New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2248955 = | 57 (0.880) | 4 (0.060) | 3/250 | NT | 6.1% | coding (644/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase |
? | NC_002947 | 2249028 = | 70 (1.140) | coding (571/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase |
TTGCGCGGAATTGCACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCGGGTGA > NC_002947/2248884‑2249171 | ttGCGCGGAATTGCACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCAAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCt > 5:309397/1‑149 (MQ=255) ccaacgccattttgctgacccgccgccgcgatggcatgatcttcgaggtcaaccagcacttcgaagagaTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTc > 4:96439‑M1/70‑149 (MQ=255) ccaacgccattttgctgacccgccgccgcgatggcatgatcttcgaggtcaaccagcacttcgaagacaTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTc > 1:224318‑M1/70‑149 (MQ=255) cgcgGAATTGCACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTc > 4:200740/1‑148 (MQ=255) ggAATTGCACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAg < 6:279893/149‑1 (MQ=255) cACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGt > 3:129828/1‑149 (MQ=255) aCCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCAAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCCAACAAGTCTTCGAACTGCTGGtt > 8:87923/1‑149 (MQ=255) aCCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCCACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGtt < 2:408282/149‑1 (MQ=255) tCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACGGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGAc > 8:333316/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGaa < 6:309397/149‑1 (MQ=255) gggCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCAt < 3:200740/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATg < 1:158294/149‑1 (MQ=255) ccgTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATc > 3:154916/1‑149 (MQ=255) ccgTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATc > 2:214465/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTTGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCgcggcggc > 5:118502/1‑149 (MQ=255) gggTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGCTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGcggcggcgg < 2:368110/149‑1 (MQ=255) tCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTc > 7:296061/1‑149 (MQ=255) gACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAg > 3:69148/1‑149 (MQ=255) tCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCa > 6:375636/1‑148 (MQ=255) tCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCa > 8:140459/1‑148 (MQ=255) tCCACTATCTGGTGCCGCTGTTCGGGGTTAACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTCGCTGC‑CGGGCCACCCGAACATGTCTTCGAACTCCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGCCGGCGTGTCAGCa > 4:149250/1‑148 (MQ=255) cACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTc > 3:279531/1‑96 (MQ=255) cACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTc < 4:279531/96‑1 (MQ=255) cACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCaaaa > 7:273695/1‑149 (MQ=255) aCTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAAt < 2:312916/149‑1 (MQ=255) gtggCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTTGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGTGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg < 7:87923/149‑1 (MQ=255) gtggCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg < 1:192392/149‑1 (MQ=255) gtggCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg < 1:169687/149‑1 (MQ=255) gtggCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg < 7:140459/149‑1 (MQ=255) gaagacatgttcggctggcccggcagccaggtgatcggcaagaccagcctggaactgggcctgtgggtcaaccccgaacaTGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg > 1:224318‑M2/81‑149 (MQ=255) gaagacatgttcggctggcccggcagccaggtgatcggcaagaccagcctggaactgggcctgtgggtcaaccccgaacaTCTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg > 4:96439‑M2/81‑149 (MQ=255) gcTGTTCGGGGTTGACCCACAGCCCCAGTTACAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTc > 7:61024/1‑149 (MQ=255) TGTTCGGGCTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGACTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAg < 8:286457‑M1/149‑1 (MQ=255) TCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGAACACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGt < 2:157427‑M1/148‑1 (MQ=255) gTTAACCCACAGGCCCAGTTCCAGTCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAATTGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACa < 3:149250/149‑1 (MQ=255) gACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGc < 3:247338/148‑1 (MQ=255) aCCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGt > 5:367362/1‑149 (MQ=255) cccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTTGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTg < 6:118502/149‑1 (MQ=255) cccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTg > 6:25383/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGTGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTgg > 1:399903/1‑149 (MQ=255) ccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgggg < 1:360803/130‑1 (MQ=255) ccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgggg > 2:360803/1‑130 (MQ=255) ccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGc < 1:114031/145‑1 (MQ=255) ccACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGc > 2:114031/1‑145 (MQ=255) cacgGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGc < 7:333316/149‑1 (MQ=255) cacaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg > 4:350951/1‑127 (MQ=255) cacaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTgg < 3:350951/127‑1 (MQ=255) acaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGaaa < 5:212222/139‑1 (MQ=255) acaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGaaa > 6:212222/1‑139 (MQ=255) acaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGc > 8:84391/1‑148 (MQ=255) acaGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGAGCTCAGGTGAAACAGCGTGGc > 8:207046/1‑148 (MQ=255) gCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAgc < 5:375636/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAgc > 5:1062/1‑149 (MQ=255) cccAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAgcg > 5:82874/1‑149 (MQ=255) atcggcaagaccagcctggaactgggcctgtgggtcaaccccgaacaTGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCttt < 3:96439‑M2/101‑1 (MQ=255) tcggcaagaccagcctggaactgggcctgtgggtcaaccccgaacaTGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTc < 2:224318‑M2/103‑1 (MQ=255) cAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCg < 4:129828/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGa < 7:44356/149‑1 (MQ=255) ggCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGc < 8:331815/128‑1 (MQ=255) ggCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGc > 7:331815/1‑128 (MQ=255) ggCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGaa < 7:84391/149‑1 (MQ=255) ggCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGaa < 1:214465/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGCGCGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGaa > 1:210418/1‑149 (MQ=255) gTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGAt < 4:154916/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAg > 3:123994/1‑149 (MQ=255) gCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCa < 8:296061/146‑1 (MQ=255) ccGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAgcgc > 3:229633/1‑149 (MQ=255) ccGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAgcgc > 5:155612/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGt > 7:33058/1‑149 (MQ=255) tcgtGGGTGC‑CGGGCCTGCCGTACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGGCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGGTGGGGCTGTGGTGATACATAGTGGGGTTGCGGTTTTACGATTTGATGAGCGCCGTTTc < 2:91315/146‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTc > 2:36490/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTcc < 2:210418/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCGGTTTccc > 8:264657/1‑149 (MQ=255) cTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTccc < 8:61024/149‑1 (MQ=255) ggCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCg < 7:327172/86‑1 (MQ=255) ggCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCg > 8:327172/1‑86 (MQ=255) c‑cGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTcgcg < 4:229633/149‑1 (MQ=255) gggCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCt < 5:25383/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGCATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTg < 1:36490/149‑1 (MQ=255) cAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCg > 2:345699/1‑149 (MQ=255) cAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCg > 6:273463/1‑149 (MQ=255) gCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCggg < 5:273463/149‑1 (MQ=255) cgaacaTGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCGGGTg < 7:286457‑M2/143‑1 (MQ=255) gaacaTGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCGGGTGa > 4:87060‑M2/6‑149 (MQ=255) | TTGCGCGGAATTGCACCTCCATGATCAGCGGGCCGCCGTTGGCACGGGTCGACTCCACTATCTGGTGGCGCTGTTCGGGGTTGACCCACAGGCCCAGTTCCAGGCTGGTCTTGCCGATCACCTGGCTGC‑CGGGCCAGCCGAACATGTCTTCGAAGTGCTGGTTGACCTCGAAGATCATGCCATCGCGGCGGCGGGTCAGCAAAATGGCGTTGGGGCTCAGGTGAAACAGCGTGGCGAAGCGCTTTTCCGAATTGATCAGCGCCGTTTCCCGTTCGCGCTGGCGGGTGA > NC_002947/2248884‑2249171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |