New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 437647 = | 57 (0.880) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.3% | coding (713/1008 nt) | rdoA | serine/threonine protein kinase |
? | NC_002947 | 437711 = | 36 (0.590) | coding (649/1008 nt) | rdoA | serine/threonine protein kinase |
GGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTCCAGCAAG > NC_002947/437564‑437859 | ggAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCAt > 3:244694/1‑148 (MQ=255) gAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCa < 4:237635/149‑1 (MQ=255) ctcaagcgggtggaggacatctacgctcgcacaccacaccagctcatccgcctgcacggcgacctgcaccccggcaacctgaTGCACCGCTGGGCCCATACGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCAt > 7:134514‑M1/83‑147 (MQ=255) cTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGt > 6:248980/1‑149 (MQ=255) cTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGt > 6:353191/1‑149 (MQ=255) aagcgggtggaggacatctacgctcgcacaccacaccagctcatccgcctgcacggcgacctgcaccccggcaacctgaTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAg > 7:328088‑M1/80‑147 (MQ=255) gTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCg < 7:346227/148‑1 (MQ=255) gCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCgggg < 8:383712/148‑1 (MQ=255) gCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGt < 1:307052/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAAGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTg > 3:354721/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTg > 8:370264/1‑147 (MQ=255) ccAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAgg > 3:274280/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTACATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGc < 7:281341/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGa < 5:248980/149‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATg > 7:263804/1‑149 (MQ=255) ctcGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCtggtgtggtg > 6:43499/1‑149 (MQ=255) ggTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGa < 5:353191/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCg < 1:4578/148‑1 (MQ=255) cGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCg > 1:271015/1‑146 (MQ=255) ggCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGc < 1:6552/115‑1 (MQ=255) ggCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGc > 2:6552/1‑115 (MQ=255) gCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCTGCAATCGTCGAGGTCGACCAGGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCTGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGAt < 5:418738/149‑1 (MQ=255) gCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGAt < 2:271015/149‑1 (MQ=255) aGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAg < 1:129185/101‑1 (MQ=255) aGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAg > 2:129185/1‑101 (MQ=255) acaGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGc > 1:112664/1‑149 (MQ=255) acaGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGc > 5:199644/1‑149 (MQ=255) acaGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCAAGTGGTACACCTCATCGCTGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGc < 6:302760/149‑1 (MQ=255) ggTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTg < 6:199644/149‑1 (MQ=255) ctgatgcaccgcgatgaggtgtaccacgtggtcgacctcgacgattgccgcatgggcccagcggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCtt > 7:328088‑M2/69‑147 (MQ=255) atgcaccgcgatgaggtgtaccacgtggtcgacctcgacgattgccgtatgggcccagcggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAg > 7:134514‑M2/66‑147 (MQ=255) GCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAg < 1:227370‑M1/145‑1 (MQ=255) GCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAg < 3:131704‑M1/145‑1 (MQ=255) CACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAg < 7:232529‑M1/144‑1 (MQ=255) ACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCtggtgtg < 8:319139‑M1/109‑1 (MQ=255) ACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCtggtgtg > 7:319139‑M1/1‑109 (MQ=255) CTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGCCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCgg > 4:354721‑M1/1‑149 (MQ=255) cacgtggtcgacctcgacgattgccgtatgggcccagcggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGa < 8:134514‑M2/105‑1 (MQ=255) tcgtcgAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGa < 4:46214/126‑1 (MQ=255) tcgtcgAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGa > 3:46214/1‑126 (MQ=255) tcgtcgAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGc > 3:185364/1‑149 (MQ=255) gtcgAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCg < 1:201844/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGgca < 4:131704/149‑1 (MQ=255) gACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGt > 5:182367/1‑148 (MQ=255) gACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGt > 2:379857/1‑148 (MQ=255) gTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCAtgtg < 2:112664/149‑1 (MQ=255) gTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCAtgtg > 2:237825/1‑149 (MQ=255) gTGGGACACCTCATCGCGGTGCATCAGGCTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCGGGGGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCAtgtg < 2:106050/149‑1 (MQ=255) cTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAAt > 5:339741/1‑149 (MQ=255) tCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAAt > 4:108282/1‑148 (MQ=255) aTCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTAc < 8:263804/149‑1 (MQ=255) gcggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAAtt > 4:102554‑M2/9‑144 (MQ=255) gcggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAAtt < 3:102554‑M2/136‑1 (MQ=255) cggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTc < 3:108282‑M2/142‑1 (MQ=255) ggtgcaTCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTcc < 2:227370‑M2/143‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACg > 7:129356/1‑98 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACg < 8:129356/98‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTCCAGCAAg < 5:43499/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTCCAGCAAg < 8:195367/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTCCAGCAAg > 5:38984/1‑149 (MQ=255) | GGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGTGCGAGCGTAGATGTCCTCCACCCGCTTGAGCAGATCGCGGGCCACGGACTCGAACGCCGGCAGCAGTTCATGTGGGACAAAATTACCCTCCAGCAAG > NC_002947/437564‑437859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |