New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5619220 | 76 (1.170) | 6 (0.100) | 4/248 | NT | 7.5% | coding (469/606 nt) | PP_4937 | toluene tolerance protein |
? | NC_002947 | = 5619241 | 76 (1.240) | coding (490/606 nt) | PP_4937 | toluene tolerance protein |
TTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGCTCTGCGAGCCG > NC_002947/5619093‑5619388 | ttACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCAc > 5:66083/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtcgg < 4:68074‑M2/149‑7 (MQ=255) ccACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgtct > 6:66083‑M2/1‑142 (MQ=255) aCGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgt < 2:305069‑M2/143‑4 (MQ=255) aCGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACtgt > 1:305069‑M2/1‑140 (MQ=255) gCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCAGCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGGCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑Gc < 4:265192/149‑1 (MQ=255) gCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑g > 5:237504/1‑148 (MQ=255) cTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCAt > 4:32899/1‑149 (MQ=255) gAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCTGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCATCGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTc < 8:156152/148‑1 (MQ=255) gAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTAGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTc > 1:310940/1‑148 (MQ=255) aaCTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGa > 6:72585/1‑149 (MQ=255) aCTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGAc < 1:10142/149‑1 (MQ=255) cTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACg > 4:339263/1‑149 (MQ=255) aTCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCaa < 8:217997/149‑1 (MQ=255) tCCGTCAGCTGAACCGCAGCGGTGTTTTTTTCCGCTCGCTGAACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCTATCAGCGTCTGGGATTTATGGAGGTCGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCaa < 1:105880/148‑1 (MQ=255) gTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAAtgtg < 8:39318/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTgc < 3:242108/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTgc < 5:155419/149‑1 (MQ=255) aGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGAc > 4:157833/1‑138 (MQ=255) aGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGAc < 3:157833/138‑1 (MQ=255) aGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTgca < 5:110198/148‑1 (MQ=255) gCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTgcagc < 5:223565/149‑1 (MQ=255) aCCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATg < 3:68074/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTgc < 3:32899/149‑1 (MQ=255) aGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTgcg > 4:388243/1‑149 (MQ=255) tttATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTgc > 7:52197/1‑141 (MQ=255) tttATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTgc < 8:52197/141‑1 (MQ=255) tttATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATc > 6:375162/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCGCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCgg < 3:193671/148‑1 (MQ=255) ccGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACTGAGGGGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCg > 1:335135/1‑149 (MQ=255) cgctcgctGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGga < 4:61668/149‑1 (MQ=255) cgctGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAAc < 6:237504/149‑1 (MQ=255) tGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTg > 2:146133/1‑149 (MQ=255) 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gggCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGAcc > 6:113747/1‑149 (MQ=255) ggCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGAc < 5:375162/147‑1 (MQ=255) tggtCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCtt < 1:146133/149‑1 (MQ=255) tCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTgcc > 8:74438/1‑149 (MQ=255) aCCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTgccgc > 4:264569/1‑149 (MQ=255) 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ccGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGt > 6:362945/1‑147 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCt > 6:51893/1‑132 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCt < 5:51893/132‑1 (MQ=255) cGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAg > 5:104746/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCAGGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGATCCTGGGCGACCGGTTCGCCCTTGCCGGCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTgc > 1:21561/1‑149 (MQ=255) tGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGCAGGTCAGCTgcg > 3:236844/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGtt < 4:151781/96‑1 (MQ=255) gcgcTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGtt > 3:151781/1‑96 (MQ=255) cgcTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTgcgc < 7:99607/148‑1 (MQ=255) cgcTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTgcgc > 3:343391/1‑148 (MQ=255) cTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAAc < 8:15969/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGc < 7:129360/148‑1 (MQ=255) gcccgccACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGc < 6:401710/114‑1 (MQ=255) gcccgccACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGc > 5:401710/1‑114 (MQ=255) gcccgccACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGCTCTg > 6:391017/1‑149 (MQ=255) cACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGCTCTGCGAGcc > 1:349213/1‑149 (MQ=255) aCT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGCTCTGCGAGCCg < 5:297945/149‑1 (MQ=255) | TTACCTGCCACGCCTGATCGAACTGATCCGTCAGCTGCACCGCAGCGGTGTTTATTTCCGCTCGCTGCACCTGGGCAACGTGGTGGTCACCCCCGATCAGCGTCTGGGCTTGATCGACGTGGCCGACATGCGCTTTTTGCGCCCGCCACT‑‑GTCGGCCC‑GCATGATTCGACGCAATGTGCAGCACATGGTGCGCTATATCGAGCGGGAGAACCTGGGCGACCGGTTCCCCCTTGCCGCCTTCGAGGCAGCCTTGCTGACACGCTGAAGGTCAGCTGCGCAACAGGCTCTGCGAGCCG > NC_002947/5619093‑5619388 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |