 4:332849/1‑87 (MQ=255) aaaCGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACg < 3:332849/87‑1 (MQ=255) aCGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGAt > 7:304230/1‑148 (MQ=255) aCGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGAt < 8:304230/148‑1 (MQ=255) aCGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATg > 4:36711/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATgg < 2:179874/149‑1 (MQ=255) gcCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAg > 6:383181/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGAAGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGc > 1:298451/1‑149 (MQ=255) cGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCt > 3:87103/1‑149 (MQ=255) ggCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTg < 5:383181/148‑1 (MQ=255) caccacCGCG‑CTTGTCGGGGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTGGGc < 2:7993/149‑1 (MQ=255) caccacCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggc < 7:199766‑M2/129‑83 (MQ=255) caccacCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggc > 8:199766‑M2/1‑47 (MQ=255) caccGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggcggcattggagaagatccaggg < 5:153329‑M1/147‑142 (MQ=255) caccGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggcggcattggagaagatccagg < 1:143614‑M1/146‑141 (MQ=255) caccGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggcggcattggagaagatccagggc < 7:48459‑M2/148‑105 (MQ=255) caccGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTGGGCAAc > 3:151309/1‑149 (MQ=255) accGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggcggcattggagaagatccagggcga < 4:54280‑M1/149‑145 (MQ=255) ccGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggctgcattggagaagatccagggcgag < 6:386821‑M1/149‑146 (MQ=255) cGCctgggcatccgcgtcgaccttccgcggctccgacaagcgcggtggtgccaacggcgcacgtttgcgcttggcgccacagaaggactgggctgcaaaccagggcgtggacaaggtgctggcggcattggagaagatccagggcgagt < 1:170718‑M1/149‑147 (MQ=255) gcg‑cTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTGGGCAACGGGt > 7:14558/1‑149 (MQ=255) cg‑cTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGa < 7:244095/94‑1 (MQ=255) cg‑cTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGa > 8:244095/1‑94 (MQ=255) | TCAGGTCAGCCAGGGAAACCTTCTTGCCGCTGCTGTTGAACTCGCCCTGGATCTTCTCCAATGCCGCCAGCACCTTGTCCACGCCCTGGTTTGCAGCCCAGTCCTTCTGTGGCGCCAAGCGCAAACGTGCGCCGTTGGCACCACCGCG‑CTTGTCGGAGCCGCGGAAGGTCGACGCGGATGCCCAGGCGGTGGA‑GACCAGTTCGCCCACGCTCAAACCCGAGGCCAGGATCCTGGACTTGAGGGTCGCGATGTCTTGCTCGCTGATCGTGGATGGGTCAGCTTTGGGCAACGGGT > NC_002947/4168233‑4168526 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |