| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1616576 | 72 (1.330) | 6 (0.110) | 6/252 | NT | 8.1% | coding (683/1515 nt) | PP_1416 | tricarboxylate transport protein TctA |
| ? | NC_002947 | = 1616617 | 66 (1.260) | coding (642/1515 nt) | PP_1416 | tricarboxylate transport protein TctA | |||||
GCTGGCCAGCGTTGCGCCGGCGCCGGGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCGAGAGGAACAG > NC_002947/1616428‑1616724 | gcTGGCCAGCGTTGCGCCGGCGCCGGGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGG < 6:321933‑M1/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGTTGCGCCGGCGCCGGGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTc < 1:237561/147‑1 (MQ=255) ccAGCGTTGCGCCGGCGCCGGGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCttt < 5:129880/149‑1 (MQ=255) cgccggcgccggGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCcagcagc < 3:53976/149‑1 (MQ=255) cggcgccggGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCcagcagcag > 4:153429/1‑148 (MQ=255) cgccggGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCaggagg < 4:53068/149‑1 (MQ=255) cggGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGAtt > 6:235574/1‑149 (MQ=255) gggTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGCCCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGAttt > 7:196709/1‑149 (MQ=255) gTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCg < 7:164880/149‑1 (MQ=255) tAGAACACGCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGc < 4:172701/149‑1 (MQ=255) aaCACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGa > 1:198166/1‑149 (MQ=255) cacCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCcagca < 5:26114/129‑1 (MQ=255) cacCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCcagca > 6:26114/1‑129 (MQ=255) cacCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATg < 5:235574/149‑1 (MQ=255) acCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGcctgttctccatcagcgaaatcctcctgctgct > 8:164491‑M1/1‑116 (MQ=255) ccATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATg > 1:31014/1‑146 (MQ=255) ccATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATg > 8:69322/1‑146 (MQ=255) atgatgAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGaa > 5:15445/1‑149 (MQ=255) atgatgAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGaa > 8:89977/1‑149 (MQ=255) 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cAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGc < 2:31014/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGcctgttctccatcagcgaaatcctcctgctgctggaaaagacccacca < 1:54647‑M1/149‑49 (MQ=255) aaGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCa > 2:16056/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGcctgttctccatcagcgaaatcctcctgctgctggaaaagacccaccatgg < 7:164491‑M1/149‑52 (MQ=255) cAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCAc > 5:341925/1‑147 (MQ=255) ccGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGGACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGAc < 4:60437/149‑1 (MQ=255) cGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGAc > 6:34049/1‑148 (MQ=255) cAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCAc < 2:264262/149‑1 (MQ=255) cGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGaa < 4:20386/149‑1 (MQ=255) ttGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAAt < 2:332484/149‑1 (MQ=255) gACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATg < 5:34049/148‑1 (MQ=255) gACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGc > 7:26070/1‑149 (MQ=255) aCCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGcc > 2:217020/1‑149 (MQ=255) ccAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAg > 8:134971/1‑124 (MQ=255) ccAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAg < 7:134971/124‑1 (MQ=255) gAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGaa > 8:284525/1‑135 (MQ=255) 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gCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCt < 3:153429/149‑1 (MQ=255) ccTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCa > 2:40658/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGGCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCAcc < 7:69322/147‑1 (MQ=255) gAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCAcc < 8:173853/147‑1 (MQ=255) aaGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGt < 4:127510/149‑1 (MQ=255) gTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGtcttttccatcagcgaaatcctcctgctgctgg < 7:231452‑M1/83‑34 (MQ=255) 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cATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGAccg < 6:210184/144‑1 (MQ=255) aTGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCgaga < 4:143478/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCgaga < 1:40658/149‑1 (MQ=255) tggtggGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGcccaccatggccaccaggcggtcaaggctaccggccgtatgctgttcaacttcaaggaagcggcctcggtgttcctggtcaacatccgttgcggcctgctt < 1:54647‑M2/149‑102 (MQ=255) tggtggGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCGagag < 1:87103/149‑1 (MQ=255) gtggGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGcccaccatggccaccaggcggtcaaggctaccggccgtatgctgttcaacttcaaggaagcggcctcggtgttcctggtcaacatccgttgcggcctgcttg > 2:54647‑M2/1‑46 (MQ=255) gggTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCGAGAGGaa > 4:85997/1‑148 (MQ=255) gcctgttctccatcagcgaaatcctcctgctgctggaaaagacccaccatggccaccaggcggtcaaggctaccggccgtatgctgttcaacttcaaggaagcggcctcggtgttcctggtcaacatccgttgcggcctgcttggtttc < 1:332484‑M1/149‑149 (MQ=255) gcctgttctccatcagcgaaatcctcctgctgctggaaaagacccaccatggccaccaggcggtcaaggctaccggccgtatgctgttcaacttcaaggaagcggcctcggtgttcctggtcaacatccgttgcggcctgcttggtttc < 2:20920‑M1/149‑149 (MQ=255) gccggttctccatcagcgaaatcctcctgctgctggaaaagacccaccatggccaccaggcggtcaaggctaccggccgtatgctgttcaacttcaaggaagcggcctcggtgttccttgtcaacatccgttgcggccttcttggtttc < 8:287816‑M1/149‑149 (MQ=255) | GCTGGCCAGCGTTGCGCCGGCGCCGGGTAGAACACCCATGATGAAACCAAGCAGGCCGCAACGGATGTTGACCAGGAACACCGAGGCCGCTTCCTTGAAGTTGAACAGCATACGGCCGGTAGCCTTGACCGCCTGGTGGCCATGGTGGGTCTTTTCCAGCAGCAGGAGGATTTCGCTGATGGAGAACAGGCCCAGCACGAGGACCACGAACTGAATGCCGTCGGCCAGGTGCACGCTGTCACCGGTGAAGCGGTACACGCCGCTGTTGGCGTCGATGCCGACCGCCGAGAGGAACAG > NC_002947/1616428‑1616724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |