New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1762690 | 64 (1.180) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.3% | coding (324/477 nt) | PP_1569 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1762715 | 57 (1.110) | coding (349/477 nt) | PP_1569 | hypothetical protein |
CTTGCAGCTAGCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGG > NC_002947/1762543‑1762835 | cTTGCAGCTAGCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATgg < 8:102015/149‑1 (MQ=255) cTAGCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTaa > 5:109781/1‑149 (MQ=255) aGCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATc > 3:295731/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATcc > 4:244136/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATc < 7:216716/148‑1 (MQ=255) gCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATc < 3:247376/148‑1 (MQ=255) cAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTg > 1:12510/1‑149 (MQ=255) aggaggCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCg < 3:244136/149‑1 (MQ=255) ggaggCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGa < 4:129946/149‑1 (MQ=255) ggaggCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGa < 7:122335/149‑1 (MQ=255) gAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAg > 2:69395/1‑149 (MQ=255) tACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGGTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCgg < 1:239195/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTc < 6:109781/149‑1 (MQ=255) tgctgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGccgcttggatcgcaggattaagcaccatgccatag < 1:19629‑M1/144‑36 (MQ=255) tgctgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGccgcttggatcgcaggattaagcaccatgccatag > 2:19629‑M1/1‑109 (MQ=255) tgctgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGc > 6:83036/1‑149 (MQ=255) tgctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCATGCCACGCTCTGGACGATGCCTATGACAAGGATGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAgattg > 5:36937/1‑145 (MQ=255) ctgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 2:35199/147‑1 (MQ=255) tgAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGc > 2:171177/1‑148 (MQ=255) aGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCAc < 1:171177/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACtt < 2:78467/149‑1 (MQ=255) cAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGccgcttggatcgcaggattaagcaccatgccata < 8:177435‑M1/132‑35 (MQ=255) cAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGccgcttggatcgcaggattaagcaccatgccata > 7:177435‑M1/1‑98 (MQ=255) cAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 1:182971/141‑1 (MQ=255) cAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg > 2:182971/1‑141 (MQ=255) agagCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACCAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCACGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGt < 2:177934/149‑1 (MQ=255) gCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCg < 5:83036/149‑1 (MQ=255) aCCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAAc > 3:119974/1‑149 (MQ=255) aCCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAAc < 4:295731/149‑1 (MQ=255) ccAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAAcc > 5:162968/1‑149 (MQ=255) ccAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAAcc > 5:247213/1‑149 (MQ=255) cAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCg > 1:170407/1‑149 (MQ=255) cAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCg > 3:302736/1‑149 (MQ=255) cAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCg > 3:316087/1‑149 (MQ=255) aaaCTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGt < 4:286437/149‑1 (MQ=255) cggtggcgccTGCTCGACCATGCACGTCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGGTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATGCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCATCCGTGaggagg < 3:63738/142‑1 (MQ=255) ccgccTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGgttgt < 4:218913/147‑1 (MQ=255) gccTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGc < 3:91535/105‑1 (MQ=255) gccTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGc > 4:91535/1‑105 (MQ=255) gccTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTAcc > 6:191434/1‑149 (MQ=255) cTGCTCTTCCATGCATGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGATGACGCCGTCGCCTATGTCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCgg < 6:36937/149‑1 (MQ=255) cTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg < 8:224735/109‑1 (MQ=255) cTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTgg > 7:224735/1‑109 (MQ=255) cTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTc > 8:18794/1‑149 (MQ=255) tCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGAt < 8:232522/82‑1 (MQ=255) tCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGAt > 7:232522/1‑82 (MQ=255) aTGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCgg > 1:67637/1‑84 (MQ=255) aTGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCgg < 2:67637/84‑1 (MQ=255) tGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTg > 8:25213/1‑149 (MQ=255) ggCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAg < 5:191434/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGc < 6:247213/149‑1 (MQ=255) ctctGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACgg > 3:130602/1‑135 (MQ=255) ctctGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACgg < 4:130602/135‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTg > 7:223506/1‑149 (MQ=255) tGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCAACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTg > 7:219505/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGc > 1:106276/1‑149 (MQ=255) cGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGt > 3:78147/1‑149 (MQ=255) gATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTc > 1:93054/1‑149 (MQ=255) tGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTccc < 1:69395/149‑1 (MQ=255) ccTATGACAAGGCTGACGACGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATACAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGAGAGGAGGTTGTTACCTGGTCGACGTCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGACCAAg > 8:248059/1‑149 (MQ=255) tATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCa > 2:253809/1‑149 (MQ=255) tGACAAGGCTTACGACGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAATCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCAACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACTGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCAc < 3:199782/148‑1 (MQ=255) cAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACctg < 7:18794/148‑1 (MQ=255) ggCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGa > 6:331937/1‑149 (MQ=255) gCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGAt < 2:93054/149‑1 (MQ=255) gCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGAt < 4:78147/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTcc < 2:106276/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTcc > 5:124019/1‑149 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctctgcctcagcagca < 1:19629‑M2/144‑110 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctctgcctcagcagca > 2:19629‑M2/1‑35 (MQ=255) cTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATcc < 4:316087/149‑1 (MQ=255) tATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctctg > 7:177435‑M2/1‑34 (MQ=255) tATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGcatgccataggcgacggcgtcagccttgtcataggcatcggccagagcctgccgtgcatggtcgagcaggcggcagcgcagagtttggtcctgctctg < 8:177435‑M2/132‑99 (MQ=255) cATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATgg < 7:25213/149‑1 (MQ=255) | CTTGCAGCTAGCCAAGGAGGCGAATACCGCGGCGATTGCTGCTGCTGAGGCAGAGCAGGACCAAACTCTGCGCTGCCGCCTGCTCGACCATGCACGGCAGGCTCTGGCCGATGCCTATGACAAGGCTGACGCCGTCGCCTATGGCATGGTGCTTAATCCTGCGATCCAAGCGGCATGCCTGCTCAAGCTGGGCCACTTGTTCGCCAACCGTGAGGAGGTTGTTACCGGGTCGACGGCTGTCGAGCTTCCGCTGGCGTCCCAGCACCTGCTGATGCCTTTCCGCATCCGGATGG > NC_002947/1762543‑1762835 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |