New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2915278 = | 45 (0.690) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 9.1% | coding (4298/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
? | NC_002947 | 2915368 = | 38 (0.620) | coding (4388/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
TGTTCCAGGACATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCATCCTCGCGCAAATCAA > NC_002947/2915221‑2915509 | tgtTCCAGGACATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTg < 3:155995/149‑1 (MQ=255) cactgtcggcaccacgggcgcgcccgggtgcaccacggtggtaggctgcgagtacaGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGt > 7:190888‑M1/57‑149 (MQ=255) ctgtcggcaccacgggcgcgcccggttgcaccacggtggtaggctgcgagtacaGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTAc > 6:116892‑M1/55‑149 (MQ=255) ccAGGACATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACt > 3:17707/1‑149 (MQ=255) ggACATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCg > 5:318321/1‑148 (MQ=255) aCATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAg < 4:352891/149‑1 (MQ=255) catcatCCTGCTACCGGCCGTAGACCTGGCCTTCCAGATCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGTCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCACATGGCAACAACGAAGTGATGTAATCGCAg > 3:131259/1‑148 (MQ=255) atcatcCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGCGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGcc > 1:255260/1‑149 (MQ=255) ccTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTacca > 6:399722/1‑149 (MQ=255) ctccTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGCTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTacca < 3:232205/145‑1 (MQ=255) ccggccggCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCgtg < 5:131996/147‑1 (MQ=255) cTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCgtggt < 5:366480/132‑1 (MQ=255) cTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCgtggt > 6:366480/1‑132 (MQ=255) cTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGgcgcgc > 7:64216/1‑146 (MQ=255) cTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGgcgcgc < 8:64216/146‑1 (MQ=255) ttCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCgt > 6:269337/1‑149 (MQ=255) gagCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGc < 5:399722/149‑1 (MQ=255) agCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGGCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGcc < 4:17707/149‑1 (MQ=255) gtacagcacttcggtggtgccatgggcatcctgatagatcgccttgacccgcaggctcagcccggccaggtctggcgacaccttgaacgaagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAg > 6:116892‑M2/96‑149 (MQ=255) acagcacttcggtggtgccatgggcatcctgatagatcgccttgacccgcaggctcagcccggccaggtctggcgacaccttgaacgaagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCACCCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTg > 7:190888‑M2/94‑149 (MQ=255) GCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGc > 8:191469‑M1/1‑148 (MQ=255) CACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑Ca < 4:190892‑M1/149‑1 (MQ=255) ACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CAc > 3:190892‑M1/1‑149 (MQ=255) TTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CAccc < 3:239878‑M1/149‑1 (MQ=255) CGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCg < 3:110768‑M1/149‑1 (MQ=255) aaGGTTTCGGAAGACCTGGCCGGGCTGATCCTGCGGGTCACGGCGATCTATCAGGATGCCCATGTCACCACCGAATTTCTGTACTCGCAGCCTAACACCGTGGTGAAACCGGTCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGTC‑CACCCCtgtgtt < 4:131259/149‑3 (MQ=255) aaGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCCATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGGGGCAAACCCCggtgt > 1:344351/1‑148 (MQ=255) aGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGgtggtg < 5:342206/149‑1 (MQ=255) gCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCa < 4:239878/149‑1 (MQ=255) cAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGt < 5:269337/149‑1 (MQ=255) tcctgatagatcgccttgacccgcaggctcagcccggccaggtctggcgacaccttgaacgaagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGa < 5:116892‑M2/82‑1 (MQ=255) gACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGa > 7:81682/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGAt < 3:148591/138‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGAt > 4:148591/1‑138 (MQ=255) cTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGAcgg > 5:309944/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGt > 8:6957/1‑142 (MQ=255) ggCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGt < 7:6957/142‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGAcggcg < 4:110768/148‑1 (MQ=255) acccgcaggctcagcccggccaggtctggcgacaccttgaacgaagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGc < 8:190888‑M2/99‑1 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAAGCGGGCGCGCCCGTGGGGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATg < 6:318321/149‑1 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTTCACATg < 8:240582/149‑1 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATg < 2:37202/149‑1 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATg < 6:309944/149‑1 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATg > 6:55079/1‑149 (MQ=255) gggTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATg > 3:22083/1‑149 (MQ=255) aTCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCt > 8:144215/1‑127 (MQ=255) aTCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCt < 7:144215/127‑1 (MQ=255) tCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGa < 4:22083/144‑1 (MQ=255) cAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGaa > 6:307853/1‑149 (MQ=255) tGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCa > 7:78134/1‑149 (MQ=255) accGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCATCCTCGCGCAAAt > 6:144912/1‑149 (MQ=255) gaagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCATCCTCGCGCAAATCaa < 5:307853‑M2/142‑1 (MQ=255) aagtgcTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCATCCTCGCGCAAATc > 6:243270‑M2/7‑146 (MQ=255) | TGTTCCAGGACATCATCCTGCTACCGGCCGGCGACCTGGCCTTCCAGAGCGCTGATGGCACTTCGTTCAAGGTGTCGCCAGACCTGGCCGGGCTGAGCCTGCGGGTCAAGGCGATCTATCAGGATGCCCATGGCACCACCGAAGTGCTGTACTCGCAGCCTACCACCGTGGTGCAACCGGGCGCGCCCGTGGTGCCGACAGTGGC‑CACCCCGGTGGTGGATGCCAGTGACGGCGGTGCCGGCCTGCACATGGTGCGCTCCGACCTGAACTTCATCCTCGCGCAAATCAA > NC_002947/2915221‑2915509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |