New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5258313 = | 53 (0.810) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (844/1212 nt) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
? | NC_002947 | 5258382 = | 59 (0.970) | coding (775/1212 nt) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
TGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGC > NC_002947/5258234‑5258522 | acctggccgatctactggcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCtt > 2:408378‑M1/80‑149 (MQ=255) ctggccgatctactggcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCt > 2:152653‑M1/78‑149 (MQ=255) tGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTgg < 7:228812/149‑1 (MQ=255) gccgatctactggcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTg > 1:326861‑M1/75‑147 (MQ=255) cTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGtt > 6:248972/1‑148 (MQ=255) cGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCAACGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGa > 6:417136/1‑149 (MQ=255) gTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCCCCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGAc > 3:28394/1‑149 (MQ=255) cacCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGCCTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAgg < 7:224486/149‑1 (MQ=255) cTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCg > 5:32091/1‑149 (MQ=255) tttCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCgg > 6:59862/1‑149 (MQ=255) cTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGt > 6:284913/1‑149 (MQ=255) cATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTc > 4:382655/1‑147 (MQ=255) aTGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAg < 1:388373/149‑1 (MQ=255) gATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGt > 5:134933/1‑149 (MQ=255) tCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTcc > 7:221388/1‑149 (MQ=255) tCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTcc > 6:70330/1‑149 (MQ=255) tGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGc > 2:143559/1‑149 (MQ=255) aaGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTCTACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCt < 1:314382/149‑1 (MQ=255) aCCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTtggc < 6:32091/149‑1 (MQ=255) cATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGAc < 7:120698/116‑1 (MQ=255) cATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGAc > 8:120698/1‑116 (MQ=255) gtaatgTACAGTGGCCTGACCGGGTTGGGCGTGGTGGCCTGGGGAACCACCGTCGTGAGCACCGCCACATTGGCGGCGGCTTTC‑ACTTGACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTtggcctggc < 2:83111/143‑1 (MQ=255) gACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTtggcctggcc > 1:189809/1‑149 (MQ=255) catgTACAGTGGCAGCTCCGTGATGGCCGTGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTGTTACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCa < 5:131147/146‑1 (MQ=255) aGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAg > 7:242639/1‑149 (MQ=255) ggTTCAGTGGCATCACGGGGATGGCCGTGGTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACGGCCAGATTTGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGGTTCTGGTTCAGACGCTGTGCTGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGt < 2:362679/149‑1 (MQ=255) gTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCTGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTg > 8:198378/1‑149 (MQ=255) cATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGc > 8:59388/1‑148 (MQ=255) aTCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCa < 8:221388/149‑1 (MQ=255) aTCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCa > 3:52784/1‑149 (MQ=255) cGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGtt > 8:36548/1‑103 (MQ=255) cGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGtt < 7:36548/103‑1 (MQ=255) cGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTg < 1:379589/141‑1 (MQ=255) cGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTg > 2:379589/1‑141 (MQ=255) ggATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATc < 4:52784/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCg < 5:417136/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCg < 5:59862/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCGAGTAGATCGGc > 6:74844/1‑148 (MQ=255) ccGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAg > 6:221593/1‑149 (MQ=255) cagaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaatgtggcggtgctcaagtcggtggttacccaggccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGc > 1:326861‑M2/74‑147 (MQ=255) agaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaatgtggcggtgctcaagtcggtggttacccaggccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAg > 2:152653‑M2/73‑149 (MQ=255) aagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaatgtggcggtgctcaagtcggtggttacccaggccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGt > 2:408378‑M2/71‑149 (MQ=255) AGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTg < 3:297535‑M1/130‑1 (MQ=255) AGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTg > 4:297535‑M1/1‑130 (MQ=255) AGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCCGCCAGGTg > 1:143559‑M1/1‑149 (MQ=255) 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2:38263/112‑1 (MQ=255) caccGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGata > 7:26335/1‑148 (MQ=255) caccGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGata > 8:252028/1‑148 (MQ=255) caccGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGata > 5:91482/1‑148 (MQ=255) accGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGata > 4:126297/1‑147 (MQ=255) aCTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCt > 4:301329/1‑148 (MQ=255) cACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCa < 5:248972/149‑1 (MQ=255) cACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGACCTGCATGTCCTCGCCCAGTGCACCGTGCAAGTAGATCGGACAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGccc > 6:299515/1‑148 (MQ=255) gCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGt < 3:301329/149‑1 (MQ=255) gCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGt > 1:240954/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAg > 5:403726/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAg > 4:118366/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAgcgc < 7:252028/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGcc > 6:54632/1‑149 (MQ=255) gccTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCgg < 6:300964/149‑1 (MQ=255) c‑acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGt < 2:189809/148‑1 (MQ=255) c‑acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGt < 8:15419/148‑1 (MQ=255) acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTa < 7:291861/148‑1 (MQ=255) acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTa > 7:361202/1‑148 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACAt > 6:373912/1‑149 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACAt > 5:134631/1‑149 (MQ=255) cacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACAt < 3:126297/147‑1 (MQ=255) acCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGat < 7:317708/105‑1 (MQ=255) acCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGat > 8:317708/1‑105 (MQ=255) ccGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgc > 4:356233/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgcg < 3:382655/149‑1 (MQ=255) ggccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgcgc < 6:134933‑M2/141‑1 (MQ=255) ggccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgcgc < 4:28394‑M2/141‑1 (MQ=255) ccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgc < 8:174657‑M2/139‑1 (MQ=255) ccagctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgc > 7:174657‑M2/7‑145 (MQ=255) ctTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGG‑CAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGt > 6:56416‑M2/3‑132 (MQ=255) | TGGGTGCCTTCGTGAACACCTTTCTCCTGCATGATCTTGAAGACCATCGACAGGTACAGTGGCATCACCGGGATGGCCGAGCTGGCCTGGGTAACCACCGACTTGAGCACCGCCACATTGGCGCCGCCTTTC‑ACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGC > NC_002947/5258234‑5258522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |