| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5875315 | 61 (0.940) | 5 (0.080) | 5/258 | NT | 7.2% | coding (856/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
| ? | NC_002947 | = 5875360 | 70 (1.100) | coding (811/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase | |||||
TGGTCACGGCGATGATCGCCTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATC > NC_002947/5875168‑5875463 | tGGTCACGGCGATGATCGCCTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATg < 5:281978/149‑1 (MQ=255) aCGGCGATGATCGCCTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGc > 5:215551/1‑149 (MQ=255) gatgatCGCCTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCacac > 2:336111/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAgcgcg > 6:280178/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGGATAGCTCGACGTACTTCTTGCTGCCCGACACACCCAgcgcg > 8:183947/1‑149 (MQ=255) cTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAgcgcgc > 1:287708/1‑149 (MQ=255) tCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGCCGCAGGCCATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTAGACGGACTTCTTGATGCCCGCCACCCCCAGCGCGcc > 6:355421/1‑149 (MQ=255) gcTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCcagca < 8:132516/149‑1 (MQ=255) tttCACACAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGc > 7:33580/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTATGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATacccgctcgatcaccgagcctgctggcgcgctg > 1:94153‑M1/1‑116 (MQ=255) ccAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGt > 8:228126/1‑148 (MQ=255) aGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTTACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCGAGCAGGCTCGGt < 4:121114/146‑1 (MQ=255) aGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGt > 3:121114/1‑146 (MQ=255) aGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGAt > 8:181660/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATc < 5:209482/149‑1 (MQ=255) ggCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGCCGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGc > 2:6527/1‑149 (MQ=255) atgccACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATacccgctcgatcaccgagcctgctggcgcgctgggtgtggcgggcatc < 8:125559‑M1/146‑49 (MQ=255) ggCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgt < 8:300654/149‑1 (MQ=255) gCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATacccgctcgatcaccgagcctgctggcgcgctgggtgtggcgggcatcaag < 2:94153‑M1/149‑52 (MQ=255) gCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtc < 2:287708/149‑1 (MQ=255) acaTGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATacccgctcgatcaccgagcctgctggcgcgctgggtgtggcgggcatcaagaag < 5:78571‑M1/149‑55 (MQ=255) gcgcAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGata < 3:169570/148‑1 (MQ=255) aGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGat < 3:170255/143‑1 (MQ=255) aGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGat > 4:170255/1‑143 (MQ=255) gCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGa > 2:197160/1‑149 (MQ=255) gCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGAGGGCCACCAAGGGCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGa < 5:355421/149‑1 (MQ=255) gATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtc < 1:6598/133‑1 (MQ=255) gATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtc > 2:6598/1‑133 (MQ=255) gATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGAtt > 3:199567/1‑149 (MQ=255) aTCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATtg > 1:249347/1‑149 (MQ=255) gAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATccccgctcgatcaccgagcctgctggcgcgctgggtgtggcgggcatcaagaagtacgtcgagctatacgg < 7:120223‑M1/149‑72 (MQ=255) gAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATtgctg < 7:183947/149‑1 (MQ=255) aCGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGAt > 7:376844/1‑149 (MQ=255) t‑tGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTc < 4:199567/149‑1 (MQ=255) gCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGTTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCAt > 6:202803/1‑148 (MQ=255) gCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGTTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCAt < 5:202803/148‑1 (MQ=255) gCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCAt < 7:181660/148‑1 (MQ=255) ccGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCgg > 5:252658/1‑148 (MQ=255) cGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTa < 1:197160/149‑1 (MQ=255) gATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACa < 2:249347/148‑1 (MQ=255) gATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAg > 6:158466/1‑149 (MQ=255) tGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTg < 6:215551/149‑1 (MQ=255) gCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgac > 2:224515/1‑149 (MQ=255) gCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgac < 4:48783/149‑1 (MQ=255) ccaccaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgac > 1:282243/1‑148 (MQ=255) caccaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgacga < 8:314836/149‑1 (MQ=255) accaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACaagggggt > 1:144266/1‑141 (MQ=255) ccaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACt > 8:114955/1‑149 (MQ=255) caAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCtt < 4:394927/108‑1 (MQ=255) caAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCtt > 3:394927/1‑108 (MQ=255) caAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACtt < 5:320004/149‑1 (MQ=255) caAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACtt > 3:8633/1‑149 (MQ=255) aGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTc < 7:239016/148‑1 (MQ=255) aGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTc > 8:239016/1‑148 (MQ=255) gTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACGGTGACGACTTCGTc < 1:336111/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCcac < 8:33580/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCcaca < 6:252658/148‑1 (MQ=255) gCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACAt > 4:333641/1‑149 (MQ=255) ccGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACAtg < 7:315146/149‑1 (MQ=255) gACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTggc > 1:277663/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACAtggtgg < 7:228126/147‑1 (MQ=255) ccGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGGatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttc < 7:120223‑M2/149‑79 (MQ=255) tataGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGat < 3:333641/149‑1 (MQ=255) cTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGa < 2:282243/149‑1 (MQ=255) gACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAgg > 4:133232/1‑149 (MQ=255) tACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGtgtg < 5:280178/149‑1 (MQ=255) cttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgt < 5:78571‑M2/149‑96 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTg > 7:331750/1‑149 (MQ=255) cttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgtggc < 2:94153‑M2/149‑99 (MQ=255) cttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGc > 7:274683/1‑149 (MQ=255) gATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgtggcat < 8:125559‑M2/148‑101 (MQ=255) aTGCCTGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAAt > 6:85517/1‑149 (MQ=255) tGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATc > 8:196252/1‑149 (MQ=255) | TGGTCACGGCGATGATCGCCTCGCGCTTTTCACCCAGCTCGGCACGTTCGGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGT‑TGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATC > NC_002947/5875168‑5875463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |