New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3547910 | 40 (0.610) | 4 (0.060) | 3/252 | NT | 8.8% | coding (855/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | = 3547946 | 45 (0.720) | coding (891/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
CGGCGACCGCATATGGTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGCTACCGCGAAG > NC_002947/3547799‑3548088 | cGGCGACCGCATATGGTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGg > 6:105518‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCGACCGCATATGGTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGgc < 6:45443‑M2/149‑3 (MQ=255) cATATGGTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCgacgac > 4:102325/1‑148 (MQ=255) gTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCcgc > 5:24450/1‑149 (MQ=255) tttGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCcgcg > 6:60451/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGaaa < 6:24450/149‑1 (MQ=255) ccAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCCGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGa > 2:328088/1‑147 (MQ=255) cAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAg > 1:105896/1‑149 (MQ=255) aTGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCt < 5:41778/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTg > 1:46733/1‑148 (MQ=255) ggcgCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTcc > 7:55363/1‑149 (MQ=255) gcgcAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCg > 7:65309/1‑149 (MQ=255) tgtgtATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGgctgc < 8:65309/149‑1 (MQ=255) tATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGt > 6:377536/1‑149 (MQ=255) gATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGgctg > 1:401351/1‑139 (MQ=255) gATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGgctg < 2:401351/139‑1 (MQ=255) ccGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGa > 3:16317/1‑142 (MQ=255) ccGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGa < 4:16317/142‑1 (MQ=255) cGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTgg < 5:45443/149‑1 (MQ=255) tGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCCGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTg < 1:328088/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGtt > 4:151182/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGtt > 2:186549/1‑149 (MQ=255) gggTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCAttt > 7:245610/1‑149 (MQ=255) gggTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCAttt > 6:269271/1‑149 (MQ=255) gggTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCAttt > 7:38379/1‑149 (MQ=255) ggtgcggtgcAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCAt < 7:120000/146‑1 (MQ=255) ggtgcggtgcAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCAt > 8:120000/1‑146 (MQ=255) gtgcggtgcAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTtgt < 5:174088/149‑1 (MQ=255) cggtgcAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGc < 8:240855/149‑1 (MQ=255) aGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTc < 8:245610/149‑1 (MQ=255) aCCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCt < 8:38379/149‑1 (MQ=255) cTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGc < 3:102325/149‑1 (MQ=255) aTGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCttt > 6:34514/1‑93 (MQ=255) aTGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCttt < 5:34514/93‑1 (MQ=255) aTGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAg > 6:330322/1‑149 (MQ=255) aTGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAg > 2:2197/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGgccgacaattttcatgagcgcggtctgcaccgcacccaggatcagcacggcgatcgaatacacacccagttgcgccgccgacatgctggcgccaaaccatatgcg > 1:144676‑M2/1‑39 (MQ=255) ggCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGgccgacaattttcatgagcgcggtctgcaccgcacccaggatcagcacggcgatcgaatacacacccagttgcgccgccgacatgctggcgccaaaccatatgcg < 2:144676‑M2/144‑106 (MQ=255) gcgcGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGgccgacaattttcatgagcgcggtctgcaccgcacccaggatcagcacggcgatcgaatacacacccagttgcgccgccgacatgctggcgccaaaccatatgcggtcgcc < 4:156658‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgcGGAGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGgccgacaattttcatgagcgcggtctgcaccgcacccaggatcagcacggcgatcgaatacacacccagttgcgccgccgacatgctggcgccaaaccatatgcggtcgcc < 2:109644‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCg > 2:217599/1‑74 (MQ=255) ggTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCt < 5:330322/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTg < 1:2197/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGAt < 1:186549/149‑1 (MQ=255) gcTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCgct < 5:226567/132‑1 (MQ=255) gcTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCgct > 6:226567/1‑132 (MQ=255) ctgcctgcTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTa < 6:348477/149‑1 (MQ=255) ctgcTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGAc > 5:50830/1‑149 (MQ=255) cAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGc < 5:60451/148‑1 (MQ=255) cAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGc < 2:105896/148‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGCTACcgc > 5:22226/1‑148 (MQ=255) ggCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGCTACCGCGAAg < 5:7460/149‑1 (MQ=255) | CGGCGACCGCATATGGTTTGGCGCCAGCATGTCGGCGGCGCAACTGGGTGTGTATTCGATCGCCGTGCTGATCCTGGGTGCGGTGCAGACCGCGCTCATGAAAATTGTCGGCGCGGTGGCGCTGCCTGCTTTCAGCGAAGCGGCCCGGGCCGACGACAAGCCGCGCCTGAAAGCGCTGTATTTCCGCTTTCGGCTGCTGGTCGACCTGCTGGTGCTGTTCATTTGTGGCGGTTTCCTGACCGCCAGCCCGCTGCTGATCGGCTGGATGTATGACGATCGCTACCGCGAAG > NC_002947/3547799‑3548088 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |