| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ACGGCTTCAGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGC > NC_002947/5619074‑5619368 | aCGGCTTCAGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATg < 5:364997/149‑1 (MQ=255) ggCTTCAGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCGCCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAATCGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGCCATgc < 1:104974/149‑1 (MQ=255) ggCTTCAGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCA‑CCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATgcgc > 3:27559/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTTGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCttttt < 5:203411/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCttttt < 8:55407/149‑1 (MQ=255) gCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTg > 3:61668/1‑149 (MQ=255) cTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTgc > 6:110198/1‑149 (MQ=255) tGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTgcg > 7:39318/1‑149 (MQ=255) ggACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGcgcc > 1:302727/1‑149 (MQ=255) acTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGcgcccgc > 4:242108/1‑148 (MQ=255) ttACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCAc > 5:66083/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtcgg < 4:68074‑M2/149‑7 (MQ=255) ccACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtct > 6:66083‑M2/1‑142 (MQ=255) 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gTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcg < 2:285966‑M2/149‑119 (MQ=255) gTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTcc < 3:100112/109‑1 (MQ=255) gTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTcc > 4:100112/1‑109 (MQ=255) gTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAg < 2:335135/149‑1 (MQ=255) ggCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgtg < 6:374752‑M2/149‑121 (MQ=255) ggCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgtg < 6:383836‑M2/149‑121 (MQ=255) gCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTc < 3:339263/149‑1 (MQ=255) ccGACAgtggcgggcgcaaaaagcgcatgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgtggc < 4:68074‑M1/149‑144 (MQ=255) ccGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGt > 6:362945/1‑147 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCt < 5:51893/132‑1 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCt > 6:51893/1‑132 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAg > 5:104746/1‑149 (MQ=255) agaCAgtggcgggcgcaaaaagcgcatgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgtgg > 6:66083‑M1/2‑5 (MQ=255) aCAgtggcgggcgcaaaaagcgcatgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgt > 1:305069‑M1/1‑3 (MQ=255) aCAgtggcgggcgcaaaaagcgcatgtcggccacgtcgatcaagcccagacgctgatcgggggtgaccaccacgttgcccaggtgcagcgagcggaaataaacaccgctgcggtgcagctgacggatcagttcgatcaggcgt < 2:305069‑M1/143‑141 (MQ=255) aTGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCAGGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGATCCTGGGCGACCGGTTCGCCCTTGCCGGCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTgc > 1:21561/1‑149 (MQ=255) | ACGGCTTCAGCTGGGACACTTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAA‑CGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGC > NC_002947/5619074‑5619368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |