New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2562661 = | 72 (1.110) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 5.5% | coding (399/1137 nt) | dauA | FAD‑dependent catabolic D‑arginine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 2562688 = | 68 (1.100) | coding (426/1137 nt) | dauA | FAD‑dependent catabolic D‑arginine dehydrogenase |
CCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAGCCGC > NC_002947/2562541‑2562835 | ccTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTg > 2:345914/1‑149 (MQ=255) gAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGAt < 7:306431/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGAt < 1:273321/149‑1 (MQ=255) agcagcGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATg < 1:345914/149‑1 (MQ=255) aaCTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGAc < 2:27790/149‑1 (MQ=255) aCTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACg < 4:165548/149‑1 (MQ=255) cTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACg > 2:314900/1‑148 (MQ=255) cTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGt < 7:295980/149‑1 (MQ=255) tGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGt > 7:307381/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACa > 1:108675/1‑149 (MQ=255) gAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACAt < 5:409507/147‑1 (MQ=255) gCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCt > 5:35330/1‑149 (MQ=255) aaccTTTCGCCCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCCCCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCACCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCAT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTg < 8:302983/146‑1 (MQ=255) aaaCTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTg > 1:28599/1‑149 (MQ=255) tttCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCAc > 6:173623/1‑148 (MQ=255) gcgcAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAgg > 7:63511/1‑149 (MQ=255) aGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGcttc > 3:112431/1‑149 (MQ=255) aGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGcttc < 5:149225/149‑1 (MQ=255) 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cgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTg < 7:354951‑M1/29‑1 (MQ=255) cgcagttcaccgccggcagtgcgataaccacgcaagaagccttggtgcaaggcatgtacgtcaaggtccatcgcaCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTg > 8:354951‑M1/76‑104 (MQ=255) gCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTTCGAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTg < 1:314900/149‑1 (MQ=255) gCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTg < 7:191884/148‑1 (MQ=255) gCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCAATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTg < 6:8772/148‑1 (MQ=255) ccAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGt > 4:7789/1‑149 (MQ=255) cAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGt > 5:412604/1‑148 (MQ=255) aaTGGCACAGAAGTCACCTTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTa > 4:162576/1‑149 (MQ=255) tGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATc < 6:412604/149‑1 (MQ=255) tGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATc < 4:112431/149‑1 (MQ=255) tGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATc < 4:219059/149‑1 (MQ=255) acaGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCAc > 6:48002/1‑149 (MQ=255) aaGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTg > 3:54512/1‑147 (MQ=255) aCCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCcggcgg < 5:255075/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCcggcgg > 3:400149/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTg < 5:48002/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACACAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGt > 5:290045/1‑148 (MQ=255) gACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTgcg > 1:117673/1‑149 (MQ=255) aCCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTgcg > 6:132757/1‑148 (MQ=255) aCCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTgcg < 5:132757/148‑1 (MQ=255) cGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGtt > 4:300980/1‑121 (MQ=255) cGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGtt < 3:300980/121‑1 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gTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAgccgc < 5:300953‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCTGGAGCAGCGGGAACTGCTTGAGCAAACTTTCGCGCAGAACCTGGCCAATGGCACAGAAGTCACCCTGCTGGACCGGGACGCGGCCTTGGCACTGATACCCAGCCTGCGTGGCGAAACCCTGGCCGGCGCGGTGCTT‑GAGCCAGGTGCGATGGACCTTGACGTACATGCCTTGCACCAAGGCTTCTTGCGTGGTTATCGCACTGCCGGCGGTGAACTGCGCTGCAACGCCGAGCTGATCCAGGCCTGCTACCTGGACGACGTGTGGCAGGTGGAGTTGGCTGATGGCAGCCGC > NC_002947/2562541‑2562835 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |