New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2338988 = | 45 (0.830) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.6% | coding (781/1080 nt) | PP_2055 | isomerase |
? | NC_002947 | 2339036 = | 42 (0.810) | coding (829/1080 nt) | PP_2055 | isomerase |
GAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGGCGCGCAGCAACTGG > NC_002947/2338841‑2339129 | gcgcgtcagcgcaacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaagg < 6:226695‑M1/2‑1 (MQ=255) gAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACgg < 5:144358/149‑1 (MQ=255) cgcgtcagcgcaacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaagg > 8:200470‑M1/147‑148 (MQ=255) cgcgtcagcgcaacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaagg > 6:315952‑M1/147‑148 (MQ=255) cgtcagcgcaacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCAc > 7:235437‑M1/145‑149 (MQ=255) cccAGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGc > 3:266987/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCt < 8:176363/149‑1 (MQ=255) ggCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGc < 2:104559/149‑1 (MQ=255) aacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCAc > 5:168709‑M1/136‑140 (MQ=255) aacatcgatgccgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCAc < 6:168709‑M1/5‑1 (MQ=255) gCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTc < 3:202536/149‑1 (MQ=255) cTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCg > 1:145852/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTc < 2:145852/149‑1 (MQ=255) cgccacttgggtgctccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCa < 5:170262‑M1/25‑1 (MQ=255) cAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCa > 3:58673/1‑149 (MQ=255) cAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCa > 2:219226/1‑149 (MQ=255) cAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCa > 5:226695/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATg < 1:219226/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTacgacg > 4:114460/1‑121 (MQ=255) aGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTacgacg < 3:114460/121‑1 (MQ=255) gctgctCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGcac > 3:313/1‑148 (MQ=255) tccaggcggacctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGc < 4:143319‑M1/39‑1 (MQ=255) tCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGc < 4:58673/149‑1 (MQ=255) gAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCa > 5:16279/1‑149 (MQ=255) cTGGATGCGTTGGGGCTGTAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTTGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGca < 8:162668/134‑1 (MQ=255) cTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGca > 7:162668/1‑134 (MQ=255) cTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGATACGACGGCACGCTGAAGGTTCGATATTTCATGCCGca > 7:158156/1‑134 (MQ=255) cctgggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCt > 6:170262‑M1/101‑149 (MQ=255) aGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATTGGGCTTGGCGATGTGAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTgg < 6:244342/149‑1 (MQ=255) ggccagttgctgcgcgccttcgcccaacaggtcggcaatcacggtgccagggctgacgcaggcagtcgccagccccaccgctccagtgatcgccaaGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGc > 3:143319‑M1/97‑149 (MQ=255) ggCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACt > 6:233465/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTg > 7:179376/1‑147 (MQ=255) ggCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCgg > 6:150566/1‑149 (MQ=255) gAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTgggg < 5:150566/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCgg < 5:271071/131‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTAATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCgg > 6:271071/1‑131 (MQ=255) ggCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGActgcctgc < 4:289944/147‑1 (MQ=255) ggCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGt < 8:179376/149‑1 (MQ=255) tGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGcc < 4:258921/149‑1 (MQ=255) cAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTg > 8:154158/1‑149 (MQ=255) ggCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCAc > 3:123277/1‑149 (MQ=255) gCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCAcc > 8:205901/1‑149 (MQ=255) aTCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTg < 6:16340/148‑1 (MQ=255) aTCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGc > 4:200335/1‑149 (MQ=255) tCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGcc < 4:266987/149‑1 (MQ=255) ccccAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTg > 7:311050/1‑146 (MQ=255) ccccAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTg < 8:311050/146‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGAc < 4:123277/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGt < 5:233465/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGtt < 4:313/148‑1 (MQ=255) tCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTggg > 3:88524/1‑140 (MQ=255) tCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTggg < 4:88524/140‑1 (MQ=255) tCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGgcgc > 5:266072/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTgggg < 4:193630/88‑1 (MQ=255) cAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGgcgcg > 3:126868/1‑148 (MQ=255) aaGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGATCGCTATTTCATGCCGCACAACTCCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGGCGCgca > 5:276221/1‑149 (MQ=255) aGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGGCGCgcag > 5:34852/1‑149 (MQ=255) cTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGGCGCGCAGCAACTgg < 7:154158/149‑1 (MQ=255) | GAAACCCCGGCTCAGCTGGACGCCAACAGCGCGCTGCTCGAACGCCTGGAAGCGTTGCGGCTGAAGGCCGGAAAGGCCATGGGCCTGGGCGATGTCAGTGGCATGGTCATCCCCAAGCCAGTGCTGGTGTCCAAGCCGCGCTACGACGGCACGCTGCAGGTTCGCTATTTCATGCCGCACAACTGCCATCGTGCCTTGGCGATCACTGGAGCGGTGGGGCTGGCGACTGCCTGCGTCAGCCCTGGCACCGTGATTGCCGACCTGTTGGGCGAAGGCGCGCAGCAACTGG > NC_002947/2338841‑2339129 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |