New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2417322 = | 41 (0.760) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.7% | coding (357/1764 nt) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 2417357 = | 45 (0.870) | coding (392/1764 nt) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
TGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCACCA > NC_002947/2417174‑2417470 | tGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAAc < 8:125599/149‑1 (MQ=255) aacaccagcggcagcgttaccaccacgatgctggtgagcttggggttggtgatgaacagcaataccacaccgccaatgaccatcagcgcgttgcgcaggaacatcgacagcgatgaaccgatcactgattgcagcaaggtggtgtCCg < 6:7832‑M1/3‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCg > 8:222023/1‑147 (MQ=255) ccTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAACTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCg > 5:204399/1‑147 (MQ=255) gctgctgGTGCTGTCGCTGGCGGTGGGTACCTTGACCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGTTTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATGCGTCGTGCGGTCTTCTATCACCTGATCGGCCTGCACCGAGGTTTTTTCGAGGAGAACCg < 8:309990/144‑1 (MQ=255) gctgctgGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCg > 7:309990/1‑144 (MQ=255) ctggtgctggCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCTAGGACAACCGCAG‑CT‑CCga < 6:36094/149‑1 (MQ=255) tgctggCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATc < 5:118707/149‑1 (MQ=255) ctggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCg < 7:41435/149‑1 (MQ=255) gTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGAc > 1:336169/1‑149 (MQ=255) gctggtgagcttggggttggtgatgaacagcaataccacaccgccaatgaccatcagcgcgttgcgcaggaacatcgtcagcgatgaaccgatcactgattgcagcaaggtggtgtCCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGc < 1:248007‑M1/33‑1 (MQ=255) gtgagcttggggttggtgatgaacagcaataccacaccgccaatgaccatcagcgcgttgcgcaggaacatcgtcagcgatgaaccgatcactgattgcagcaaggtggtgtCCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGa > 2:248007‑M1/113‑148 (MQ=255) ccTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGc > 2:21781/1‑116 (MQ=255) ccTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGc < 1:21781/116‑1 (MQ=255) ccTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGa < 2:336169/148‑1 (MQ=255) ccTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGa < 3:85279/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGacac < 3:30336/147‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGAcaccac > 8:118419/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGATGACAACCGCAG‑CT‑CCga < 7:146587/118‑1 (MQ=255) gCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCga > 8:146587/1‑118 (MQ=255) tCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAAcc < 6:138966/98‑1 (MQ=255) tCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAAcc > 5:138966/1‑98 (MQ=255) ggTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑Ca > 1:109021/1‑111 (MQ=255) ggTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑Ca < 2:109021/111‑1 (MQ=255) gTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCg > 7:253892/1‑149 (MQ=255) gTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCg > 6:279681/1‑149 (MQ=255) gATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGt < 2:16045/148‑1 (MQ=255) gATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTATTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGtt > 8:24594/1‑149 (MQ=255) ggCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCAt < 5:178380/148‑1 (MQ=255) gCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATc < 7:222023/148‑1 (MQ=255) gCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGAAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGTCACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCg > 5:166792/1‑149 (MQ=255) ccGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTc < 2:322711/130‑1 (MQ=255) ccGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTc > 1:322711/1‑130 (MQ=255) cGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTgc < 7:118419/149‑1 (MQ=255) tCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAAc < 5:279681/149‑1 (MQ=255) cgtcgtGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAAcgc > 7:141998/1‑149 (MQ=255) gTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGt > 4:186866/1‑149 (MQ=255) ttCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCAt > 6:280656/1‑149 (MQ=255) tCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCAtt > 1:297219/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGtgtg < 6:204399/147‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGtgtg < 8:253892/147‑1 (MQ=255) accgatcactgattgcagcaaggtggtgtCCGCAGTCAGCCGAGACT‑GGATCTCGGA‑G‑CTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTa < 5:186464‑M1/118‑1 (MQ=255) accgatcactgattgcagcaaggtggtgtCCGCAGTCAGCCGAGACT‑GGATCTCGGA‑G‑CTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTa > 6:186464‑M1/30‑147 (MQ=255) gCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATCGCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTAtt > 1:71190/1‑149 (MQ=255) cTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCg < 6:54744/136‑1 (MQ=255) cTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCg > 5:54744/1‑136 (MQ=255) cTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTAt > 4:205984/1‑145 (MQ=255) cTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTAt < 3:205984/145‑1 (MQ=255) aCCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTtc < 8:141998/149‑1 (MQ=255) ccAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATc > 5:214502/1‑89 (MQ=255) ccAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATc < 6:214502/89‑1 (MQ=255) ccAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTtcat > 2:106640/1‑149 (MQ=255) aGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCgg > 2:197037/1‑129 (MQ=255) aGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCgg < 1:197037/129‑1 (MQ=255) gAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCa < 7:24594/148‑1 (MQ=255) aaCCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCAc > 6:68530/1‑149 (MQ=255) aaCCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCAc > 6:102844/1‑149 (MQ=255) aaCCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCAc < 2:297219/149‑1 (MQ=255) CCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCACCa > 3:186866‑M1/1‑149 (MQ=255) | TGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTGGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAG‑CT‑CCGAGATC‑CAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTGTGGTATTGCTGTTCATCACCAACCCCAAGCTCACCA > NC_002947/2417174‑2417470 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |