New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1453168 | 72 (1.110) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.2% | coding (1330/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1453262 | 53 (0.870) | coding (1424/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
GGCCTGGCCGCCGTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGATTTCGAGAACCATTGAA > NC_002947/1453114‑1453408 | ggCCTAGCCGCCGTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCa < 3:395168/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCAGTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcg < 3:208328‑M2/149‑5 (MQ=255) ccgccgTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcag > 4:60889‑M2/1‑142 (MQ=255) gccgTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcagg < 4:301202‑M2/148‑9 (MQ=255) gTCATCGCTGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTAtt > 6:271128/1‑149 (MQ=255) gTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTAtt < 4:276949/149‑1 (MQ=255) tCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTg < 1:375643/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGa < 6:198185/148‑1 (MQ=255) gcgggcggcCTGATGGCTGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGGCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTc < 4:267407/146‑1 (MQ=255) gCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCt < 7:142271/148‑1 (MQ=255) cggcggCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCgg < 3:2566/149‑1 (MQ=255) cggcggCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCgg < 4:326797/149‑1 (MQ=255) tgctgGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcag > 2:371631‑M2/1‑121 (MQ=255) tgctgGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcag < 1:371631‑M2/128‑8 (MQ=255) gctgGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACctc > 4:13710/1‑148 (MQ=255) aTGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTg < 3:25440/149‑1 (MQ=255) gTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTgg < 3:224479/148‑1 (MQ=255) gTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTCGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGt > 7:359130/1‑149 (MQ=255) ttCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTg > 7:8795/1‑149 (MQ=255) ggCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCt < 4:353130/146‑1 (MQ=255) ggCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTgg < 7:321330/148‑1 (MQ=255) ggCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGc > 1:28483/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTg > 7:11999/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTNGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcagggtgccaagaacatccagcaggccgccggcgatgacggc < 1:129188‑M2/149‑47 (MQ=255) cccTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcagggtgccaagaacatccagcaggccgccggcgatgacggc < 1:124218‑M2/149‑47 (MQ=255) ccTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcagggtgccaagaacatccagaaggccgccggcgatgacggcg < 6:72359‑M2/149‑48 (MQ=255) tccattccaATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCt < 5:15633/148‑1 (MQ=255) attccaATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGCCGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACATCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGAta > 4:231626/1‑148 (MQ=255) attccaATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATc > 2:13957/1‑149 (MQ=255) attccaATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATc > 2:74129/1‑149 (MQ=255) aaTCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAggcgcagggtgccaagaacatccagtaggccgccggcgatgacggcggccaggcccttgacggtgttga > 5:72359‑M2/1‑80 (MQ=255) aaTCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCt > 7:214724/1‑149 (MQ=255) aaTCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCt > 6:374532/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCt > 8:225178/1‑148 (MQ=255) tCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGa < 3:176239/149‑1 (MQ=255) tggtggACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCt > 1:366781/1‑149 (MQ=255) ggtggACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCtt < 4:208328/149‑1 (MQ=255) ggtggACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCtt > 1:64538/1‑149 (MQ=255) gtggACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGTCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCtt < 1:124068/148‑1 (MQ=255) tggACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTc < 3:89773/149‑1 (MQ=255) gACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGt < 3:13710/149‑1 (MQ=255) gACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGt < 8:214724/149‑1 (MQ=255) aCAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTc < 8:242289/146‑1 (MQ=255) aCAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTc > 7:242289/1‑146 (MQ=255) ggCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGAGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGCCTGACCTCTATCTCGTGCTGGCCTGTATCGCCGAGGCCCTGATCTGCCTGCTTCCTTTCGTGCCTACCCg > 3:66333/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGt < 2:28483/149‑1 (MQ=255) aaCGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGt < 8:230230/149‑1 (MQ=255) cGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCt < 1:74129/149‑1 (MQ=255) ccccGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTAt < 8:11999/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATccgcc > 7:100563/1‑149 (MQ=255) aCGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCg < 8:8795/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGAc < 1:144386/63‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGAc > 2:144386/1‑63 (MQ=255) cAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTg < 6:16676/97‑1 (MQ=255) cAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTg > 5:16676/1‑97 (MQ=255) cgccgcTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCtt < 1:13957/149‑1 (MQ=255) cgccgcTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCGGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCtt < 3:231626/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGaa < 2:64538/149‑1 (MQ=255) ctggccAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGga > 3:280171/1‑149 (MQ=255) ctggccAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCAATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGga < 5:374532/149‑1 (MQ=255) cAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATTGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGACTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGAtt > 5:23429/1‑149 (MQ=255) aaGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGAttt > 8:162937/1‑149 (MQ=255) aaGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGAttt > 8:32227/1‑149 (MQ=255) gcgcATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGATTTc > 6:196030/1‑148 (MQ=255) cgcATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGATTTCga < 3:301202/149‑1 (MQ=255) ttCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATTGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGATTTCGAGAAc < 5:271128/149‑1 (MQ=255) gcaggcgcagggttcctagaacatccagcaggccgcaggggatgacggcggccaggcccttgacggtgttgaaccagctggaggcgaacgggccctcctgcggtgtcatgccattgggggacagcatcagcaacggcaccactgccat > 4:262095‑M2/2‑3 (MQ=255) ccAggcgcagggtgccaagaacatccagcaggccgccggcgatgacggcggccagtcccttgacggtgttgaaccagctggaggcgaacgggccctcctgcggggtcatgccattggtggacagcatcagcaacggcagcactgccatc > 2:129188‑M2/1‑3 (MQ=255) ccAggcgcagggtgccaagaacatccagcaggccgccggcgatgacggcggccaggcccttgacggtgttgaaccagctggaggcgaacgggccctcctgcggggtcatgccattggtggacagcatcagcaacggcagcactgccatc > 2:124218‑M2/1‑3 (MQ=255) cAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCg < 4:384854/111‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCg > 3:384854/1‑111 (MQ=255) | GGCCTGGCCGCCGTCATCGCCGGCGGCCTGCTGGATGTTCTTGGCACCCTGCGCCGGCATTTCCATTCCAATCACCTGGTGGACAGCCTGGGCAACGCCCCGCTGGTCGACGGCAACGCCGCTGGCCTGGCCAAGCGCATTCACGACCAGGCGCAGGTATTGACCTCGGCTGACCTCTATCTGGTGCTGGCCTGTATCGCCGTGGCCCTGATCTGCCTGATTCCTTTCGTGCCTACCCGGGTCTATCCGCCGCGTGCGGTGGCTTGAACCCTGGATGATTTCGAGAACCATTGAA > NC_002947/1453114‑1453408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |