New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2404685 = | 29 (0.540) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 13.1% | coding (30/240 nt) | PP_2107 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2404717 = | 39 (0.760) | coding (62/240 nt) | PP_2107 | hypothetical protein |
GCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCTGTG > NC_002947/2404538‑2404830 | gcgGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCAccc > 1:2473/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGc > 5:147800/1‑149 (MQ=255) aCCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTg < 2:94948/149‑1 (MQ=255) cGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCACCCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGc > 2:96099/1‑148 (MQ=255) ggcgccgttgtcacagcgccgcagcacggtaattagcagcacttaacgctcgaacaaaggctcgctctcggcgatgtcgaccagctctaccagcaggccatgatcgaccagaggcatcaacacagCCTCGGC‑‑‑CACCTCTGCGAAGTGGc > 1:287444‑M1/126‑149 (MQ=255) ccgttgtcacagcgccgcagcaccggaatgatcaggccataacgctcgaacaaaggctcgctctcggcgatgtcgaccagctctaccagcaggccatgatcgaccagaggcatcaacacagCCTCGGC‑‑‑CACCTCTGCGAAGTGGCCGAg > 3:311393‑M1/122‑149 (MQ=255) cagGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTgtgt > 1:306900/1‑149 (MQ=255) ccgcagcaccggaatgatcaggccataacgctcgaacaaaggctcgctctcggcgatgtcgaccagctctaccagcaggccatgatcgaccagaggcatcaacacagCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGAt > 4:76867‑M1/108‑149 (MQ=255) aTTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGAt < 2:93598/149‑1 (MQ=255) aTTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGAt > 6:311613/1‑149 (MQ=255) gAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGc < 2:2473/148‑1 (MQ=255) gCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCctc > 4:181100/1‑149 (MQ=255) aggtGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGa < 5:311613/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTgg > 4:145740/1‑149 (MQ=255) acgctcgaacaaaggctcgctctcggcgatgtcgaccagctctaccagcaggccatgatcgaccagaggcatcaacacagCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTgg > 3:320882‑M1/81‑130 (MQ=255) acgctcgaacaaaggctcgctctcggcgatgtcgaccagctctaccagcaggccatgatcgaccagaggcatcaacacagCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTgg < 4:320882‑M1/50‑1 (MQ=255) tataaTAGGCTTCTGTGTATGCCAACGCGGTACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCct < 6:182093/129‑1 (MQ=255) tAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTTCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGACACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGCCct > 5:182093/1‑132 (MQ=255) aGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGa > 8:298268/1‑149 (MQ=255) ttCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGAt > 4:300910/1‑101 (MQ=255) ttCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGcc > 1:190927/1‑147 (MQ=255) cTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCga < 6:147800/147‑1 (MQ=255) cccGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGtt < 2:41011/149‑1 (MQ=255) gctgcCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGa > 5:172266/1‑149 (MQ=255) gctgcCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGa > 8:113951/1‑149 (MQ=255) gcCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCa > 5:248931/1‑149 (MQ=255) tGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTc > 2:93326/1‑149 (MQ=255) aaTGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTcc < 7:298268/148‑1 (MQ=255) gTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGTCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGtg > 7:214903/1‑149 (MQ=255) gTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTgg > 6:222410/1‑66 (MQ=255) aaCTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAgagggagc < 8:32320/111‑1 (MQ=255) aaCTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAgagcgagc > 7:32320/1‑111 (MQ=255) aaCTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGtgctg > 7:242054/1‑149 (MQ=255) ttCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTgcggcg > 4:129322/1‑149 (MQ=255) cGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCt > 5:293006/1‑149 (MQ=255) ggCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGGTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCtg > 1:255416/1‑149 (MQ=255) gCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCtgt > 3:79236/1‑149 (MQ=255) cACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCtgtg < 6:172266/149‑1 (MQ=255) cACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCtgtg < 6:248931/149‑1 (MQ=255) | GCGGACCTGTCGCTGCACCGGATCGGTGCTACCAGCCAGGATTGAGCCAGGTCAGGTGCAGGGTGGGCGTGGCGCGCCTAGAATAGGCTTCTGTGTATGCCAACCCGGGACCTGCCACATGCTGCCTGAATGTCAACTGTTCGGCACCCTCGGCTGCCACCTCTGCGAAGTGGCCGAGGCTGTGTTGATGCCTCTGGTCGATCATGGCCTGCTGGTAGAGCTGGTCGACATCGCCGAGAGCGAGCCTTTGTTCGAGCGTTATGGCCTGATCATTCCGGTGCTGCGGCGCTGTG > NC_002947/2404538‑2404830 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |