New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5114635 | 50 (0.770) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 7.8% | coding (313/666 nt) | yciO | maturation protein |
? | NC_002947 | = 5114657 | 47 (0.760) | coding (291/666 nt) | yciO | maturation protein |
AGCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGATTGCCGACTTGTCGCCTATCTGGCAACCCAGCGCATACG > NC_002947/5114514‑5114802 | aGCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgcc < 1:38061‑M2/149‑6 (MQ=255) gCAAGGCCAGGGTGATGGCTTGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccg > 5:339864‑M2/1‑143 (MQ=255) gCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccg < 3:285390‑M2/149‑7 (MQ=255) gCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccg < 7:146225‑M2/149‑7 (MQ=255) gCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccg > 2:38061‑M2/1‑143 (MQ=255) aTGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGc < 4:285390/149‑1 (MQ=255) tGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCg < 3:391318/149‑1 (MQ=255) tGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCg < 5:204107/149‑1 (MQ=255) aTGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTAc > 5:195854/1‑148 (MQ=255) tGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACaa < 8:146225/149‑1 (MQ=255) cGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAAccc > 1:194683/1‑147 (MQ=255) ggTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAg < 6:119068/149‑1 (MQ=255) tACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGtt < 6:81068/149‑1 (MQ=255) ccGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTc > 2:274005/1‑149 (MQ=255) ccGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTc > 1:341684/1‑149 (MQ=255) gATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGTCGGTGTCGACCTTGGc < 7:152083/123‑1 (MQ=255) gATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGTCGGTGTCGACCTTGGc > 8:152083/1‑123 (MQ=255) tGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCgcag < 1:153899/149‑1 (MQ=255) aCGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGa < 3:358922/135‑1 (MQ=255) aCGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGa > 4:358922/1‑135 (MQ=255) cgccgcTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACAt > 5:123127/1‑149 (MQ=255) cgccgcTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGGGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCgcaactgg < 3:225180/148‑6 (MQ=255) cgcTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGACGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAg > 4:379013/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTg > 3:139168/1‑148 (MQ=255) tCGTGCAACAGCACGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGaa < 7:11607/149‑1 (MQ=255) gTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGt > 1:241994/1‑149 (MQ=255) tGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGtt < 3:308319/149‑1 (MQ=255) aaCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGGCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGtt < 6:175320/146‑1 (MQ=255) aaCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGtt > 5:175320/1‑146 (MQ=255) aaCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTtgtg > 7:109968/1‑149 (MQ=255) aaCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTtgtg > 4:389174/1‑149 (MQ=255) aaCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTtgtg > 4:395498/1‑149 (MQ=255) aCAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGc > 8:92023/1‑149 (MQ=255) gcagGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCTACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTc < 8:333242/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAgg < 4:356204/130‑1 (MQ=255) gcgcGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAgg > 3:356204/1‑130 (MQ=255) gcgcGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGt < 8:109968/149‑1 (MQ=255) cgcgGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGTAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTc < 1:42229/149‑1 (MQ=255) cgcgGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTc < 6:123127/149‑1 (MQ=255) gcgGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTcc < 2:194683/149‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGc < 4:186158/149‑1 (MQ=255) tGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCg < 4:362424/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGaa > 6:16717/1‑105 (MQ=255) gAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGaa < 5:16717/105‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGa > 8:159200/1‑149 (MQ=255) ggTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCACGCGCCGCACCCGCTCGATTg > 6:22971/1‑149 (MQ=255) tAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGcgccgc < 3:373693/132‑1 (MQ=255) tAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGcgccgc > 4:373693/1‑132 (MQ=255) ccccGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGATTGCCGACTTGt > 7:90068/1‑149 (MQ=255) cccGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccggggccttacaccttcatcctcaacggcacgcgtgaagtgccgcgcctgctgttgcacgataagcggcgtacaatcgggctgcgtgtaccggaccatgccatcaccctggcctt < 3:190268‑M2/149‑120 (MQ=255) ccGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccggggccttacaccttcatcctcaacggcacgcgtgaagtgccgcgcctgctgttgcacgataagcggcgtaccatcgggctgcgtgtaccggaccat < 5:270423‑M2/131‑103 (MQ=255) ccGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGgtgccggggccttacaccttcatcctcaacggcacgcgtgaagtgccgcgcctgctgttgcacgataagcggcgtaccatcgggctgcgtgtaccggaccat > 6:270423‑M2/1‑29 (MQ=255) gCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCcgc > 3:232623/1‑96 (MQ=255) gCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCcgc < 4:232623/96‑1 (MQ=255) cAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGATTGCCGACTTGTCGCCTATCTGGCAACCCAgcg < 7:159200/149‑1 (MQ=255) gCGGAAGgtgccggggccttacaccttcatcctcaacggcacgcgtgaagtgccgcgcctgctgttgcacgataagcggcgtaccatcgggctgcgtgtaccggaccatgccatcaccctggccttgctggccgagttgggcgagccac > 4:190268‑M2/1‑7 (MQ=255) gAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGATTGCCGACTTGTCGCCTATCTGGCAACCCAGCGCATACg > 2:299865/1‑149 (MQ=255) | AGCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGTCCGGTACACGCAGCCCGATGGTACGCCGCTTATCGTGCAACAGCAGGCGCGGCACTTCACGCGTGCCGTTGAGGATGAAGGTGTAAGGCCCCGGCACATGCGCCTTCAGCAAGCGGAAGGTGCCGGTGTCGACCTTGGCGTACAACCCCAGTTGCGACATGTCGCAGCACATCAGGGTGAAGTTGTGCGTCTTGTCCAGCCCGCGCAGGCGCCGCACCCGCTCGATTGCCGACTTGTCGCCTATCTGGCAACCCAGCGCATACG > NC_002947/5114514‑5114802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |