New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2729599 = | 34 (0.630) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 11.0% | coding (46/1044 nt) | PP_2392 | MFS transporter |
? | NC_002947 | 2729650 = | 33 (0.650) | coding (97/1044 nt) | PP_2392 | MFS transporter |
CTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCAACACGCTGACCCTGGTGCT > NC_002947/2729456‑2729747 | cTGGCGCAGCGGCCAGGTTTTCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCtt < 2:213013/148‑1 (MQ=255) tcaggccccatgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTgg > 3:282764‑M1/143‑149 (MQ=255) gcgcAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGc < 8:939/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGc < 8:266731/149‑1 (MQ=255) aggccccatgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTggg > 5:239644‑M1/141‑148 (MQ=255) gccccatgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGc > 4:152240‑M1/139‑140 (MQ=255) gccccatgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGc < 3:152240‑M1/2‑1 (MQ=255) atgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTgg > 4:237219‑M1/134‑140 (MQ=255) atgccaggccggccgcagcccccgtgaaaaagcgcagcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTgg < 3:237219‑M1/7‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGa > 2:3528/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACAGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGa < 1:3528/149‑1 (MQ=255) aGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGAc > 1:169935/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCg > 1:179077/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGt > 2:28359/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGtt < 3:2200/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTg < 7:225742/148‑1 (MQ=255) cTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGGTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACg < 1:28359/148‑1 (MQ=255) cTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGt < 2:169935/149‑1 (MQ=255) agcaccagggtcagcgtgttggagttcgacaaggccgtcagcccgttgaacagcacgaagccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGc > 1:260536‑M1/99‑149 (MQ=255) aaTGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTg > 3:126685/1‑149 (MQ=255) caccaggggcagcgtgttggagtgcgtcaaggccgtcagcccgttgaacagcacgatgccgatgatcgctagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTGGGCTCGTTACTGCCCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTg > 4:38356‑M1/97‑149 (MQ=255) gTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTg > 2:25944/1‑149 (MQ=255) tCTGCTCGACCAGATAGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTgg > 5:226351/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGATCGCCGATGGCTTGCACATCAGCCAGGCCATGGGTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATCCCTTGGGCTCGTTTCTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGCCCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGGTGTTGCTGGCGat > 1:342276/1‑148 (MQ=255) gATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGt > 5:278500/1‑89 (MQ=255) gATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGt < 6:278500/89‑1 (MQ=255) gCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGt < 6:36555/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGt > 5:36555/1‑149 (MQ=255) cGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGc < 2:179077/149‑1 (MQ=255) gggCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGt < 6:226351/148‑1 (MQ=255) gCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACg > 4:124167/1‑149 (MQ=255) cacaTCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGGTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACg < 1:25944/148‑1 (MQ=255) ccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCt > 4:287856‑M1/39‑90 (MQ=255) ccgatgatcgccagcaacagcgcccggcgccgataccaGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCt < 3:287856‑M1/52‑1 (MQ=255) cAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGc < 4:126685/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCtt > 1:264533/1‑149 (MQ=255) cATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGACTTGt > 5:14520/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTc > 8:110063/1‑149 (MQ=255) tcagCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTCACCGCCATCCCGATGGTGACGATGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTCTTGCTGGAGATCAAAGCCTTACTGCAGATCAACGGGCTGACGGCCTTGTCCAAca > 8:93874/4‑148 (MQ=255) gCAATGGGTCAC‑GGAGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTcc > 7:293172/1‑148 (MQ=255) cAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCaa > 5:259663/1‑149 (MQ=255) aaTGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCaa > 1:159379/1‑148 (MQ=255) gggTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCAACACg > 4:223995/1‑149 (MQ=255) ggTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCAACACGc < 6:259663/149‑1 (MQ=255) gTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAGCTCCAACACGCt > 8:50506/1‑149 (MQ=255) GCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCAACACGCTGACCCTGGtgct < 4:217901‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCAGGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAC‑GGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCATCGGCTTCGTGCTGTTCAACGGGCTGACGGCCTTGTCGAACTCCAACACGCTGACCCTGGTGCT > NC_002947/2729456‑2729747 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |