New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1955565 | 67 (1.240) | 5 (0.100) | 5/250 | NT | 6.9% | coding (203/975 nt) | PP_1753 | DMT superfamily permease |
? | NC_002947 | = 1955597 | 70 (1.350) | coding (235/975 nt) | PP_1753 | DMT superfamily permease |
CTCTGGGGCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCTGGTGG > NC_002947/1955423‑1955711 | ctctGGGGCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTgg < 2:177058/148‑1 (MQ=255) gggCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGAAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATAAATCTCACCAGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCTTGCTTGCGCAAGCTGGCGcc > 4:175191/1‑147 (MQ=255) gCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGgcgc > 1:178360/1‑144 (MQ=255) gCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGgcgc < 2:178360/144‑1 (MQ=255) cATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAggg < 6:879/149‑1 (MQ=255) cGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGc < 3:1/149‑1 (MQ=255) gATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAgggg < 2:54749/141‑1 (MQ=255) gATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAgggg > 1:54749/1‑141 (MQ=255) tcaagctcaagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAccagcaccaggcccttgcccctggg > 8:299232‑M1/1‑124 (MQ=255) caagctcaagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTgg > 8:27465/1‑149 (MQ=255) agctcaagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTg > 8:135993/1‑149 (MQ=255) gctcaagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGc < 5:79804/149‑1 (MQ=255) gctcaagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGc > 7:119574/1‑149 (MQ=255) aagcAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTg < 7:27465/147‑1 (MQ=255) tACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAccagcaccaggcccttgcccctgggcgccagcttgcgcat < 6:58284‑M1/149‑41 (MQ=255) cTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAccagcaccaggcccttgcccctgggcgccagcttgcgcatg < 7:299232‑M1/148‑42 (MQ=255) gCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCg > 7:188774/1‑149 (MQ=255) aGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGcc < 1:33426/149‑1 (MQ=255) gTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGAt > 2:255352/1‑149 (MQ=255) gACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAgg > 7:227714/1‑115 (MQ=255) gACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAgg < 8:227714/115‑1 (MQ=255) gACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATggg > 1:223657/1‑149 (MQ=255) gACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATggg > 5:296005/1‑149 (MQ=255) aCCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGc < 5:227100/149‑1 (MQ=255) aCCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGACTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATggg > 1:220187/1‑148 (MQ=255) gATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTc > 7:195430/1‑133 (MQ=255) gATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTc < 8:195430/133‑1 (MQ=255) gTCACCTGGTACCGCCTGCT‑GTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGctc > 1:6877/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTGCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTa > 6:277834/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAccagcaccaggcccttgcccctgggcgccagcttgcgcatgga > 4:85681‑M1/1‑80 (MQ=255) aCCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAccagcaccaggcccttgcccctgggcgccagcttgcgcatgga < 3:85681‑M1/123‑44 (MQ=255) gTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGa < 6:296005/149‑1 (MQ=255) tACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGAt < 8:119574/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGt > 2:267652/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGtct > 8:153345/1‑149 (MQ=255) gctgGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATc > 6:281834/1‑142 (MQ=255) gctgGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATc < 5:281834/142‑1 (MQ=255) ctgGTCTCCGTCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCa > 2:141752/1‑148 (MQ=255) gTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACt > 3:204962/1‑149 (MQ=255) tctcCGGCGGCCTGGTGTTCGCCTGGCTGGGGTCTCAGCTGCGTTTGCCGTCCATTCGCAAGCTGGCGCCCAGGGTCATGTGCCTGGTTCTGGTTGCTGTGCTCGTCCTGATTGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACt < 3:175191/148‑1 (MQ=255) ctcCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGc < 7:135993/149‑1 (MQ=255) tcCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCt > 4:150817/1‑149 (MQ=255) tcCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCGGAGCGGTCTCAAACTGCt > 4:155881/1‑149 (MQ=255) cggcggCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCaa < 1:17445/141‑1 (MQ=255) cggcggCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCaa > 2:17445/1‑141 (MQ=255) cggcggCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGc < 7:153345/146‑1 (MQ=255) ggcCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCg > 2:318688/1‑130 (MQ=255) ggcCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCg < 1:318688/130‑1 (MQ=255) ctgctgTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCggg > 7:140987/1‑149 (MQ=255) gctgTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGc > 5:234640/1‑142 (MQ=255) gctgTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGc < 6:234640/142‑1 (MQ=255) gctgTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCa > 3:207197/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGctc > 2:330034/1‑111 (MQ=255) ttCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGctc < 1:330034/111‑1 (MQ=255) cGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGca < 4:207197/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGcc > 3:60140/1‑88 (MQ=255) gCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGcc < 4:60140/88‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGca > 7:208741/1‑147 (MQ=255) gCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGca < 8:208741/147‑1 (MQ=255) tggctggcGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACt > 4:90057/1‑149 (MQ=255) ctggcGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACtggt < 8:140987/149‑1 (MQ=255) gcggcTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACtggtgg < 1:141752/148‑1 (MQ=255) gcggcTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACtggtgg < 3:90057/148‑1 (MQ=255) gcggcTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACtggtg < 1:267652/147‑1 (MQ=255) gcggcTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACtggtg < 5:277834/147‑1 (MQ=255) ggcTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTa > 4:311382/1‑148 (MQ=255) aGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTa > 6:231263/1‑143 (MQ=255) aGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTa < 5:231263/143‑1 (MQ=255) cggcgTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCg > 3:96460/1‑100 (MQ=255) cggcgTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCg < 4:96460/100‑1 (MQ=255) cggcgTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCgg < 2:223657/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTg < 3:311382/148‑1 (MQ=255) tCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGttgcgcatggacggcaaacgccgctgagccgccagccaggcgaacagcaggccgccggagaccagcaggcggtaccaggt < 3:85681‑M2/123‑81 (MQ=255) tCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGttgcgcatggacggcaaacgccgctgagccgccagccaggcgaacagcaggccgccggagaccagcaggcggtaccaggt > 4:85681‑M2/1‑43 (MQ=255) cATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGttgcgcatggacggcaaacgccgctgagccgccagccaggcgaacagcaggccgccggagaccagcaggcggtaccaggtgacagtgatcgggtcgaccacttgcag < 7:299232‑M2/148‑108 (MQ=255) aTGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGttgcgcatggacggcaaacgccgctgagccgccagccaggcgaacagcaggccgccggagaccagcaggcggtaccaggtgacagtgatcgggtcgaccacttgcagta < 6:58284‑M2/149‑110 (MQ=255) gcgcAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCtgg > 5:4416/1‑149 (MQ=255) cgcAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCt < 1:9461/140‑1 (MQ=255) cgcAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCt > 2:9461/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCtgg < 2:6877/148‑1 (MQ=255) gcAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCtggtg > 6:306023/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCtggtgg < 2:220187/149‑1 (MQ=255) | CTCTGGGGCATCCTGCCGATCAAGCTCAAGCAGGTACTGCAAGTGGTCGACCCGATCACTGTCACCTGGTACCGCCTGCTGGTCTCCGGCGGCCTGCTGTTCGCCTGGCTGGCGGCTCAGCGGCGTTTGCCGTCCATGCGCAAGCTGGCGCCCAGGGGCAAGGGCCTGGTGCTGGTTGCGGTGCTCGGCCTGATGGGCAACTACGTGCTCTACCTGATCGGTCTCAAACTGCTTAGCCCGGGCACTGCACAACTGGTGGTACAGATCGGCCCGGTGCTGTTGCTGGTGG > NC_002947/1955423‑1955711 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |