New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2242860 | 53 (0.980) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.3% | coding (433/540 nt) | PP_1978 | TetR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2242892 | 56 (1.080) | coding (465/540 nt) | PP_1978 | TetR family transcriptional regulator |
CCGGGACTGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCTGAGCTGGATTCGCGG > NC_002947/2242712‑2243008 | ccGGGACTGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGC < 7:133000‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGGGACTGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGC > 6:140841‑M1/1‑149 (MQ=255) gACTGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGc < 6:337959/149‑1 (MQ=255) tGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGa > 2:289189/1‑149 (MQ=255) tGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGa > 6:20580/1‑149 (MQ=255) cGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGa < 4:40920/147‑1 (MQ=255) aGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTgg < 6:79817/149‑1 (MQ=255) tACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGcc < 2:259693/149‑1 (MQ=255) cATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATGAACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTg < 1:245646/136‑1 (MQ=255) cATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTg > 2:245646/1‑135 (MQ=255) ccGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTgg > 3:283216/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTgg > 1:224396/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGAc < 3:314521/131‑1 (MQ=255) cGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGAc > 4:314521/1‑131 (MQ=255) aaCGCGTTGGGCGAAATGCTGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGTGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTggg < 4:51756/141‑1 (MQ=255) aaCGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTCCCGGAGGTCTTACGCGAGGTGCTGGCCGACCACATCGAGTTGAAG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCAGGCCCTGATggatcgg > 3:51756/1‑136 (MQ=255) aCGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCcagccccccaaccatcagggccaggtcggccagcg < 2:59162‑M1/149‑36 (MQ=255) aCGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGgcg > 2:224396‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGgcgct < 4:329467‑M2/149‑6 (MQ=255) gTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGgctggcgctgg < 5:20580/149‑1 (MQ=255) cGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCgg‑g > 5:134566/1‑149 (MQ=255) aaTGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCt > 8:286476/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTgg > 3:39232/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCAGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTgg > 5:194149/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTggg < 8:213628/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTggg < 1:289189/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGa > 2:155992/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCa < 5:140841/149‑1 (MQ=255) ccGGAGGTCTTCCGCGCGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGt < 1:119627/147‑1 (MQ=255) gTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTc < 4:39232/149‑1 (MQ=255) tCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCt < 4:283216/149‑1 (MQ=255) cTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCgg‑gt > 2:303384/1‑125 (MQ=255) cTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCgg‑gt < 1:303384/126‑2 (MQ=255) ttCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGTGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGa > 1:193670/1‑149 (MQ=255) ttCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCcagccccccaaccatcagggccaggtcggccagcgctttgtcg < 1:65990‑M1/122‑44 (MQ=255) ttCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCcagccccccaaccatcagggccaggtcggccagcgctttgtcg > 2:65990‑M1/1‑79 (MQ=255) ccGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTCGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGT‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGAc < 1:185824/148‑1 (MQ=255) cgcgAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGAcc < 7:286476/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGGCGCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTa < 1:36451/144‑1 (MQ=255) gCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTa > 2:36451/1‑143 (MQ=255) caTCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTCttgt > 4:96524/1‑133 (MQ=255) aTCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGGCCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATc > 8:216382/1‑149 (MQ=255) aGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATcggcg > 1:272354/1‑149 (MQ=255) gatg‑aCTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGc > 3:134505/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCACCGCCGATTTGGCGgcgcgcag < 6:134566/149‑5 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCGTGATGGTTGGGGGGCTGGCGGTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGAc < 3:27667/103‑1 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAAc > 7:7226/1‑149 (MQ=255) ccGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAAccc > 6:197204/1‑149 (MQ=255) cgATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATcggc > 4:63027/1‑133 (MQ=255) cgATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATcggc < 3:63027/133‑1 (MQ=255) gATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGa < 7:216382/149‑1 (MQ=255) tCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATg > 1:330763/1‑149 (MQ=255) gACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACATGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACAGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCATGGAGCATGGc > 4:270063/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGa < 3:202024/88‑1 (MQ=255) aCCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGa > 4:202024/1‑88 (MQ=255) cGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGAt < 5:197204/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGAt < 4:134505/149‑1 (MQ=255) cccTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGa > 2:219218/1‑149 (MQ=255) gATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTa < 2:341451/91‑1 (MQ=255) gATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCt < 1:219218/149‑1 (MQ=255) tGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCTg < 2:330763/148‑1 (MQ=255) ccGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACAGTATTCTGCGCGCCGCCAAAACGGCCGTGCTTTAACCCTGGAGCAAGGCGATGACAACCCTGAGc > 4:235442/1‑149 (MQ=255) cGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGgcgctttgtcggcatcctcagggcggtcgaccatcgcggcagtcatcaactcgatgtgctcggccagcacctcgcggaa < 1:65990‑M2/122‑80 (MQ=255) cGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGgcgctttgtcggcatcctcagggcggtcgaccatcgcggcagtcatcaactcgatgtgctcggccagcacctcgcggaa > 2:65990‑M2/1‑43 (MQ=255) aCAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGTTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCAGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACATGTCTGCCCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCATTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTAACCGGAGCTg > 8:299669/1‑148 (MQ=255) aGCGCcagccccccaaccatcagggccaggtcggccagcgctttgtcggcatcctcagggcggtcgaccatcgcggcagtcatcaactcgatgtgctcggccagcacctcgcggaagacctccggcaggcgctgcatttcgcccaacgc < 4:329467‑M1/149‑145 (MQ=255) cgccagccccccaaccatcagggccaggtcggccagcgctttgtcggcatcctcagggcggtcgaccatcgcggcagtcatcaactcgatgtgctcggccagcacctcgcggaagacctccggcaggcgctgcatttcgcccaacgcgt > 2:224396‑M1/1‑3 (MQ=255) cgcTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGgcgctttgtcggcatcctcagggcggtcgaccatcgcggcagtcatcaactcgatgtgctcggccagcacctcgcggaagacctccggcaggcgctgcatttcgcccaacgcgt < 2:59162‑M2/149‑115 (MQ=255) cgcTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCTGAGCTGGATTcgc > 2:56520/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCTGAGCTGGATTCGCgg < 2:193670/149‑1 (MQ=255) | CCGGGACTGCGAAGTACATGCTTGCCCGCTGCCTAACGCGTTGGGCGAAATGCAGCGCCTGCCGGAGGTCTTCCGCGAGGTGCTGGCCGAGCACATCGAGTTGATG‑ACTGCCGCGATGGTCGACCGCCCTGAGGATGCCGACAAAGCGCTGGCCGACCTGGCCCTGATGGTTGGGGGGCTGGCGCTGGCCCGG‑GCCTTGGGGACCAGTGACCTGTCTGACCGTATTCTGCGCGCCGCCAAATCGGCGGTGCTTTAACCCTGGAGCATGGCGATGACTACCCTGAGCTGGATTCGCGG > NC_002947/2242712‑2243008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |