New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5842554 = | 64 (0.980) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 6.3% | coding (1123/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5842578 = | 58 (0.940) | coding (1147/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
CTGCCACCACACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCATGGGCCAC > NC_002947/5842431‑5842721 | cTGCCACCACACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTa < 8:234716/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCACACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTa < 6:116381/149‑1 (MQ=255) tGCCACCACACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTAc > 5:7721/1‑149 (MQ=255) atgccgccgaagggcagatcgtcctgggcaacatgcagcaaggtatcgttcaggcacacaccgccggagtgggtgtgacgcagcacatgctcctgggtgcggcggtcatagccaaagaagtaCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTAc > 3:311428‑M1/123‑149 (MQ=255) ccacACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTActtctt < 7:338122/149‑1 (MQ=255) gcagatcgtcctgggcaacatgcagcaaggtatcgttcaggcacacaccgccggagtgggtgtgacgcagcacatgctcctgggtgcggcggtcatagccaaagaagtacagcgcccacacccattggcgctgTACTTCTTTGGCTATg < 2:252462‑M2/16‑1 (MQ=255) ctgctgGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGTTGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTAt < 7:32180/147‑1 (MQ=255) ctgctgGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTAt < 1:346310/147‑1 (MQ=255) ctgctgGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTAt < 2:192668/147‑1 (MQ=255) tGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTg > 4:210547/1‑132 (MQ=255) tGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTg < 3:210547/132‑1 (MQ=255) tGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCAcc > 4:173465/1‑149 (MQ=255) aaCGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTgg < 4:208047/131‑1 (MQ=255) aaCGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTgg > 3:208047/1‑131 (MQ=255) aCGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAg < 3:173465/149‑1 (MQ=255) gACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGa < 5:347976/149‑1 (MQ=255) cATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCAtg > 5:16416/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGtgctgc < 3:339793/149‑1 (MQ=255) tGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTACTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGTCCTACGTCAACCAGCGCCCAGACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGt < 6:332662/149‑1 (MQ=255) gATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGt > 3:204248/1‑148 (MQ=255) cAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTcaca < 4:204248/148‑1 (MQ=255) aGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACAcc < 6:7721/149‑1 (MQ=255) ggACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACAcc > 7:306197/1‑148 (MQ=255) aaTCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcg > 6:312197/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcggcgg > 4:259918/1‑149 (MQ=255) ttCGGACCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCTCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcggcg < 5:303962/148‑1 (MQ=255) cGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGgt < 6:16416/148‑1 (MQ=255) ccggagtgggtgtgacgcagcacatgctcctgggtgcggcggtcatagccaaagaagtaCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTg < 5:68488‑M1/34‑1 (MQ=255) ccggagtgggtgtgacgcagcacatgctcctgggtgcggcggtcatagccaaagaagtaCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTg > 6:68488‑M1/60‑93 (MQ=255) cccTCTATTGCCGTTAGGGCCTTATGACGGCATCGATCAGTCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCt < 6:195953/95‑1 (MQ=255) cccGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcggc > 3:297173/1‑142 (MQ=255) cccGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcggc < 4:297173/142‑1 (MQ=255) cccGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGgtgtgt < 3:192348/149‑1 (MQ=255) cccGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGgtgtgt > 4:192348/1‑149 (MQ=255) cccGATATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGTCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACAACCATTGGCGCTGTACTTATTTGGCt > 5:195953/1‑95 (MQ=255) tATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCt > 8:120122/1‑148 (MQ=255) gCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAAc < 6:155874/148‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCa > 4:352448/1‑101 (MQ=255) ccGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGa > 3:376946/1‑149 (MQ=255) ccGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGa > 4:401470/1‑149 (MQ=255) gTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATa < 7:120122/149‑1 (MQ=255) tGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTtg < 4:113446/149‑1 (MQ=255) tGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTtg > 3:113446/1‑149 (MQ=255) ccTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTtgct > 5:356180/1‑149 (MQ=255) ccTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTtgct < 3:401470/149‑1 (MQ=255) aCGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCCCACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGtt > 1:356962/1‑149 (MQ=255) aTCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGcc > 1:216566/1‑147 (MQ=255) aTCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCa < 8:142135/149‑1 (MQ=255) gATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGa < 3:259918/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGAc > 1:86306/1‑148 (MQ=255) aGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACCCCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGAt > 5:304176/1‑149 (MQ=255) catagccaaagaagtaCAGCGCCAATGGGTGTGGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGc < 2:252462‑M1/133‑1 (MQ=255) cTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGc > 2:370543/1‑149 (MQ=255) ccTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTc > 5:47547/1‑149 (MQ=255) caaagaagtacagcgccaatgggtgtgggcgctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcgg < 5:68488‑M2/59‑1 (MQ=255) caaagaagtacagcgccaatgggtgtgggcgctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCcgg > 6:68488‑M2/35‑93 (MQ=255) cTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcg < 5:312197/149‑1 (MQ=255) cATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcggcg < 4:376946/149‑1 (MQ=255) cATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcggcg < 2:86306/149‑1 (MQ=255) aTCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcggcgg > 7:95248/1‑149 (MQ=255) tCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcggcgg > 6:88525/1‑148 (MQ=255) gtacagcgccaatgggtgtgggcgctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCAt > 3:311428‑M2/28‑149 (MQ=255) aaCCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCAt < 6:356180/149‑1 (MQ=255) aaCCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCAt > 1:354470/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCg > 3:247342/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCg > 4:52541/1‑149 (MQ=255) CAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCgg > 6:47547‑M1/1‑149 (MQ=255) AGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGc > 2:354470‑M1/1‑149 (MQ=255) AGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGc < 2:21850‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcg < 7:385776‑M1/137‑1 (MQ=255) GCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcg > 8:385776‑M1/1‑137 (MQ=255) cacaCCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCa < 3:176592/149‑1 (MQ=255) acacCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAg > 2:31511/1‑149 (MQ=255) acCCATTGGCGCTGTACTTCTATGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTtgc > 8:23606/1‑99 (MQ=255) ccATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCa > 3:345844/1‑144 (MQ=255) ccATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCa < 4:345844/144‑1 (MQ=255) ccATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCAt > 5:298220/1‑149 (MQ=255) ccATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCAt < 8:306197/149‑1 (MQ=255) gcgctgTAATTCTTTGGCTATGACCGCCCCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACCATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCATGGGcc > 7:226689‑M2/7‑148 (MQ=255) gctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCATGGGCCAc > 3:194883‑M2/5‑148 (MQ=255) ctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcgg > 7:237000‑M2/4‑119 (MQ=255) ctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcgg < 6:63192‑M2/116‑1 (MQ=255) ctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcgg > 5:63192‑M2/4‑119 (MQ=255) ctgTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTcgg < 8:237000‑M2/116‑1 (MQ=255) gTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGccc < 6:28885‑M2/111‑1 (MQ=255) gTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGccc > 5:28885‑M2/2‑112 (MQ=255) | CTGCCACCACACCTGCTGCTGGACGTGAACGACAGCATGCAGGTGATGCAGGACGAAATCTTCGGCCCGCTATTGCCGTTAGTGCCTTATGACGGCATCGATCAGGCCTTGGCCTACATCAACCAGCGCCCACACCCATTGGCGCTGTACTTCTTTGGCTATGACCGCCGCACCCAGGAGCATGTGCTGCGTCACACCCACTCCGGCGGTGTGTGCCTGAACGATACCTTGCTGCATGTTGCCCAGGACGATCTGCCCTTCGGCGGCATCGGCCCTTCAGGCATGGGCCAC > NC_002947/5842431‑5842721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |