New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1383831 = | 50 (0.920) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (1200/1716 nt) | proS | proline‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | 1383898 = | 61 (1.180) | coding (1133/1716 nt) | proS | proline‑‑tRNA ligase |
CACGGGACACGCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCTCATCAGG > NC_002947/1383686‑1383975 | gcgccggcgccggctcgctcggcccgctcaacctgccactggaaatcatcatcgaccgctcggttgccctgatgagcgacttcggcatcggcgccaacatcgacgacaagcactacttcggcgtcaactgggagcgcgacctgccGGt > 1:205175‑M1/146‑148 (MQ=255) cGGGACACGCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGcc < 7:316016/149‑1 (MQ=255) acacGCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTgg < 3:264324/149‑1 (MQ=255) cacGCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGc > 5:239332/1‑149 (MQ=255) gCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGt > 8:196407/1‑149 (MQ=255) tGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCggg < 6:239332/149‑1 (MQ=255) tGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCggg < 3:297786/149‑1 (MQ=255) tGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCggg < 3:275327/149‑1 (MQ=255) ccGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACATCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACATCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCt > 5:169694/1‑149 (MQ=255) gTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTg > 6:148624/1‑149 (MQ=255) cccATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGcc < 5:170057/149‑1 (MQ=255) ccATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCt > 8:6666/1‑149 (MQ=255) aTCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTc > 6:318983/1‑149 (MQ=255) gACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGa < 5:148624/148‑1 (MQ=255) tACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGt > 5:148568/1‑149 (MQ=255) gACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAggg > 8:116092/1‑107 (MQ=255) gACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAggg < 7:116092/107‑1 (MQ=255) gACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCg < 8:111844/139‑1 (MQ=255) gACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCg > 7:111844/1‑139 (MQ=255) ttCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAAc < 7:161705/149‑1 (MQ=255) ttCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAAc < 6:78591/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTgg > 2:163712/1‑148 (MQ=255) aCCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCgg < 1:163712/149‑1 (MQ=255) ctgatgagcgacttcggcatcggcgccaacatcgacgacaagcactacttcggcgtcaactgggagcgcgacctgccGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAg > 7:138861‑M1/78‑149 (MQ=255) ggCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAgg > 5:101164/1‑149 (MQ=255) cACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTc < 6:148568/149‑1 (MQ=255) aCTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTAGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTcg > 1:332383/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCgcgc < 1:136829/148‑1 (MQ=255) gcCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCa < 7:196407/149‑1 (MQ=255) gcCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGCCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCa < 3:251272/149‑1 (MQ=255) ccTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAg > 4:300645/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAg > 8:183732/1‑149 (MQ=255) cggcatcggcgccaacatcgacgacaagcactacttcggcgtcaactgggagcgcgacctgccGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCgg < 2:59722‑M1/69‑1 (MQ=255) cggcatcggcgccaacatcgacgacaagcactacttcggcgtcaactgggagcgcgacctgccGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCgg > 1:59722‑M1/64‑132 (MQ=255) cGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTg > 5:323302/1‑149 (MQ=255) gCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGGGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGtt < 5:80125/147‑1 (MQ=255) cTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCgcgc > 6:301257/1‑133 (MQ=255) cTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCgcgc < 5:301257/133‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCa < 6:136097/137‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCa > 5:136097/1‑137 (MQ=255) ttGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCg > 1:17143/1‑147 (MQ=255) ggTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTc > 1:181424/1‑126 (MQ=255) ggTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTc < 2:181424/126‑1 (MQ=255) cccAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTg < 7:6666/149‑1 (MQ=255) aGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCtt < 6:323302/149‑1 (MQ=255) tGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTgtc > 1:313009/1‑149 (MQ=255) gCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTg < 2:17143/148‑1 (MQ=255) ccACTTCGAAGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGgcg > 7:312365/1‑149 (MQ=255) agATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGAt < 2:332383/147‑1 (MQ=255) tGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGcc > 3:206862/1‑148 (MQ=255) gcgcTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTgtc > 6:200825/1‑123 (MQ=255) gcgcTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTgtc < 5:200825/123‑1 (MQ=255) gcgcTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAg > 5:317042/1‑148 (MQ=255) gcgcTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGt > 2:208222/1‑149 (MQ=255) ttGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCt > 8:26120/1‑149 (MQ=255) gATAACCAGGGGGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACTCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCtc < 8:270348/148‑1 (MQ=255) aCCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATg > 2:257643/1‑132 (MQ=255) aCCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATg < 1:257643/132‑1 (MQ=255) aCCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCTCATCAg < 4:206862/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGGTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCATCCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCTCATCAgg < 6:169694/149‑1 (MQ=255) | CACGGGACACGCCAATGCCGTAGCAACCCATCGACAGTACGACCGGCTTGCCGTTCTCGCCCAGCACCTGGCACTTCAGCGCCTCGCTGTACTTGGTGCCCAGCTGGAAGATGTGGCCCACTTCGATGCCGCGCTTGATAACCAGGGTGCCCTGGCCGTCCGGGCTTGGGTCGCCTTCGACCACGTTACGCAGGTCGGCAACCTGTGGCACCGGCAGGTCGCGCTCCCAGTTGACGCCGAAGTAGTGCTTGTCGTCGATGTTGGCGCCGATGCCGAAGTCGCTCATCAGG > NC_002947/1383686‑1383975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |