| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2295836 = | 52 (0.800) | 6 (0.100) | 5/248 | NT | 10.4% | intergenic (+82/+51) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | 4282152 = | 55 (0.900) | coding (1078/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator | |||||
ACCATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCAC > NC_002947/4282008‑4282295 | cagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgatgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgttggagagggcatgcccgcgaaccagg > 5:350256‑M2/145‑145 (MQ=255) aTGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGc < 3:157137/149‑1 (MQ=255) cTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGt > 4:105934/1‑149 (MQ=255) gaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacataggtccttgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTg < 2:221224‑M2/17‑1 (MQ=255) gAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGcc < 2:2463/149‑1 (MQ=255) ccGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATc < 6:189381/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCAc > 2:134906/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCggt < 3:118917/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCggt‑‑g < 3:105934/149‑1 (MQ=255) gCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGttt > 3:32256/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTttc > 8:247212/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTttc > 2:112935/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTcgcg < 8:312196/149‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTcgcg > 2:262243/1‑149 (MQ=255) gaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GCCCGCTTCGCG‑‑GGCAt < 8:268300‑M2/48‑1 (MQ=255) gaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GCCCGCTTCGCG‑‑GGCAt < 7:196373‑M2/48‑1 (MQ=255) gagggggggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtcctctgattaaacatcgggctgcacatgggtccttgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GCCCGCTTCGCG‑‑GGCATGc < 5:141517‑M2/50‑1 (MQ=255) ccGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GACATGc < 1:262243/149‑1 (MQ=255) ggCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGccc > 2:163985/1‑149 (MQ=255) gATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTcc > 1:219208/1‑149 (MQ=255) aTCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTcc > 4:296778/1‑148 (MQ=255) aTCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTcc < 4:32256/148‑1 (MQ=255) ccTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTa > 5:267076/1‑148 (MQ=255) cTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACa < 3:147042/149‑1 (MQ=255) cGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGt < 8:142449/148‑1 (MQ=255) gggTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTa > 4:167740/1‑142 (MQ=255) gggTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTa < 3:167740/142‑1 (MQ=255) gTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGaa > 4:316442/1‑149 (MQ=255) cTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAg < 7:247212/149‑1 (MQ=255) gCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGAc < 1:112935/147‑1 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGc > 5:216411/1‑149 (MQ=255) tATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGCGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGGTTCTTCGCG‑‑GGCagg > 8:168802/1‑112 (MQ=255) aTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCAt > 2:248613/1‑112 (MQ=255) aTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCAt < 1:248613/112‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGcc < 1:163985/147‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCcgc > 4:274462/1‑149 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGcc < 2:219208/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTa < 4:298351/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAg > 2:261784/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAg < 5:402438/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGc < 8:63617/125‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGc > 7:63617/1‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTcc > 2:219165/1‑149 (MQ=255) cTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTg < 1:134906/149‑1 (MQ=255) catcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GCCCGCTTCGCg‑‑g < 7:82798‑M2/44‑1 (MQ=255) catcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GCCCGCTTCGCg‑‑g > 8:82798‑M2/47‑90 (MQ=255) tACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTCAAGGTTCTTCGCGACTGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTg > 1:126583/1‑149 (MQ=25) tACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGct > 2:316442/1‑149 (MQ=255) cAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGctc < 1:316442/148‑1 (MQ=255) aaTTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTg > 1:96456/1‑149 (MQ=255) aaTTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTg > 7:336585/1‑149 (MQ=255) ttCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGcataaat > 4:107702/1‑143 (MQ=255) ggCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGt < 5:146913/148‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTc < 1:219165/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTcc > 3:94694/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTcc < 3:316442/149‑1 (MQ=255) gTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCAc > 4:31741/1‑149 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCActtctt < 8:336585/149‑1 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCGcttctt > 8:229407/1‑148 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGc > 5:89033/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGccc < 4:94694/148‑1 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGt < 2:96456/149‑1 (MQ=255) tACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGa < 4:286380/148‑1 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAAGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAAc > 4:106678/1‑137 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAAGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAAc < 3:106678/137‑1 (MQ=255) ccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCAGTTCTTGAACGCCCGGTGGAAgg > 7:373307‑M2/8‑148 (MQ=255) gcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCAc > 7:7936‑M2/6‑149 (MQ=255) | ACCATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGT‑‑GGTTTCTTCGCG‑‑GGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCAC > NC_002947/4282008‑4282295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |